PPARGC1B (PPARG coactivator 1 beta)

symbol:
PPARGC1B
locus group:
protein-coding gene
location:
5q32
gene_family:
RNA binding motif containing
alias symbol:
PERC|PGC1B|PPARAGCIβ
alias name:
PPARgamma coactivator 1 beta
entrez id:
133522
ensembl gene id:
ENSG00000155846
ucsc gene id:
uc003lrc.4
refseq accession:
NM_133263
hgnc_id:
HGNC:30022
approved reserved:
2004-02-03
5q32
基因染色体位置图

PPARGC1B(过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子1β)属于PPARGC1基因家族,该家族还包括PPARGC1A和PPIRGC1。这个基因家族的主要共性是编码转录共激活因子,这些因子通过调控线粒体生物合成、能量代谢和氧化应激反应等过程,在细胞能量平衡中发挥核心作用。PPARGC1B主要在骨骼肌、心脏、肝脏和脂肪组织中表达,其编码的蛋白质通过与多种转录因子(如PPARs、ERRs和NRFs)相互作用,激活参与脂肪酸氧化、葡萄糖代谢和线粒体功能的基因表达。该基因在调节机体能量代谢、维持线粒体功能和应对代谢压力方面至关重要。PPARGC1B的突变或表达异常与多种代谢性疾病相关,如2型糖尿病、肥胖症和心血管疾病。研究表明,PPARGC1B的某些突变可能导致其共激活功能受损,进而影响线粒体功能和能量代谢,增加代谢紊乱的风险。当PPARGC1B过表达时,会增强线粒体生物合成和脂肪酸氧化能力,可能改善胰岛素敏感性和代谢健康,但也可能与某些癌症的发生有关。相反,PPARGC1B表达降低会导致线粒体功能受损、能量代谢紊乱,增加肥胖和胰岛素抵抗的风险。此外,PPARGC1B的表达水平还会影响其他代谢相关基因的表达,如UCP1(解偶联蛋白1)和PDK4(丙酮酸脱氢酶激酶4),从而进一步调节能量代谢和产热过程。PPARGC1B与PPARGC1A在功能上有部分重叠,但它们在组织分布和调控机制上存在差异,PPARGC1B在某些组织中可能具有独特的代谢调控作用。

The protein encoded by this gene stimulates the activity of several transcription factors and nuclear receptors, including estrogen receptor alpha, nuclear respiratory factor 1, and glucocorticoid receptor. The encoded protein may be involved in fat oxidation, non-oxidative glucose metabolism, and the regulation of energy expenditure. This protein is downregulated in prediabetic and type 2 diabetes mellitus patients. Certain allelic variations in this gene increase the risk of the development of obesity. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2010]

由该基因编码的蛋白刺激的几个转录因子和核受体,包括雌激素受体α,核呼吸因子1,和糖皮质激素受体的活性。所编码的蛋白质可能参与了脂肪氧化,非氧化的葡萄糖代谢,和能量消耗的调节。这种蛋白质在前驱糖尿病和2型糖尿病患者的下调。在该基因的某些等位基因变异增加肥胖发展的风险。已发现该基因编码不同亚型三个抄本变形。 [由RefSeq的,2010年3月提供]

PPARGC1B基因的碱基序列:[NCBI]
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PPARGC1B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1076063       rs1076064       rs1106870       rs2011407       rs2340620       rs3892285       rs4705365       rs9986134       rs10476744       rs13436048       rs41287082       rs62382272       rs70973539       rs71676300       rs75536988       rs77374002       rs112348482      

PPARGC1B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTGACTACGATTCCAATTCAG
58
GGCCTCTTTCAGTAAGCTG
58
TACACTGACTACGGATGGC
59
AATCTGCCACTATGAGTGGG
60
AGGAACTTCAGATGTGAGAGC
60
TTTGAATGTACACCACGCG
59
TGACACGCAGGATAGAGAC
59
TCCCACCATTTGTGAAAGTC
58
GCCCAGAGAACTCAGAGAC
60
CCTCATTCTCACTGTCAATCTG
59
GCTCTTCCAGATTGACAGTG
59
ACGTCATCTTCAGGGATGTC
60
GCTCTTCCAGATTGACAGTG
59
ACGTCATCTTCAGGGATGTC
60
GCCCAGAGAACTCAGAGAC
60
CCTCATTCTCACTGTCAATCTG
59
CTTGTGTTAAGGCGGACAG
59
GTGAGGTGCTTATGTAGTTCTG
59
GTGCCCAGAGAACTCAGAG
60
TCATTCTCACTGTCAATCTGGA
59
      尚未收录相关数据

PPARGC1B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PPARGC1B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000166
H0Y713 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
H0Y713 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0001104
Q86YN6 (UniProtKB)
IDA
GO:0001503
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
Q86YN6 (UniProtKB)
NAS
GO:0005634
Q86YN6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q86YN6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q86YN6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005739
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q86YN6 (UniProtKB)
IDA
GO:0006390
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007005
Q86YN6 (UniProtKB)
TAS
GO:0007015
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0008134
Q86YN6 (UniProtKB)
IBA
GO:0010694
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016592
Q86YN6 (UniProtKB)
IDA
GO:0030331
Q86YN6 (UniProtKB)
IDA
GO:0030374
Q86YN6 (UniProtKB)
IDA
GO:0030520
Q86YN6 (UniProtKB)
IDA
GO:0030546
Q86YN6 (UniProtKB)
IDA
GO:0034614
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0042327
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0045672
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0045780
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0045892
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
Q86YN6 (UniProtKB)
IDA
GO:0050682
Q86YN6 (UniProtKB)
IPI
GO:0051091
Q86YN6 (UniProtKB)
IBA
GO:0051384
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0051591
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0060346
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA
GO:2000273
Q86YN6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PPARGC1B基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Obesity 0.125081451 10 0 BeFree_CTD_human_GAD
Mammary Neoplasms 0.12272435 2 0 CTD_human_LHGDN
Hyperlipidemia 0.12 1 0 CTD_human
Sepsis 0.08 1 0 RGD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.010901282 16 0 BeFree_GAD
Malignant neoplasm of breast 0.004267125 7 2 BeFree_GAD
Diabetes Mellitus 0.003724241 6 0 BeFree_GAD
Cardiomyopathies 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Malignant neoplasm of prostate 0.002909916 2 0 BeFree_GAD
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN

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