SLC27A6 (solute carrier family 27 member 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SLC27A6
locus group:
protein-coding gene
location:
5q23.3
gene_family:
Acyl-CoA synthetase family|Solute carriers
alias symbol:
FATP6|VLCS-H1|FACVL2|ACSVL2
alias name:
fatty-acid-Coenzyme A ligase, very…
entrez id:
28965
ensembl gene id:
ENSG00000113396
ucsc gene id:
uc003kuz.4
refseq accession:
NM_014031
hgnc_id:
HGNC:11000
approved reserved:
1999-08-20

基因染色体位置

基因染色体位置

5q23.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SLC27A6（溶质载体家族27成员6，英文全称Solute Carrier Family 27 Member 6）属于脂肪酸转运蛋白（FATP）家族，该家族主要负责长链脂肪酸（LCFAs）的摄取和代谢。SLC27A6基因编码的蛋白质是一种跨膜蛋白，主要表达于肝脏、小肠和脂肪组织等代谢活跃的器官中，其生物学功能包括促进脂肪酸的跨膜转运和激活，参与细胞内脂质代谢过程。SLC27A6通过将脂肪酸从细胞外转运至细胞内，并在细胞内将其转化为脂肪酰辅酶A（fatty acyl-CoA），从而影响能量储存和信号传导。该基因的突变可能导致脂肪酸代谢异常，与肥胖、胰岛素抵抗和2型糖尿病等代谢性疾病相关。如果SLC27A6过表达，可能增加脂肪酸的摄取和储存，导致脂质积累，进而促进脂肪肝或代谢综合征的发生；而降低表达则可能减少脂肪酸的利用，影响能量供应，甚至导致某些组织功能障碍。SLC27A6所在的SLC27基因家族共有6个成员（SLC27A1-A6），它们均具有脂肪酸转运活性，但在组织分布和底物偏好上存在差异。该家族蛋白通常含有一个保守的AMP结合域（AMP-binding domain），负责脂肪酸的活化。目前研究发现，SLC27A6可能与其他代谢相关基因（如PPARγ）存在相互作用，共同调节脂质代谢平衡。由于其在脂肪酸代谢中的关键作用，SLC27A6被认为是代谢紊乱疾病的潜在治疗靶点。

This gene encodes a member of the fatty acid transport protein family (FATP). FATPs are involved in the uptake of long-chain fatty acids and have unique expression patterns. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的脂肪酸转运蛋白家族（FATP）的成员。 FATPs是参与的长链脂肪酸的摄取和具有独特的表达模式。已发现此基因编码相同蛋白质可变剪接转录物变体。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对SLC27A6基因的介绍     Wikipedia数据库中对SLC27A6基因的介绍

基因序列

基因序列

SLC27A6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SLC27A6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1047999       rs41298332       rs74701086       rs76429182       rs77390763       rs77998613       rs111276742       rs114930974       rs138857066       rs140060838       rs142110576       rs144962899       rs145953159       rs150330050       rs151144946       rs183468494       rs184113986      

基因表达

基因表达

SLC27A6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TACTGGAGACTTAATAGTCCAGG
59
CCTTTCCATCTGAAAGTGTCTC
59
GATGTGTTGAGTTGGGTGC
59
ACATCATACTTCTTGCAGTCAC
58
GATGTGTTGAGTTGGGTGC
60
ACATCATACTTCTTGCAGTCAC
59
TACTGGAGACTTAATAGTCCAGG
59
CCTTTCCATCTGAAAGTGTCTC
59
TACTGGAGACTTAATAGTCCAGG
59
CCTTTCCATCTGAAAGTGTCTC
59
GATGTGTTGAGTTGGGTGC
59
CATCATACTTCTTGCAGTCACTC
59
CTGAGGTTGCTGATGTTATTGG
60
CTTCATAACCTGATATAGCCACAC
59
GATGTGTTGAGTTGGGTGC
60
CATCATACTTCTTGCAGTCACTC
60
CTGAGGTTGCTGATGTTATTGG
60
CTTCATAACCTGATATAGCCACAC
59
CTGAGGTTGCTGATGTTATTGG
60
CTTCATAACCTGATATAGCCACAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SLC27A6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC27A6基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001676
D6RAJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0004467
D6RAJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0015908
D6RAJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
D6RAJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0031957
D6RAJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0000038
Q9Y2P4 (UniProtKB)
TAS
GO:0000166
Q9Y2P4 (UniProtKB)
IEA
GO:0001676
Q9Y2P4 (UniProtKB)
IEA
GO:0004467
Q9Y2P4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9Y2P4 (UniProtKB)
TAS
GO:0015245
Q9Y2P4 (UniProtKB)
TAS
GO:0015909
Q9Y2P4 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q9Y2P4 (UniProtKB)
IEA
GO:0031957
Q9Y2P4 (UniProtKB)
IEA
GO:0042383
Q9Y2P4 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SLC27A6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Myocardial Infarction 0.08 1 0 RGD
Metabolic Syndrome X 0.000542884 2 1 BeFree
Obesity 0.000542884 2 0 BeFree
Cardiovascular Diseases 0.000542884 2 0 BeFree
Left Ventricular Hypertrophy 0.000271442 1 0 BeFree
Heart failure 0.000271442 1 0 BeFree
Multiple Endocrine Neoplasia Type 2a 0.000271442 1 0 BeFree
Congestive heart failure 0.000271442 1 0 BeFree
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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