RAET1E-AS1 (RAET1E antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RAET1E-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
6q25.1
gene_family:
alias symbol:
RAET1G-AS1
alias name:
None
entrez id:
100652739
ensembl gene id:
ENSG00000223701
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None
refseq accession:
NR_045126
hgnc_id:
HGNC:48994
approved reserved:
2013-07-25

基因染色体位置

基因染色体位置

6q25.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

RAET1E-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类6号染色体上，属于RAET1基因家族的邻近区域。RAET1基因家族主要编码与免疫调节相关的蛋白质，特别是自然杀伤细胞（NK细胞）激活配体，参与免疫监视和肿瘤免疫逃逸。RAET1E-AS1作为反义RNA，可能通过调控邻近RAET1E基因的表达来影响免疫功能。目前关于RAET1E-AS1的具体生物学功能研究较少，但已知lncRNA通常参与基因表达调控、染色质修饰和信号通路调控。RAET1E-AS1可能在免疫反应中发挥作用，特别是在肿瘤微环境中调节NK细胞活性。突变或表达异常可能影响免疫系统的正常功能，导致免疫逃逸或自身免疫疾病风险增加。RAET1E-AS1过表达可能抑制邻近RAET1E基因的表达，从而削弱NK细胞的杀伤能力，促进肿瘤生长；而降低表达可能增强免疫反应，但也可能引发过度炎症。RAET1E-AS1与某些癌症如肝癌和乳腺癌的进展相关，可能作为潜在的生物标志物或治疗靶点。RAET1基因家族的共性包括编码免疫调节蛋白，参与细胞间识别和免疫应答，尤其在NK细胞介导的细胞毒性中起关键作用。

None

无

OMIM数据库中对RAET1E-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对RAET1E-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

RAET1E-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RAET1E-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1055274       rs1889471       rs1889472       rs7763718       rs7763719       rs9322225       rs9371502       rs9371504       rs9371505       rs9383881       rs9397387       rs9478192       rs10080756       rs10553273       rs34330557       rs35586124       rs57894361      

基因表达

基因表达

RAET1E-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGATGCAGGTTCCCTCTG
59
GTCACAGGATGTCACCCTC
60
CACTTGGTACAGGATGAACC
58
CAGCTCAGTTTCGATGGAC
59
CAGTAGCGGGAGACATAGC
60
GACAACGGTTCATCCAAGG
59
CAGTAGCGGGAGACATAGC
60
GACAACGGTTCATCCAAGG
59
AAGATGCAGGTTCCCTCTG
59
CACAGGATGTCACCCTCTG
60
GATCGAGGACCACAGTATACC
60
GAATCATGTCAGTGACTATCTTCAG
60
GACCACAGTATACCTGATGC
58
TCCTTTGAATCATGTCAGTGAC
59
CAGTAGCGGGAGACATAGC
60
GACAACGGTTCATCCAAGG
59
TGCCTGGTAAGGATGAACC
59
CAGCTCAGTTTCGATGGAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RAET1E-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RAET1E-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RAET1E-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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