PAMR1 (peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PAMR1
locus group:
protein-coding gene
location:
11p13
gene_family:
alias symbol:
RAMP|DKFZP586H2123
alias name:
regeneration-associated muscle pro…
entrez id:
25891
ensembl gene id:
ENSG00000149090
ucsc gene id:
uc031xjx.2
refseq accession:
NM_015430
hgnc_id:
HGNC:24554
approved reserved:
2009-04-07

基因染色体位置

基因染色体位置

11p13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PAMR1（Peptidase Domain Associated with a Ring Finger 1）是一个编码含有肽酶结构域和环指结构域的蛋白质的基因。其表达产物主要参与蛋白质降解和修饰过程，尤其在泛素-蛋白酶体系统中发挥作用。PAMR1的生物学功能包括调控细胞周期、DNA损伤修复以及细胞凋亡等关键过程。该基因的主要作用位点通常在细胞质和细胞核内，通过与泛素结合酶相互作用来标记待降解的蛋白质。突变可能导致PAMR1功能异常，进而影响蛋白质稳态，可能引发癌症、神经退行性疾病或自身免疫性疾病。PAMR1过表达可能加速蛋白质降解，导致细胞周期紊乱或异常凋亡，而降低表达则可能使受损蛋白质积累，影响细胞正常功能。PAMR1属于环指蛋白家族（RING finger family），该家族成员通常具有E3泛素连接酶活性，参与泛素化过程，调控蛋白质的稳定性、定位和功能。这一家族的共性是通过环指结构域介导蛋白质相互作用，并在多种细胞过程中发挥核心作用，包括信号转导、转录调控和免疫应答等。

None

无

OMIM数据库中对PAMR1基因的介绍     Wikipedia数据库中对PAMR1基因的介绍

基因序列

基因序列

PAMR1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PAMR1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs7767       rs17482       rs479011       rs506859       rs526545       rs547712       rs552987       rs567402       rs581513       rs581660       rs582555       rs583220       rs586291       rs589406       rs589475       rs590102       rs590498      

基因表达

基因表达

PAMR1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAGTACACAGTCATTAATGAAGC
60
AGATGGTACAACCTGGGTG
59
ATCCTGCATCCCTATCTGC
59
CTGGTCCTCCTGTAGATGG
59
GTTATACCATCCCTTGCTGC
58
TTTCAAAGATGGTACAACCTGG
59
GAGAGTACACAGTCATTAATGAAGC
60
AGATGGTACAACCTGGGTG
59
AGCAGAATGGAGTGGTCAG
59
ACTCTCCTTCTCACCAGGT
60
ATCTTACAAGTGTGCCTGC
58
CAGTTTCTTTCTTCAAGGACAG
58
ATCTTACAAGTGTGCCTGC
58
CAGTTTCTTTCTTCAAGGACAG
58
GAGAGTACACAGTCATTAATGAAGC
60
AGATGGTACAACCTGGGTG
59
TCTTACAAGTGTGCCTGCT
59
GCCTCCAGAACTCATTCCA
59
AGGAGATCACAGCATGCTC
60
CACACTTGTAAGATCCAGCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PAMR1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PAMR1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004252
A0A087WUR8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
A0A087WUR8 (UniProtKB)
IEA
GO:0004252
A0A087WXE9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
A0A087WXE9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
A0A087WXE9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
E9PMN5 (UniProtKB)
IEA
GO:0004252
E9PQ70 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
E9PQ70 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
E9PQ70 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q6UXH9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q6UXH9 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PAMR1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Muscular Dystrophy, Duchenne 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Mental Retardation, X-Linked 0.000271442 1 0 BeFree
Chronic myeloproliferative disorder 0.000271442 1 0 BeFree
Myeloproliferative disease 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Cancer Cell Growth 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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