GCNT3 (glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GCNT3
locus group:
protein-coding gene
location:
15q22.2
gene_family:
Glucosaminyl (N-acetyl) transferase / xylosyltransferase family
alias symbol:
C2GnT-M|C2/4GnT|C2GnT2
alias name:
None
entrez id:
9245
ensembl gene id:
ENSG00000140297
ucsc gene id:
uc002age.4
refseq accession:
NM_004751
hgnc_id:
HGNC:4205
approved reserved:
1999-02-26

基因染色体位置

基因染色体位置

15q22.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

GCNT3（Glucosaminyl (N-Acetyl) Transferase 3）是一种糖基转移酶，属于GCNT基因家族（Glucosaminyl (N-Acetyl) Transferase家族），该家族成员主要参与糖蛋白和糖脂的糖链修饰，特别是核心2分支O-聚糖的合成。GCNT3在多种组织中表达，包括肠道、胰腺和免疫系统，其编码的酶通过催化N-乙酰葡糖胺的转移，影响细胞表面的糖基化模式，进而调节细胞黏附、信号传导和免疫应答。GCNT3的生物学功能与黏膜屏障的完整性密切相关，尤其在肠道中，它通过修饰黏蛋白的糖链结构，帮助维持肠道微生物平衡和防御病原体侵袭。GCNT基因家族的共性在于它们都参与糖链的延伸和分支，影响细胞-细胞相互作用和免疫调节。GCNT3的突变可能导致糖基化异常，与炎症性肠病（如克罗恩病和溃疡性结肠炎）及某些癌症（如结直肠癌）的发生有关。研究表明，GCNT3的过表达可能促进肿瘤细胞的转移和侵袭，因其改变细胞表面的糖基化模式，增强肿瘤细胞与基质的相互作用；而降低表达则可能削弱黏膜屏障功能，增加感染和炎症风险。此外，GCNT3的表达水平还与免疫细胞的活化和迁移有关，影响慢性炎症和自身免疫疾病的发展。总体而言，GCNT3在糖基化修饰和黏膜免疫中起关键作用，其表达异常与多种疾病相关，是潜在的治疗靶点。

None

无

OMIM数据库中对GCNT3基因的介绍     Wikipedia数据库中对GCNT3基因的介绍

基因序列

基因序列

GCNT3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GCNT3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2291121       rs2414640       rs3743119       rs3743120       rs4775190       rs7173029       rs7174490       rs7181069       rs7182378       rs7182379       rs8029634       rs9806231       rs11542806       rs11852635       rs28364595       rs28448540       rs34081917      

基因表达

基因表达

GCNT3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGCTCCTACAGAGTTTGAC
60
ACTCAGCTGTGTCTTTCCC
60
TACTAAAGGATTGTGTCCTCCT
58
AGAGTCTCTTCCATTGAACCA
59
AACAGATGAAGAACATGACCTC
59
GGGTGGATTTCTCCTTTGC
59
TACTAAAGGATTGTGTCCTCCT
58
AGAGTCTCTTCCATTGAACCA
59
TTGTCCAGGATTGTGTCCT
59
AGAGTCTCTTCCATTGAACCA
59
TACTAAAGGATTGTGTCCTCCT
58
AGAGTCTCTTCCATTGAACCA
59
AATCTGGATGGTGCCTCTC
59
GAAGCAAAGAGTCAAACTCTG
58
CCAGTCTTCACTTGGAAACAG
59
GAGGACACAATCCTTTAGTAGC
59
TCATCCCTAAGCAGGAGAG
58
GATTGTTGACTCAAGGAAAGC
58
AACAGATGAAGAACATGACCTC
59
CTCCTCTTTAATATCTTTGCCAGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GCNT3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GCNT3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H0YM40 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0YMW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0YNA3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
O95395 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
O95395 (UniProtKB)
TAS
GO:0002426
O95395 (UniProtKB)
IEA
GO:0003829
O95395 (UniProtKB)
TAS
GO:0003829
O95395 (UniProtKB)
TAS
GO:0005975
O95395 (UniProtKB)
NAS
GO:0006493
O95395 (UniProtKB)
TAS
GO:0008109
O95395 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
O95395 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
O95395 (UniProtKB)
IEA
GO:0016266
O95395 (UniProtKB)
TAS
GO:0047225
O95395 (UniProtKB)
IEA
GO:0048729
O95395 (UniProtKB)
IEA
GO:0050892
O95395 (UniProtKB)
IEA
GO:0060993
O95395 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
O95395 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GCNT3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colonic Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant tumor of colon 0.000542884 2 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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