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E-GEOD-73430 SRP064186, GSE73430 RNA-seq of coding RNA Xenopus laevis

Developmental gene expression of Xenopus laevis J strain [stage]

·发布 2016年10月24日 ·更新 2016年10月25日
28
样本数
28
实验数
1
相关文献
实验描述

Comprehensive RNA-seq experiments to measure the expression of homoeologs across different developmental stages, as a part of the Xenopus laevis genome project. This work is funded by Agency Japanese Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT; "Genome Science" Grant ID 221S0002). Collect mRNA from whole embryos; two clutches were used (Taira dataset for one pair, Ueno dataset for the other pair)

参考文献
Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis.
Session AM, Uno Y, Kwon T, Chapman JA, Toyoda A, Takahashi S, Fukui A, Hikosaka A, Suzuki A, Kondo M, van Heeringen SJ, Quigley I, Heinz S, Ogino H, Ochi H, Hellsten U, Lyons JB, Simakov O, Putnam N, Stites J, Kuroki Y, Tanaka T, Michiue T, Watanabe M, Bogdanovic O, Lister R, Georgiou G, Paranjpe SS, van Kruijsbergen I, Shu S, Carlson J, Kinoshita T, Ohta Y, Mawaribuchi S, Jenkins J, Grimwood J, Schmutz J, Mitros T, Mozaffari SV, Suzuki Y, Haramoto Y, Yamamoto TS, Takagi C, Heald R, Miller K, Haudenschild C, Kitzman J, Nakayama T, Izutsu Y, Robert J, Fortriede J, Burns K, Lotay V, Karimi K, Yasuoka Y, Dichmann DS, Flajnik MF, Houston DW, Shendure J, DuPasquier L, Vize PD, Zorn AM, Ito M, Marcotte EM, Wallingford JB, Ito Y, Asashima M, Ueno N, Matsuda Y, Veenstra GJ, Fujiyama A, Harland RM, Taira M, Rokhsar DS
PMID: 27762356
样本属性
clutch
Taira, Ueno
developmental stage
NF stage 08, NF stage 09, NF stage 10, NF stage 10.5, NF stage 12, NF stage 15, NF stage 20, NF stage 25, NF stage 30, NF stage 35, NF stage 40, oocyte stage 1-2, oocyte stage 3-4, oocyte stage 5-6, unfertilized egg
organism
Xenopus laevis
strain
J-strain
实验信息
登记号
E-GEOD-73430
GEO 编号
SRP064186, GSE73430
实验类型
RNA-seq of coding RNA
物种
Xenopus laevis
发布日期
2016年10月24日
更新日期
2016年10月25日
提交者
Taejoon Kwon、 Naoto Ueno、 Atsushi Toyoda、 Masanori Taira、 Shuji Takahashi、 Yutaka Suzuki、 Taejoon Kwon
分析服务
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