ASPM (assembly factor for spindle microtubules)

symbol:
ASPM
locus group:
protein-coding gene
location:
1q31.3
gene_family:
alias symbol:
Calmbp1|ASP|FLJ10517|FLJ10549
alias name:
None
entrez id:
259266
ensembl gene id:
ENSG00000066279
ucsc gene id:
uc001gtu.4
refseq accession:
NM_018136
hgnc_id:
HGNC:19048
approved reserved:
2002-08-13
1q31.3
基因染色体位置图

ASPM(Abnormal Spindle Microtubule Assembly)基因位于人类染色体1q31,属于ASPM基因家族,该家族在进化上高度保守,主要参与调控神经细胞的增殖与分化,尤其在脑发育过程中起关键作用。ASPM基因编码的蛋白质是一种中心体相关蛋白,主要功能是维持纺锤体微管的正常组装和稳定性,确保细胞有丝分裂过程中染色体的正确分离,这对神经前体细胞的对称性与不对称性分裂至关重要。该基因在胚胎期大脑皮层发育阶段高表达,直接影响大脑皮层的厚度与神经元数量。ASPM基因突变与原发性小头畸形(MCPH,常表现为脑体积显著减小)密切相关,尤其是MCPH5亚型,突变会导致蛋白质功能丧失,使神经前体细胞提前分化或凋亡,最终导致大脑皮层神经元数量减少。研究发现,ASPM的某些错义突变可能仅引起轻度认知障碍,而无义突变或移码突变则导致更严重的表型。ASPM过表达在某些癌症(如胶质母细胞瘤)中被观察到,可能通过促进肿瘤细胞异常增殖加剧病情;而表达降低则可能引发神经发育迟缓或小头畸形。ASPM基因家族成员普遍含有多个IQ钙调蛋白结合域和N端的微管结合域,这些结构域共同参与细胞周期调控和微管动力学。该基因与MCPH家族其他成员(如WDR62、CDK5RAP2)存在功能协同性,共同维持神经上皮细胞的极性。此外,ASPM在成年期海马体神经发生中仍有低水平表达,暗示其可能参与学习记忆等高级功能。进化分析显示ASPM在灵长类中经历了正向选择,其序列变异可能与人类大脑容量的扩张相关。

This gene is the human ortholog of the Drosophila melanogaster 'abnormal spindle' gene (asp), which is essential for normal mitotic spindle function in embryonic neuroblasts. Studies in mouse also suggest a role of this gene in mitotic spindle regulation, with a preferential role in regulating neurogenesis. Mutations in this gene are associated with microcephaly primary type 5. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, May 2011]

该基因是果蝇‘异常主轴‘基因(ASP),它是在胚胎的成神经细胞的正常有丝分裂纺锤体功能所必需的人类直系同源物。在小鼠研究也表明该基因在有丝分裂纺锤体调控的作用,在调节神经优惠的角色。在这个基因的突变与原发性小头型5.多重转录变异体编码不同亚型也发现了这种基因有关。[由RefSeq的,2011年5月提供]

ASPM基因的碱基序列:[NCBI]
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ASPM基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs12677       rs877897       rs955927       rs964201       rs1034162       rs1332660       rs1332662       rs1332663       rs1412640       rs1412641       rs1537318       rs1537319       rs1571964       rs1888991       rs1953064       rs2026429       rs2151133      

ASPM基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTATAAACTTTACCTGGCTGTG
59
CTTGCTCGAAACCATCTCTG
59
ACTTATTCAGGCTATGTGGAGG
60
CAGGCTTGAATCTTGCAGG
59
TTGACAGAAGATACAGACAGC
58
ATTGCCCAGTATCTTTGCTG
59
ACTTATTCAGGCTATGTGGAGG
60
CAGGCTTGAATCTTGCAGG
59
ATTGGCGAAGAGTCTTAGCA
60
CCAATATCCCTGAATAAGTGATGC
60
GAGCCTATAAACTTTACCTGGC
59
CTCGAAACCATCTCTGAATACAG
59
CATCACTTATTCAGGCTATGTGG
59
CTTGAATCTTGCAGGCAGC
60
TTGACAGAAGATACAGACAGC
58
ATTGCCCAGTATCTTTGCT
57
TTGGCGAAGAGTCTTAGCA
59
CCAATATCCCTGAATAAGTGATGC
60
CATCACTTATTCAGGCTATGTGG
59
CTTGAATCTTGCAGGCAGC
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
BRCA1
ASPM
Activation
FOXJ1
ASPM
Unknown

ASPM基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ASPM基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007051
Q5VYL4 (UniProtKB)
IEA
GO:0001764
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0002052
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005516
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q8IZT6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007051
Q8IZT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0007067
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0008584
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0021873
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0021987
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030496
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0036449
Q8IZT6 (UniProtKB)
IDA
GO:0045665
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0045769
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0048477
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0048589
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0051445
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0051653
Q8IZT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0051661
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0072687
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0090263
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0090306
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0097150
Q8IZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0097431
Q8IZT6 (UniProtKB)
IDA
GO:0097431
Q8IZT6 (UniProtKB)
IDA

可能调控 ASPM基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Microcephaly, Primary Autosomal Recessive, 5 0.44 1 121 CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Salivary Gland Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Adenoid Cystic Carcinoma 0.12 1 0 CTD_human
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Polycystic Ovary Syndrome 0.12 1 0 CTD_human
Microcephaly 0.012625741 13 0 BeFree_GAD_LHGDN
Age related macular degeneration 0.005005506 1 6 BeFree_GAD
Autosomal Recessive Primary Microcephaly 0.00434307 16 0 BeFree
Glioblastoma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Glioma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN

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