Amplicon-Screening of exonic DNA regions in exon-wide mutant cell libraries of mutant TP53 (Exons 5, 6, 7, 8) in HCT116 cells generated via CRISPR editing

·发布 2024年10月16日

样本数

实验数

实验描述

To compare the impact of TP53 mutant variants in exon-wide mutant cell libraries, comprehensive mutome libraries of TP53 affecting the Exons 5, 6, 7 and 8 were generated systematically by CRISP/Cas9 editing in HCT116 colorectal carcinoma cells.

样本属性

Organism

Homo sapiens

Developmental stage

adult

Disease

colorectal cancer

Organism part

colorectum

Cell line

HCT116

Genotype

TP53 Δ/LSL

Genetic modification

targeted mutation of exon 8, targeted mutation of exon 5, targeted mutation of exon 6, targeted mutation of exon 7

实验信息

登记号

E-MTAB-12857

实验类型

DNA-seq

物种

Homo sapiens, Homo sapiens

发布日期

2024年10月16日

提交者

Marco Mernberger、 Julianne Funk、 Maria Klimovich、 Evangelos Pavlakis、 Michelle Neumann、 Daniel Drangenstein、 Maxim Noeparast、 Pascal Hunold、 Anna Borowek、 Dimitrios-Ilias Balourdas、 Katharina Kochhan、 Nastasja Merle、 Michael Wanzel、 Sabrina Elmshäuser、 Andrea Nist、 Marek Bartkuhn、 Katharina Humpert、 Rajkumar Savai、 Andreas Joerger、 Thorsten Stiewe

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