DHX15 (DEAH-box helicase 15)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DHX15
locus group:
protein-coding gene
location:
4p15.2
gene_family:
DEAH box polypeptides
alias symbol:
HRH2|DBP1|PRP43|PrPp43p|PRPF43
alias name:
None
entrez id:
1665
ensembl gene id:
ENSG00000109606
ucsc gene id:
uc003gqx.4
refseq accession:
NM_001358
hgnc_id:
HGNC:2738
approved reserved:
1997-12-05

基因染色体位置

基因染色体位置

4p15.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

DHX15属于DEAH-box RNA解旋酶家族，是一种重要的RNA解旋酶，参与多种RNA代谢过程，包括pre-mRNA剪接、核糖体生物合成和RNA降解。该基因编码的蛋白质具有ATP依赖的RNA解旋酶活性，能够解开RNA二级结构，在RNA加工和成熟中发挥关键作用。DHX15主要定位于细胞核和核仁，与剪接体复合物相互作用，参与内含子切除和外显子连接。突变或异常表达可能导致剪接缺陷，影响基因表达调控。研究发现DHX15与多种疾病相关，包括癌症、神经退行性疾病和病毒感染。在急性髓系白血病中，DHX15突变会导致异常剪接，促进白血病发生；在病毒感染中，它参与抗病毒免疫应答。过表达DHX15可能增强RNA加工效率，但可能导致剪接失衡；而表达降低则会引起RNA代谢紊乱，影响细胞正常功能。DEAH-box家族成员都具有保守的解旋酶结构域，能够结合并重塑RNA结构，参与RNA代谢的不同环节。这个家族在进化上高度保守，从酵母到人类都存在同源基因，表明其在生命活动中的重要性。DHX15作为该家族核心成员，其功能异常会广泛影响基因表达网络，导致多种病理变化。

The protein encoded by this gene is a putative ATP-dependent RNA helicase implicated in pre-mRNA splicing. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是在mRNA前剪接牵连推定ATP依赖的RNA解旋酶。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对DHX15基因的介绍     Wikipedia数据库中对DHX15基因的介绍

基因序列

基因序列

DHX15基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DHX15基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs13772       rs1012231       rs1032922       rs1062681       rs1125220       rs1395219       rs1506347       rs2048026       rs2048027       rs3749588       rs3805393       rs3828557       rs3828558       rs3840306       rs4437236       rs4642236       rs4697063      

基因表达

基因表达

DHX15基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGCTATGTTGTCAGTCCCA
59
GCAAATCTCATCTTGGCCTC
59
TTATGGATCCACCAGCTCC
59
CCCAATTCAGTCAGATCTCCA
60
TATCAAGCCAGAATGGTTCCA
60
GGTTATGGTTCTCCATGTACAC
59
TCAAGCCAGAATGGTTGGT
60
AACTGTCTCTTTGCTTCACAC
59
AAAGCTTTGGTTACTGGGT
57
ACACTGTGGGAAATTGCTC
58
TAATCACAGCACTTTGGGAG
58
GATCTCGATCCTTCCTTGG
57
TCAAGCCAGAATGGTTGGT
60
AACTGTCTCTTTGCTTCACAC
59
ACTGACTTTACAAGCAGGGA
59
TTCTAAATGTGCCACCTGC
59
ACTGACTTTACAAGCAGGGA
59
TTCTAAATGTGCCACCTGC
59
TAATCACAGCACTTTGGGAG
58
GATCTCGATCCTTCCTTGG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

DHX15基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DHX15基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000398
O43143 (UniProtKB)
IBA
GO:0003724
O43143 (UniProtKB)
TAS
GO:0003725
O43143 (UniProtKB)
IDA
GO:0004004
O43143 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
O43143 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43143 (UniProtKB)
IPI
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O43143 (UniProtKB)
IPI
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O43143 (UniProtKB)
IPI
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O43143 (UniProtKB)
IPI
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O43143 (UniProtKB)
IPI
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O43143 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43143 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43143 (UniProtKB)
IPI
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O43143 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43143 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43143 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43143 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
O43143 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
O43143 (UniProtKB)
IDA
GO:0005689
O43143 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
O43143 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
O43143 (UniProtKB)
IBA
GO:0006397
O43143 (UniProtKB)
TAS
GO:0008380
O43143 (UniProtKB)
IC
GO:0009636
O43143 (UniProtKB)
IEA
GO:0043279
O43143 (UniProtKB)
IEA
GO:0044822
O43143 (UniProtKB)
IBA
GO:0044822
O43143 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
O43143 (UniProtKB)
IDA
GO:0071008
O43143 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DHX15基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Myopia 0.12 1 1 GWASCAT
Hepatitis B 0.000271442 1 0 BeFree
Acute GVH disease 0.000271442 1 0 BeFree
Graft-vs-Host Disease 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Urticaria 0.000271442 1 0 BeFree
Clinically isolated syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Gastric Antral Vascular Ectasia 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Skin carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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