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麻省大学医学院的一个科学家小组发现了,负责调控天然免疫的一种长链非编码RNA:lincRNA-EPS。
在巨噬细胞中大量表达的lincRNA-EPS,将触发炎症的一些基因维持在关闭状态直至遭遇到病原体。这一研究发现指出了lincRNAs在免疫系统中从前未知的一种作用,有可能促成对失控性免疫反应引起的一些炎症疾病,如红斑狼疮或炎症性肠病的新认识。
红斑狼疮是一个累及身体多系统多器官,临床表现复杂,病程迁延反复的自身免疫性疾病。
炎症性肠病为累及回肠、直肠、结肠的一种特发性肠道炎症性疾病。临床表现腹泻、腹痛,甚至可有血便。本病包括溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病 (CD)。溃疡性结肠炎是结肠黏膜层和黏膜下层连续性炎症,疾病通常先累及直肠,逐渐向全结肠蔓延,克罗恩病可累及全消化道,为非连续性全层炎症,最常累 及部位为末端回肠、结肠和肛周。
研究的资深作者、医学教授Katherine A Fitzgerald说:“这些研究结果表明了一个尚未探索的控制炎症和免疫反应的调控层面。我们已证实了一种lincRNA在免疫系统中发挥重要的功能。”
为了区别它们与microRNA、siRNA、piRNA和其他的小分子RNA,长链非编码RNAs被定义为是长度大于200个核苷酸的一类非蛋白 质编码转录物。人们认为lincRNA可能控制了人类基因组中大多数的RNA转录。Fitzgerald说:“尽管它们含量丰富,当前对于这些长链 RNAs在免疫系统中的功能所知甚少。免疫学家们在试图了解控制免疫系统的复杂遗传环路时,一直都将焦点放在基因组2%的蛋白质编码区域上。”
利用缺失lincRNA-EPS的小鼠模型,Fitzgerald和同事们证实在正常状态下,抵御感染的一种白细胞:巨噬细胞生成lincRNA- EPS阻止了自发性激活一些免疫反应基因。然而,当巨噬细胞检测到一种潜在病原体时,lincRNA-EPS表达受到抑制松开这一刹车,启动了促炎症反 应。缺失的lincRNA-EPS小鼠显示细胞因子和炎症反应水平增高,导致了中毒性休克。
研究人员发现lincRNA-EPS通过控制核小体的位置使得一些免疫基因无法接近,抑制了它们表达。当lincRNA-EPS不再在这些细胞中表 达时,基因组结构发生改变,由此一些至关重要的免疫相关基因会暴露出来进行转录。当研究人员将lincRNA-EPS重新导入到巨噬细胞中时,免疫基因的 表达会恢复至正常水平。
论文的第一作者、麻省大学医学院博士后研究人员Maninjay K. Atianand说:“我们还发现lincRNA-EPS表达自身受到非常精细地调控,对于微小的改变非常敏感。这一lincRNA是阻止自发性激活关键 免疫基因的这一分子回路中一个重要的组件。这些研究发现重要地暗示了lincRNAs在慢性炎症和免疫病理变化中的潜在作用。
下一步Fitzgerald和同事们打算确定lincRNA-EPS在肠炎中所起的作用,以及它在丰富表达的结肠中发挥的功能。
中国医学科学院北京协和医学院的研究人员在新研究中揭示,在基因间长链非编码RNA (lincRNA) LINC00673中的一个胰腺癌风险变异为miR-1231构建了一个结合位点,干扰了PTPN11降解。
斯坦福大学医学院的研究人员发现,古代病毒感染留下的遗传学物质lincRNA在人类发育过程中起到了非常关键的作用。受精的人类卵细胞需要这样的 非编码RNA,才能在早期发育中获得多能性。阻断这些RNA分子的生产,发育就无法继续进行。
2015年10月,来自中科院昆明动物研究所、中国农业科学院的研究人员调查了来自3个猪品种脂肪和肌肉组织中全基因组范围长链基因间非编码RNA的DNA甲基化水平。
小编在基因云馆中也发现了关于PTPN11的信息:
PTPN11基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:细胞核、细胞质、线粒体。
可能调控PTPN11基因的相关microRNA: hsa-miR-124 hsa-miR-218 hsa-miR-130b* 等。
点击这里查看关于PTPN11基因的详细信息。
原文索引:
A Long Noncoding RNA lincRNA-EPS Acts as a Transcriptional Brake to Restrain Inflammation. Cell, 2016; 165 (7): 1672 DOI: 10.1016/j.cell.
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