iPSC RNA-seq upon CRISPRn or CRISPRi manipulation

·发布 2016年1月19日 ·更新 2016年1月23日

样本数

实验数

实验描述

Assess the on- and off-target effects of dox-inducible CRISPR/Cas9 and CRISPRi constructs in a human iPS cell line. Transcript quantification of 3 cell lines, each plus or minus doxycycline and with or without specific single guide RNAs (sgRNAs), with 2 biological replicates each.

样本属性

cell line

WTC-CRISPRi, WTC-CRISPRn, WTC11

doxycycline treatment

+, -

organism

Homo sapiens

provider

Coriell Cell Repositories http://ccr.coriell.org/Sections/Search/Search.aspx?PgId=165&q=GM25256

sgrna

None, sgGCaMP

实验信息

登记号

E-GEOD-76980

GEO 编号

GSE76980, SRP067928

实验类型

RNA-seq of coding RNA

物种

Homo sapiens

发布日期

2016年1月19日

更新日期

2016年1月23日

提交者

Yuichiro Miyaoka、 Ekaterina Balandina、 Soren P Sheikh、 Edward Shin、 Tilde V Eskildsen、 David E Gordon、 Amanda H Chan、 Mohammad A Mandegar、 Jonathan S Weissman、 Lei S Qi、 Po-Lin So、 Bruce R Conklin、 Kristin Holmes、 Nathaniel Huebsch、 Luke A Gilbert、 Annie Truong、 Jacqueline E Villalta、 Nevan J Krogan、 Max A Horlbeck、 Luke M Judge、 C I Spencer、 Michael P Olvera、 Max A Horlbeck

外部链接

ArrayExpress 原始页 NCBI GEO：GSE76980, SRP067928

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iPSC RNA-seq upon CRISPRn or CRISPRi manipulation

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