TM9SF2 (transmembrane 9 superfamily member 2)

symbol:
TM9SF2
locus group:
protein-coding gene
location:
13q32.3
gene_family:
alias symbol:
P76
alias name:
None
entrez id:
9375
ensembl gene id:
ENSG00000125304
ucsc gene id:
uc001voj.3
refseq accession:
NM_004800
hgnc_id:
HGNC:11865
approved reserved:
1999-12-15
13q32.3
基因染色体位置图

TM9SF2(Transmembrane 9 Superfamily Member 2)是一种跨膜蛋白,属于TM9SF基因家族。该家族成员具有多个跨膜结构域(即蛋白质链多次穿过细胞膜),通常参与细胞内运输、膜动态平衡和蛋白质分选等过程。TM9SF2在多种组织中表达,尤其在免疫细胞和上皮细胞中较为丰富。其生物学功能尚未完全明确,但研究表明它可能参与溶酶体(细胞内负责降解废物的细胞器)的功能维持、自噬(细胞自我清理过程)以及炎症反应的调控。TM9SF2的突变或表达异常可能与某些疾病相关,例如有研究发现TM9SF2在结直肠癌中表达上调,可能通过影响细胞增殖和迁移促进肿瘤发展;此外,其表达变化还与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)中的自噬功能障碍有关。若TM9SF2过表达,可能干扰溶酶体正常功能,导致细胞内废物积累或异常信号传导;而降低表达则可能损害自噬过程,影响细胞存活或炎症调控。TM9SF基因家族的共性包括:均编码多次跨膜蛋白,参与膜相关运输或细胞器功能,并与癌症、感染或代谢疾病存在潜在关联。专业术语解释:跨膜结构域(蛋白质穿过细胞膜的部分)、溶酶体(降解大分子的细胞器)、自噬(细胞回收受损组分的过程)。英文注释:TM9SF2(Transmembrane 9 Superfamily Member 2)。

This gene encodes a member of the transmembrane 9 superfamily. The encoded 76 kDa protein localizes to early endosomes in human cells. The encoded protein possesses a conserved and highly hydrophobic C-terminal domain which contains nine transmembrane domains. The protein may play a role in small molecule transport or act as an ion channel. A pseudogene associated with this gene is located on the X chromosome. [provided by RefSeq, Oct 2012]

该基因编码跨膜9超家族的成员。所编码的76 kDa蛋白定位于在人类细胞早期内涵体。所编码的蛋白质具有该包含九个跨膜结构域的保守和高度疏水C-末端结构域。该蛋白可能在小分子运输或行为作用以起离子通道。与这种基因相关的假基因位于X染色体上。 [由RefSeq的,2012年10月提供]

TM9SF2基因的碱基序列:[NCBI]
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TM9SF2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3840812       rs4371023       rs4772214       rs7317945       rs7318549       rs7318715       rs9585103       rs9585104       rs11842388       rs34282255       rs34420664       rs34826943       rs71118483       rs71433440       rs72651433       rs74112252       rs74112256      

TM9SF2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCAACATCACTGGATTGTGG
58
CCAGGATTACAGAACCTCTG
57
GTCTAGATGGGACTATATTCTGGA
58
AATGCTAAACCACTGAATGTGG
59
ATACACAGCCACTCTTCAC
57
TCTCATCTCAGTACACTTGC
57
CTCATACCCACATTCAGTGGT
60
GATAAGAAGAGAACAATGACCAGG
59
CATAAGTAACAAGGCTTCTGGG
59
CATCTGATCTTATCATCTTCCTCG
59
GCCTCATACCCACATTCAG
58
TAAGAAGAGAACAATGACCAGG
58
CGTCTAGATGGGACTATATTCTGG
59
ATGCTAAACCACTGAATGTGG
59
TATCAACATCACTGGATTGTGG
58
AGGATTACAGAACCTCTGACC
59
CAAGCACAATTCTGTACTTTGG
59
CAAAGAAGCCAATTGTTCCTG
58
AATACACAGCCACTCTTCAC
58
CTCATCTCAGTACACTTGCC
58
      尚未收录相关数据

TM9SF2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TM9SF2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005768
Q99805 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q99805 (UniProtKB)
TAS
GO:0006810
Q99805 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
Q99805 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q99805 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TM9SF2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of temporal lobe 0.002367032 1 1 GAD

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