COPG1 (COPI coat complex subunit gamma 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
COPG1
locus group:
protein-coding gene
location:
3q21.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
coat protein gamma-cop
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22820
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ENSG00000181789
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uc003els.4
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NM_016128
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HGNC:2236
approved reserved:
1999-09-28

基因染色体位置

基因染色体位置

3q21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

COPG1（Coatomer Protein Complex Subunit Gamma 1）是COPγ1蛋白的编码基因，属于COPI囊泡包被复合体的重要组成部分。COPI复合体参与细胞内蛋白质和脂质的逆向运输（从高尔基体到内质网），对维持细胞内膜结构的动态平衡至关重要。COPγ1与其他COPI亚基（如α、β、β'、δ、ε和ζ）共同形成七聚体复合物，负责识别货物蛋白（如KDEL受体）并促进囊泡形成。该基因家族（COPG基因家族）的共性在于调控囊泡运输的保守机制，其成员在真核生物中高度保守。COPγ1的突变可能导致COPI功能异常，引发内质网应激、分泌途径紊乱，与神经退行性疾病（如遗传性痉挛性截瘫SPG47）、发育迟缓和小头畸形相关。过表达COPγ1可能干扰COPI复合体比例，导致囊泡运输效率下降；而表达降低则会影响内质网回收途径，未折叠蛋白积累引发细胞凋亡。此外，COPγ1与COPA综合征（自身免疫性疾病）存在间接关联，因COPI亚基突变会破坏免疫调节蛋白运输。该基因在癌细胞中常异常表达，可能通过影响生长因子受体运输促进肿瘤进展。

None

无

OMIM数据库中对COPG1基因的介绍     Wikipedia数据库中对COPG1基因的介绍

基因序列

基因序列

COPG1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

COPG1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs15546       rs15648       rs1132458       rs4927906       rs4927907       rs4927910       rs4927911       rs4927912       rs4927913       rs4927914       rs4927937       rs4927938       rs4927939       rs4927940       rs4927941       rs4927942       rs4927943      

基因表达

基因表达

COPG1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGTTGCTGAAGAGGTGTG
59
CTGCTCCAGGACATTTAGGT
60
GTGTTGCTGAAGAGGTGTG
59
CTGCTCCAGGACATTTAGGT
60
TATGAGGATGAGTATGTGCTGG
59
TTCGAAGTTCAGTTTCATGACC
59
CGTACCCTCAATAAGGTTGC
59
ATCTGTGACCAGGTTCTCC
59
GTGTCAGAAATATCCTCGCA
58
TTATACTCAAAGCCACCCTC
57
AGTTCACTGTCAAGGACTG
57
TCAACTGTGACTCACATACTC
58
CTGACAATGCCTTCTTCCC
59
CATGGTGCTATCAGTGATCTG
59
GATGAGGAGTCAGGTGGAG
58
ATTTCCGAGGGTTGATGGG
59
GATGAGGAGTCAGGTGGAG
59
GAGCAAATGTCACTTGCCT
59
ACAAGAAGGATGAGGAGTCAG
59
TTAAATACACGGGCCTCCT
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

COPG1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

COPG1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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H0Y8G2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006886
H0Y8G2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016192
H0Y8G2 (UniProtKB)
IEA
GO:0030126
H0Y8G2 (UniProtKB)
IEA
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H0Y8X7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006886
H0Y8X7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016192
H0Y8X7 (UniProtKB)
IEA
GO:0030126
H0Y8X7 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
Q9Y678 (UniProtKB)
ISS
GO:0000139
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0005198
Q9Y678 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9Y678 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y678 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y678 (UniProtKB)
IPI
GO:0005789
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0005789
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0005794
Q9Y678 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
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Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
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Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
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Q9Y678 (UniProtKB)
IEA
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Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
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Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0030126
Q9Y678 (UniProtKB)
ISS
GO:0030133
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0030133
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0030133
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0030133
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0030133
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0030133
Q9Y678 (UniProtKB)
TAS
GO:0051683
Q9Y678 (UniProtKB)
ISS
GO:0072384
Q9Y678 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 COPG1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Glioma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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