PGK2(phosphoglycerate kinase 2) 转至新版数据库

基因基本信息

基因基本信息

基因简称(symbol)
    [HGNC]     [GeneCards]     [NCBI]
基因种类(locus group)
同源简称(alias symbol)
基因家族代码(gene_family_id)
    [HGNC]     [GenScript]
omim代码
entrez码
    [Vega]
vega基因码
ensembl基因码
    [Ensembl]
基因家族(gene family)
refseq数据库代号

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基因种类(locus_type)
基因名称状态(status)
location_sortable
同源基因名称(alias name)
基因名称批准使用时间(date_approved_reserved)
基因简称更名时间(date_symbol_changed)
基因名称更名时间(date_name_changed)
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更新时间(date modified)
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mirbase
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基因曾用名称(prev name)
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cosmic
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bioparadigms slc
orphanet
假基因信息(pseudogeneorg)
horde id
merops
imgt
iuphar
kznf基因类别
mamit-trnadb
cd
LncRNA数据库
酶代码
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收起

基因染色体位置

基因染色体位置

6p12.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene is intronless, arose via retrotransposition of the phosphoglycerate kinase 1 gene, and is expressed specifically in the testis. Initially assumed to be a pseudogene, the encoded protein is actually a functional phosphoglycerate kinase that catalyzes the reversible conversion of 1,3-bisphosphoglycerate to 3-phosphoglycerate, during the Embden-Meyerhof-Parnas pathway of glycolysis, in the later stages of spermatogenesis.[provided by RefSeq, May 2010]

[中文简述(自动翻译):]  该基因内含子，通过磷酸甘油酸激酶1基因的反转录产生的，并且是在睾丸特异性表达。最初假定为假??基因，所编码的蛋白质实际上是一个功能性磷酸甘油酸激酶，其催化1,3-bisphosphoglycerate的3-磷酸甘油酸的可逆转换，糖酵解Embden-迈耶霍夫-帕尔纳斯通路中，在精子发生的后期阶段。 [由RefSeq的，2010年5月提供]

OMIM数据库中对PGK2基因的介绍     Wikipedia数据库中对PGK2基因的介绍

基因序列

基因序列

PGK2基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

PGK2基因的碱基突变：           显示全部snp
rs686612       rs2840223       rs9473658       rs11758714       rs28372929       rs28372930       rs35008434       rs35941002       rs41273702       rs72875753       rs75985449       rs79424609       rs114365007       rs114632133       rs115300621       rs115498448       rs116147250       rs137962561       rs139041045       rs140075530       rs140475255       rs140642109       rs140705328       rs140960775       rs141226697       rs141623265       rs142237772       rs142594452       rs143418445       rs143619342       rs143783188       rs144098095       rs144580625       rs144584193       rs144977238       rs145382583       rs146782810      
rs147140024       rs148144531       rs148374544       rs148694207       rs149185799       rs149194608       rs150489053       rs151215524       rs181514511       rs181906157       rs182212991       rs182692540       rs183504816       rs183720406       rs185108266       rs185374279       rs185381664       rs186619934       rs186743372       rs187104683       rs187805174       rs188476597       rs188661956       rs189551127       rs190974203       rs191081304       rs191761600       rs192315260       rs192472722       rs192807867       rs192939731       rs193269491       rs199548788       rs199596449       rs199822863       rs199952447       rs200172498       rs200196486       rs200263127       rs200356678       rs200462065       rs201084314       rs201278163       rs201489674       rs201510519       rs201535868       rs201912418       rs202057550       rs202129542       rs202168239       rs367684513       rs368235432       rs368963439       rs371435495       rs371825744       rs371847431       rs372554221       rs372974568       rs373042304       rs373420238       rs374682715       rs375933305       rs376417475       rs377284913       rs527861383       rs528192627       rs528269956       rs529669944       rs532024822       rs532077202       rs535758985       rs536642095       rs537700574       rs538013429       rs538234570       rs539626469       rs539689076       rs539769229       rs539845017       rs541187512       rs542116355       rs542531069       rs543430529       rs543924931       rs544319125       rs545349777       rs545418664       rs546049695       rs546263730       rs547348766       rs549102825       rs549623919       rs549769838       rs550223542       rs551601662       rs552379127       rs552704544       rs553481302       rs553552803       rs554616800       rs555139740       rs557407909       rs557577912       rs557924191       rs558068720       rs561222878       rs562365264       rs564293391       rs564688916       rs565893503       rs567791742       rs569887019       rs570200595       rs570804051       rs570941167       rs572408515       rs572935257       rs572996121       rs574049850       rs574143142       rs575458603       rs576138335       rs576266165       rs578095348       rs578147872       rs745526510       rs745765830       rs745942367       rs746005836       rs746121075       rs746408780       rs746556167       rs746884249       rs747215075       rs747268225       rs747287546       rs747519956       rs747670363       rs747807308       rs747879519       rs748370055       rs748423631       rs748518294       rs748747936       rs748979046       rs749148984       rs749442894       rs749593590       rs749773367       rs749821598       rs749893171       rs750122364       rs750358376       rs750413518       rs750641042       rs750660594       rs750928418       rs751006307       rs751234582       rs751537803       rs751538516       rs751596092       rs751955917       rs751994592       rs752029689       rs752394630       rs752574287       rs752651158       rs752751679       rs752884151       rs753247513       rs753310289       rs753415567       rs753580221       rs753831879       rs754104374       rs754301345       rs754587039       rs754914944       rs755091238       rs755149321       rs755451283       rs755765158       rs756284751       rs756369568       rs756519549       rs757119246       rs757152155       rs757229455       rs757402526       rs757434404       rs757655601       rs758354741       rs758371577       rs758373597       rs758731859       rs758878301       rs759104371       rs759198462       rs759304137       rs759806725       rs759933654       rs760193191       rs760203253       rs760232499       rs760538541       rs760635624       rs761327233       rs761481873       rs761556182       rs762039359       rs762297069       rs762388996       rs762673991       rs762999002       rs763089568       rs763186365       rs763586767       rs763676554       rs763977535       rs764681897       rs765106365       rs765114201       rs765154147       rs765159551       rs765270778       rs765515501       rs765785546       rs765947231       rs766246242       rs766299030       rs766484253       rs767034775       rs767297908       rs767611953       rs767665164       rs767959289       rs768014478       rs768077065       rs768181677       rs768439217       rs768935774       rs769088283       rs769343937       rs769426352       rs769514457       rs769887264       rs770067055       rs770136967       rs770143471       rs770242126       rs770551125       rs770639068       rs770726498       rs770910126       rs771088390       rs771269272       rs771588271       rs771691429       rs771807431       rs772243150       rs772247144       rs772276373       rs772350179       rs772798273       rs773039741       rs773074716       rs773303661       rs773398615       rs773628964       rs773748885       rs773809786       rs774202054       rs774299538       rs774670523       rs774900961       rs775075367       rs775325509       rs775665497       rs775845168       rs775953760       rs775967199       rs775979768       rs776198787       rs776222096       rs776539984       rs776820903       rs777150729       rs777404340       rs777427058       rs777833062       rs778062100       rs778202087       rs778541738       rs778772605       rs778806231       rs778964123       rs779063149       rs779134697       rs779203149       rs779256225       rs779290554       rs779729713       rs779827380       rs779911071       rs780200740       rs780236321       rs780287346       rs780289562       rs780445495       rs780467330       rs780494411       rs780581991       rs780717653       rs780971487       rs781109448       rs781333531       rs781538885       rs781630880      

基因表达

基因表达

PGK2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
ATTGTGAAAGCCACTTCCA
57
AAGTAGCAGTGTCTCCACC
59
CAAGCATCAAGTACTGCCT
57
CCTAGATGACTCATAAGAACTACTG
58
TGTAGCATCTGGCATATCTCC
59
CTTGTTGCTCTCAGGACCA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PGK2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

PGK2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004618
P07205(UniProtKB)
ISS
GO:0004618
P07205(UniProtKB)
NAS
GO:0005524
P07205(UniProtKB)
ISS
GO:0005634
P07205(UniProtKB)
IDA
GO:0005737
P07205(UniProtKB)
IEA
GO:0006096
P07205(UniProtKB)
IEA
GO:0006096
P07205(UniProtKB)
NAS
GO:0016310
P07205(UniProtKB)
ISS
GO:0016310
P07205(UniProtKB)
NAS
GO:0030317
P07205(UniProtKB)
IEA
GO:0035686
P07205(UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P07205(UniProtKB)
IDA
GO:0098779
P07205(UniProtKB)
IGI

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控PGK2基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关文献

基因相关文献

基因相关服务

基因相关服务

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