H19 (H19 imprinted maternally expressed transcript)

symbol:
H19
locus group:
non-coding RNA
location:
11p15.5
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
D11S813E|ASM|ASM1|NCRNA00008|LINC00008|MIR675HG
alias name:
non-protein coding RNA 8|long inte…
entrez id:
283120
ensembl gene id:
ENSG00000130600
ucsc gene id:
uc057xvv.1
refseq accession:
NR_002196
hgnc_id:
HGNC:4713
approved reserved:
1999-04-15
11p15.5
基因染色体位置图

H19是一个重要的印记基因,位于人类第11号染色体(11p15.5),属于印记基因家族。它编码一个长链非编码RNA(lncRNA),不翻译成蛋白质,但通过RNA分子本身发挥调控作用。H19主要在胚胎发育阶段高表达,出生后表达水平显著下降,但在某些成年组织中仍有低水平表达。H19的生物学功能复杂多样,它参与细胞增殖、分化和凋亡的调控,并在胚胎生长和胎盘发育中起关键作用。H19通过表观遗传机制(如DNA甲基化)和竞争性内源RNA(ceRNA)机制发挥作用,能够吸附微小RNA(如miR-675),从而影响靶基因的表达。H19的主要作用位点包括调控胰岛素样生长因子2(IGF2)的表达,它与IGF2共享一个印记控制区(ICR),通过甲基化状态的变化实现相互拮抗的调控关系。H19的突变或表达异常与多种疾病相关,包括贝威二氏综合征(Beckwith-Wiedemann syndrome,BWS)和银罗素综合征(Silver-Russell syndrome,SRS),这些疾病通常与11p15.5区域的印记缺陷有关。H19过表达可能促进某些癌症(如乳腺癌、肝癌和膀胱癌)的发生和发展,因为它能通过miR-675抑制抑癌基因(如RB和PTEN)的功能。相反,H19表达降低可能影响胚胎发育或导致生长受限。H19属于印记基因家族,该家族的特点是基因表达依赖于亲本来源,即仅从父亲或母亲一方遗传的等位基因表达,而另一方被沉默。印记基因通常参与调控生长和代谢,并在发育和疾病中起重要作用。H19的研究为理解印记机制、胚胎发育和肿瘤发生提供了重要线索,其表达调控的异常可能成为某些疾病的诊断标志或治疗靶点。

This gene is located in an imprinted region of chromosome 11 near the insulin-like growth factor 2 (IGF2) gene. This gene is only expressed from the maternally-inherited chromosome, whereas IGF2 is only expressed from the paternally-inherited chromosome. The product of this gene is a long non-coding RNA which functions as a tumor suppressor. Mutations in this gene have been associated with Beckwith-Wiedemann Syndrome and Wilms tumorigenesis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2015]

该基因位于胰岛素样生长因子2(IGF2)基因邻近的染色体11的压印区域。该基因只从母系遗传染色体表达,而IGF2仅从父系继承染色体表达。这个基因的产物是一个长的非编码RNA,其功能作为肿瘤抑制基因。该基因突变与威思 - 威德曼综合征和肾母细胞肿瘤发生有关。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2015年4月提供]

H19基因的碱基序列:[NCBI]
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H19基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs217727       rs2067051       rs2071094       rs2071095       rs2075744       rs2075745       rs2107425       rs2158394       rs2251312       rs2251375       rs2525881       rs2525882       rs2525883       rs2525884       rs2525885       rs2525886       rs2668850      

H19基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CACAACATGAAAGAAATGGTGC
59
TTCATTTCCAAGCTAGAGGGT
59
AGTCTGGCAGGAAGTTAGC
59
CCTCTTGCTCTTTCTGCCT
60
CACAACATGAAAGAAATGGTGC
59
TTCATTTCCAAGCTAGAGGGT
59
CCACAACATGAAAGCTTGGA
59
AGGTCTGGTTCCTCTAGCT
59
GTGACAAGCAGGACATGAC
59
CAGCCTAAGGTGTTCAGGA
59
GCTTGGAAATGAATATGCTGC
59
GTCTGGTTCCTCTAGCTTCC
60
CACAACATGAAAGAAATGGTGC
59
TTCATTTCCAAGCTAGAGGGT
59
CACAACATGAAAGAAATGGTGC
59
TTCATTTCCAAGCTAGAGGGT
59
CACAACATGAAAGAAATGGTGC
59
TTCATTTCCAAGCTAGAGGGT
59
CACAACATGAAAGAAATGGTGC
59
TTCATTTCCAAGCTAGAGGGT
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
DDX5
H19
Unknown
E2F1
H19
Activation

H19基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

H19基因的本体(GO)信息:

可能调控 H19基因的相关microRNA:     

BioGrid

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Beckwith-Wiedemann Syndrome 0.253059004 21 0 BeFree_CLINVAR_CTD_human_LHGDN
Russell-Silver syndrome 0.122985861 12 0 BeFree_CTD_human
Nephroblastoma 0.121357209 5 0 BeFree_ORPHANET
Liver Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Familial Wilms tumor 2 0.12 0 0 CTD_human
Hepatitis, Animal 0.12 1 0 CTD_human
Congenital hemihypertrophy 0.12 0 0 ORPHANET
Malignant neoplasm of breast 0.008186863 7 1 BeFree_GAD
Bladder Neoplasm 0.005720142 2 0 BeFree_LHGDN
Liver carcinoma 0.003810118 5 0 BeFree_LHGDN

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