LINC01340 (long intergenic non-protein coding RNA 1340)

symbol:
LINC01340
locus group:
non-coding RNA
location:
5q15
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alias symbol:
None
alias name:
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102546227
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HGNC:50550
approved reserved:
2014-05-20
5q15
基因染色体位置图

LINC01340是一种长链非编码RNA(lncRNA),属于长链非编码RNA基因家族,这类RNA通常不编码蛋白质,但能通过调控基因表达参与多种生物学过程。LINC01340在多种组织中表达,但其具体功能尚未完全明确。研究表明,它可能在细胞增殖、分化和凋亡中发挥作用,并可能通过表观遗传调控或作为竞争性内源RNA(ceRNA)影响其他基因的表达。LINC01340的异常表达与多种疾病相关,例如在某些癌症中,其表达水平的变化可能影响肿瘤的发生和发展。过表达LINC01340可能促进细胞增殖或抑制凋亡,从而参与肿瘤进展;而降低表达则可能抑制肿瘤生长或恢复正常的细胞功能。此外,LINC01340的突变可能破坏其调控网络,导致疾病相关通路的异常。尽管其具体机制仍需进一步研究,但LINC01340作为lncRNA家族的一员,可能通过与其他RNA、蛋白质或DNA相互作用,广泛参与基因表达的精细调控。长链非编码RNA家族的共性包括调控染色质结构、转录后修饰及信号通路激活等,其成员通常具有组织特异性表达模式,并在发育和疾病中发挥关键作用。LINC01340的研究为理解lncRNA在疾病中的作用提供了潜在的新靶点。

None

LINC01340基因的碱基序列:[NCBI]
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LINC01340基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs766571       rs953749       rs962047       rs962048       rs962049       rs987060       rs990696       rs990697       rs990698       rs990699       rs999753       rs1038491       rs1038492       rs1304227       rs1346700       rs1367043       rs1429867      

LINC01340基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TAAGAACAAGTTCAGCTTCCC
58
GCTTTCTCATAGGTTCAGCA
58
GATAAGAACAAGTTCAGCTTCC
58
TTTCTCATAGGTTCAGCAGG
57
ATAAGAACAAGTTCAGCTTCCC
59
CTTTCTCATAGGTTCAGCAGG
59
      尚未收录相关数据

LINC01340基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC01340基因的本体(GO)信息:

可能调控 LINC01340基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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