MRPL53(mitochondrial ribosomal protein L53) 转至新版数据库

基因基本信息

基因基本信息

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基因名称更名时间(date_name_changed)
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收起

基因染色体位置

基因染色体位置

2p13.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

Mammalian mitochondrial ribosomal proteins are encoded by nuclear genes and help in protein synthesis within the mitochondrion. Mitochondrial ribosomes (mitoribosomes) consist of a small 28S subunit and a large 39S subunit. They have an estimated 75% protein to rRNA composition compared to prokaryotic ribosomes, where this ratio is reversed. Another difference between mammalian mitoribosomes and prokaryotic ribosomes is that the latter contain a 5S rRNA. Among different species, the proteins comprising the mitoribosome differ greatly in sequence, and sometimes in biochemical properties, which prevents easy recognition by sequence homology. This gene encodes a 39S subunit protein. A pseudogene corresponding to this gene is found on chromosome 1p. [provided by RefSeq, Jul 2008]

[中文简述(自动翻译):]  哺乳动物线粒体核糖体蛋白由核基因编码，并在线粒体内蛋白合成帮助。线粒体核糖体（mitoribosomes）由28S小亚基和大亚基39S的。它们具有约75％的蛋白质，以rRNA的组合物相比，原核核糖体，其中，该比值是相反的。哺乳动物mitoribosomes和原核核糖体之间的另一个区别是，后者包含一个5S rRNA基因。在不同的物种，包括mitoribosome的蛋白质序列中的生化特性，从而防止容易被识别的序列同源性差异很大，有时。这个基因编码39S亚基蛋白。对应于这个基因的假基因是在染色体1P发现。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对MRPL53基因的介绍     Wikipedia数据库中对MRPL53基因的介绍

基因序列

基因序列

MRPL53基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

MRPL53基因的碱基突变：           显示全部snp
rs1047911       rs10211358       rs13403485       rs17009955       rs72907224       rs75865964       rs77266305       rs78834087       rs80130461       rs111410167       rs114954370       rs116238920       rs139444785       rs139465854       rs139817903       rs141112247       rs141225794       rs141704877       rs141818840       rs142063944       rs142719386       rs143503223       rs144058837       rs144084644       rs144253178       rs145698910       rs146276731       rs147784697       rs148007344       rs148457004       rs150264112       rs150483763       rs150499635       rs150665596       rs180792036       rs183078378       rs183406812      
rs185209590       rs186823767       rs186842178       rs188435383       rs190071582       rs190462504       rs191230645       rs191245557       rs192005199       rs192706789       rs193225742       rs200063050       rs200277765       rs200832708       rs200974445       rs200975054       rs201235080       rs201317513       rs201575358       rs201619200       rs368450432       rs368940611       rs369112361       rs369646888       rs371848475       rs371921047       rs373386772       rs373576604       rs373983045       rs375759411       rs376916232       rs377306440       rs377643409       rs527445621       rs527533201       rs528943277       rs529238618       rs533172945       rs533822729       rs534362179       rs535459657       rs535547076       rs538523273       rs539912277       rs540961329       rs542432394       rs544208048       rs544604941       rs545801523       rs546177308       rs548243695       rs548909444       rs551574159       rs551859314       rs553484653       rs556110174       rs558314776       rs559821151       rs560738510       rs561658806       rs562414139       rs562610256       rs564100906       rs564591979       rs564806090       rs566579950       rs566944658       rs566985362       rs567023905       rs567798366       rs569190969       rs569229455       rs573554583       rs573635972       rs575709548       rs577608479       rs745480815       rs745527914       rs745946740       rs746344630       rs746411133       rs746523936       rs747196565       rs747357280       rs747987917       rs747993270       rs748381328       rs749654917       rs749941866       rs749982181       rs750322294       rs750622503       rs750939456       rs751173436       rs751209111       rs751549336       rs751963833       rs752450308       rs752537798       rs754306336       rs754394582       rs754402698       rs754573897       rs755028889       rs755379043       rs755468918       rs755552236       rs755876758       rs755892460       rs756138183       rs756246933       rs756595580       rs756736209       rs758110127       rs758265593       rs758633639       rs758825200       rs759112785       rs760197888       rs761034366       rs761435493       rs761504383       rs763343765       rs763580206       rs763855401       rs764332714       rs764573776       rs764615150       rs765096550       rs765272614       rs765362426       rs765591182       rs765791179       rs765847354       rs765932036       rs766523940       rs766989268       rs767365172       rs767597639       rs767865404       rs768231556       rs768620975       rs768630208       rs769323820       rs769392763       rs770574428       rs771006399       rs771088613       rs771290858       rs771713387       rs772334961       rs772712287       rs772960887       rs772979888       rs773445656       rs773711840       rs774846636       rs774941124       rs775512008       rs775539372       rs776107782       rs776212577       rs776477681       rs777492410       rs777617698       rs777715298       rs777791767       rs778079553       rs778572124       rs778931418       rs779139769       rs779317088       rs779401249       rs779594580       rs779686577       rs779977284       rs780460509       rs780550322       rs780721569       rs780857185       rs780945153       rs10204697       rs11554617       rs12621618       rs75814234       rs112896280       rs117730568       rs143196002       rs147095737       rs186400388       rs199833153       rs201666517       rs371038424       rs375317196       rs397985027       rs528136232       rs535093623       rs535614967       rs539343416       rs541034466       rs542035269       rs546080826       rs555427622       rs557169558       rs559422647       rs563613529       rs563716983       rs573049621       rs573838455       rs574615587       rs577114272       rs746229425       rs747678189       rs747766347       rs749014275       rs750311137       rs750396824       rs750670928       rs752642124       rs752716333       rs752856417       rs754763476       rs755933197       rs758404363       rs759655674       rs760728912       rs761235979       rs763042946       rs763066742       rs763129716       rs764202844       rs765418126       rs766229187       rs768178943       rs770145941       rs771339272       rs771376628       rs771752993       rs773890839       rs775720800       rs776847633       rs777131002       rs777400597       rs778455139       rs778549382       rs779678862       rs779954207       rs781118811      

基因表达

基因表达

MRPL53基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
TTCAGTTCTGTCCCTTCGA
58
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
TCAACTGCTCAGTGATTGC
59
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
CAACTGCTCAGTGATTGCG
60
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
TCAGTTCTGTCCCTTCGAG
59
TGAGATTAGTGGAGCGGAC
59
TTCAGTTCTGTCCCTTCGA
58
GAGATTAGTGGAGCGGACC
60
TCAGTTCTGTCCCTTCGAG
59
GAGATTAGTGGAGCGGACC
60
CTCAACTGCTCAGTGATTGC
60
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
TCAGTTCTGTCCCTTCGAG
59
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
TTCAGTTCTGTCCCTTCGAG
60
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

MRPL53基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

MRPL53基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q96EL3(UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96EL3(UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96EL3(UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96EL3(UniProtKB)
IPI
GO:0005743
Q96EL3(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3(UniProtKB)
TAS
GO:0005840
Q96EL3(UniProtKB)
IEA
GO:0070125
Q96EL3(UniProtKB)
TAS
GO:0070126
Q96EL3(UniProtKB)
TAS

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控MRPL53基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关文献

基因相关文献

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基因相关服务

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