AQR (aquarius intron-binding spliceosomal factor)

symbol:
AQR
locus group:
protein-coding gene
location:
15q14
gene_family:
alias symbol:
KIAA0560|fSAP164|IBP160
alias name:
functional spliceosome-associated …
entrez id:
9716
ensembl gene id:
ENSG00000021776
ucsc gene id:
uc001ziv.4
refseq accession:
NM_014691
hgnc_id:
HGNC:29513
approved reserved:
2004-06-24
15q14
基因染色体位置图

AQR(也称为 Aquarius或Intron-binding protein of 160 kDa)是一个参与RNA剪接的基因,属于RNA解旋酶基因家族(DEAD-box家族)。该基因编码的蛋白质在RNA剪接过程中发挥重要作用,特别是在识别和结合内含子区域,帮助剪接体正确组装并促进内含子的移除。AQR蛋白具有解旋酶活性,能够解开RNA二级结构,确保剪接反应的精确性。该基因在多种组织中广泛表达,尤其在增殖活跃的细胞中表达较高。AQR的功能异常可能导致剪接错误,进而影响mRNA的成熟和蛋白质的正常合成。研究发现,AQR的突变或表达异常可能与某些癌症的发生发展相关,例如白血病和实体瘤,因为错误的剪接可能导致致癌基因的异常激活或抑癌基因的功能丧失。如果AQR过表达,可能会增强RNA剪接效率,但也可能导致异常剪接事件的增加,从而产生非功能性或有害的mRNA异构体。相反,AQR表达降低可能导致剪接效率下降,影响正常基因表达,甚至引发细胞凋亡或增殖异常。AQR所属的DEAD-box家族是一类依赖ATP的RNA解旋酶,其成员在RNA代谢的多个环节(如剪接、转运、翻译和降解)中发挥作用。该家族蛋白的共同特点是含有保守的DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)序列模体,具有ATP酶活性和RNA结合能力。AQR作为该家族的一员,与其他成员协同调控RNA的加工过程,但其在内含子识别和剪接中的功能较为独特。

None

AQR基因的碱基序列:[NCBI]
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AQR基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs717941       rs959478       rs962457       rs963425       rs1055355       rs1055356       rs1376784       rs2044920       rs2044921       rs2060809       rs2060810       rs2060811       rs2060812       rs2123048       rs2123049       rs2123050       rs2198224      

AQR基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCCAACTACTAGAAAGAATGGAG
58
ACAAAGTTTGCCATCTGGG
58
ATGCTCTTGGAATTTAGCCAG
58
TAAATAGGCCTTGCTAGATACCTC
59
AATGCTCTTGGAATTTAGCCAG
59
AAATAGGCCTTGCTAGATACCTC
59
      尚未收录相关数据

AQR基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AQR基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000398
O60306 (UniProtKB)
IC
GO:0005515
O60306 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0006283
O60306 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
O60306 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
O60306 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
O60306 (UniProtKB)
IDA
GO:0071013
O60306 (UniProtKB)
IDA

可能调控 AQR基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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