TRIM36 (tripartite motif containing 36)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TRIM36
locus group:
protein-coding gene
location:
5q22.3
gene_family:
Ring finger proteins|Tripartite motif-containing|Fibronectin type III domain containing
alias symbol:
RBCC728|RNF98|HAPRIN
alias name:
zinc-binding protein Rbcc728|tripa…
entrez id:
55521
ensembl gene id:
ENSG00000152503
ucsc gene id:
uc003kqs.4
refseq accession:
NM_018700
hgnc_id:
HGNC:16280
approved reserved:
2001-11-21

基因染色体位置

基因染色体位置

5q22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TRIM36（Tripartite Motif-Containing 36）属于TRIM基因家族，该家族成员均含有三个保守的结构域：RING（具有E3泛素连接酶活性）、B-box（参与蛋白质相互作用）和卷曲螺旋结构域（介导多聚化）。TRIM36主要定位于细胞质和中心体，在细胞周期调控、中心体功能维持和基因组稳定性中发挥关键作用。其表达产物通过泛素-蛋白酶体系统调控靶蛋白降解，例如参与调控CEP70等中心体蛋白的稳定性，从而影响纺锤体组装和染色体分离。TRIM36的突变可能导致中心体异常、非整倍体（染色体数目异常）和细胞分裂缺陷，与男性不育（如精子发生障碍）和癌症（如肝癌和前列腺癌）密切相关。研究发现TRIM36在多种肿瘤中表达下调，其低表达会破坏中心体复制调控，诱发染色体不稳定性（CIN），促进肿瘤发生；而过表达则可能通过稳定p53等抑癌蛋白抑制肿瘤生长。TRIM基因家族的共性包括：均含RING-B-box-卷曲螺旋三联结构域、多数具有E3泛素连接酶活性、参与先天免疫、细胞增殖和癌症等病理过程。TRIM36与家族其他成员（如TRIM5、TRIM28）共享调控蛋白质稳态的功能，但具有独特的中心体定位特性。专业术语解释：泛素-蛋白酶体系统（ubiquitin-proteasome system）是细胞内蛋白质选择性降解的重要途径；中心体（centrosome）是调控微管组织和细胞分裂的细胞器；非整倍体（aneuploidy）指细胞染色体数目偏离正常倍性的状态。目前中文文献对TRIM36的翻译存在差异，也有称为"三结构域蛋白36"（英文名不变）。

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. Multiple alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的蛋白是三方母题（TRIM）家族中的一员。 TRIM的基序包括三个锌结合结构域，一个环，B框型1和B框2型，和一个卷曲螺旋区域。编码不同蛋白同种型的多个可变剪接转录物变体已被用于这个基因说明。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对TRIM36基因的介绍     Wikipedia数据库中对TRIM36基因的介绍

基因序列

基因序列

TRIM36基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TRIM36基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs265405       rs973589       rs3792863       rs3805589       rs3805590       rs6594880       rs6594881       rs6894360       rs7716390       rs7737426       rs12657105       rs59146062       rs59903198       rs60504148       rs73251579       rs75239491       rs75720837      

基因表达

基因表达

TRIM36基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATCACCTGAGGTCAGGAG
59
CAATGAATTGCGCTTCCAG
58
AATTAACAGACCAGGCTGG
57
ATCCACATCATGCTCACAG
58
CTAAAGGCAAGGCTTCAGC
59
GAGATTTCAAAGGGACAGCG
59
TAGCTAAAGGCAAGATGCC
58
TGTTTGGGAGAAGTCTGTC
57
CAATCAAAGCAGTCCTCGA
58
GATCTCCGTTGTGATGCTG
59
ATTTATAGGATGCCGGATTGG
58
GTTTGGGAGAAGTCTGTCG
58
ATGCTCAAGAAGTGCTAAAGG
59
CTTTCTGTATTCTGAGGTGGAG
58
CTCATCTTCCAGCTTCGGA
59
AATGAATTGCGCTTCCAGC
60
ATAGCTAAAGGCAAGGTTACCA
60
ATGGGTGGGTAAACAGCTC
60
ATGCTCAAGAAGTGCTAAAGG
59
CTTTCTGTATTCTGAGGTGGAG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TRIM36基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRIM36基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004842
D6RAU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
D6RAU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016567
D6RAU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0051726
D6RAU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0004842
E9PBG3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
E9PBG3 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
E9PBG3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016567
E9PBG3 (UniProtKB)
IEA
GO:0051726
E9PBG3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000209
Q9NQ86 (UniProtKB)
TAS
GO:0001669
Q9NQ86 (UniProtKB)
IEA
GO:0004842
Q9NQ86 (UniProtKB)
EXP
GO:0004842
Q9NQ86 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q9NQ86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQ86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQ86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQ86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQ86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQ86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQ86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQ86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005829
Q9NQ86 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NQ86 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NQ86 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NQ86 (UniProtKB)
TAS
GO:0005856
Q9NQ86 (UniProtKB)
IEA
GO:0007340
Q9NQ86 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q9NQ86 (UniProtKB)
IEA
GO:0016874
Q9NQ86 (UniProtKB)
IEA
GO:0051726
Q9NQ86 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q9NQ86 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TRIM36基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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