SPOCK1 (SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPOCK1
locus group:
protein-coding gene
location:
5q31.2
gene_family:
alias symbol:
testican-1
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None
entrez id:
6695
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ENSG00000152377
ucsc gene id:
uc003lbp.4
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NM_004598
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HGNC:11251
approved reserved:
1995-10-02

基因染色体位置

基因染色体位置

5q31.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SPOCK1（英文全称：Sparc/osteonectin, cwcv, and kazal-like domains proteoglycan 1）属于SPOCK基因家族，该家族成员均含有类似SPARC（分泌型酸性半胱氨酸丰富蛋白）的结构域，其共性是参与细胞外基质（ECM）的调控，影响细胞黏附、迁移及组织重塑。SPOCK1编码一种硫酸乙酰肝素蛋白聚糖，其表达产物通过结合基质蛋白（如胶原）和生长因子（如FGF2）调控ECM的稳定性及细胞信号传导。主要作用位点包括神经系统、骨骼肌和肿瘤微环境，尤其在神经发育中促进轴突生长和突触形成。突变可能导致SPOCK1功能异常，与智力障碍、肌营养不良和癌症转移相关。例如，在胶质母细胞瘤中，SPOCK1高表达通过激活MMP2/9（基质金属蛋白酶）促进肿瘤侵袭；而低表达可能影响神经可塑性，导致认知功能障碍。若该基因过表达，会增强ECM降解能力，加速癌细胞转移或纤维化疾病进展；若表达降低，则可能抑制组织修复，引发发育缺陷。SPOCK家族的其他成员（如SPOCK2/3）也参与ECM动态平衡，但SPOCK1因独特的Kazal结构域（一种蛋白酶抑制域）在蛋白酶调控中作用更突出。目前中文常将SPOCK1直译为“斯波克1”，但“类SPARC蛋白聚糖1”更贴合其功能特性。

This gene encodes the protein core of a seminal plasma proteoglycan containing chondroitin- and heparan-sulfate chains. The protein's function is unknown, although similarity to thyropin-type cysteine protease-inhibitors suggests its function may be related to protease inhibition. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码含有chondroitin-和乙酰肝素硫酸链的精浆蛋白多糖的蛋白质核心。该蛋白质的功能是未知的，虽然相似thyropin型半胱氨酸蛋白酶抑制剂暗示其功能可能对蛋白酶抑制有关。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对SPOCK1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SPOCK1基因的介绍

基因序列

基因序列

SPOCK1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPOCK1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2240223       rs2240224       rs2240225       rs2905972       rs2905973       rs2905974       rs2905975       rs2905976       rs2905977       rs2905978       rs2905979       rs2966729       rs2966730       rs4976414       rs6885549       rs7727059       rs10078794      

基因表达

基因表达

SPOCK1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGAATCCTCCCTGTGAGG
59
GAAATAATCATCTGCAGGACAC
58
GAGGGCTATTACAAAGCCAC
59
TTCCTGCTCCTCTTCACAG
59
AAGGTGAACATGGGTCTCC
59
CCCATAGTGCTCTAGGAGTC
59
CTGTGAGCTGTGAAGAGGA
59
TATTCTAGGTCATCCAGCAGG
59
AAGGGAGTCAGGGTTTGAC
59
TCTCTGAAGGGTCAAGCAG
59
ATTGGTTTGGAGCTCTCCA
59
GATGCTAGTGTCAAACCTGC
59
TAGACAATGACCAGTGGCTG
60
AATAATCATCGTCTCGAAAGCG
59
CTATGGATCCCTTCTGAGGC
60
AATAATCATCCTGCTGCAAGG
59
TAGACAATGACCAGTGGCTG
60
AATAATCATCGTCTCGAAAGCG
59
CACATCCAAGTGCAAATTGG
58
TTTCTGCCTTGTGCTTTGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPOCK1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPOCK1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
A0A0A0MQX7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
A0A0A0MQX7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
A0A0A0MQX7 (UniProtKB)
IEA
GO:0001558
Q08629 (UniProtKB)
NAS
GO:0001764
Q08629 (UniProtKB)
ISS
GO:0004867
Q08629 (UniProtKB)
NAS
GO:0004869
Q08629 (UniProtKB)
IDA
GO:0005509
Q08629 (UniProtKB)
IDA
GO:0005578
Q08629 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
Q08629 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q08629 (UniProtKB)
ISS
GO:0007155
Q08629 (UniProtKB)
NAS
GO:0007165
Q08629 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
Q08629 (UniProtKB)
NAS
GO:0008191
Q08629 (UniProtKB)
IDA
GO:0010812
Q08629 (UniProtKB)
IDA
GO:0010951
Q08629 (UniProtKB)
IDA
GO:0010977
Q08629 (UniProtKB)
IDA
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Q08629 (UniProtKB)
NAS
GO:0016528
Q08629 (UniProtKB)
ISS
GO:0021953
Q08629 (UniProtKB)
ISS
GO:0022008
Q08629 (UniProtKB)
ISS
GO:0031594
Q08629 (UniProtKB)
ISS
GO:0033268
Q08629 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPOCK1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Pancreatic Neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Creatinine finding 0.002367032 1 1 GAD
Neoplasm Metastasis 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of gallbladder 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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