SLC39A8 (solute carrier family 39 member 8)

symbol:
SLC39A8
locus group:
protein-coding gene
location:
4q24
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
BIGM103|ZIP8|ZIP-8
alias name:
Metal cation symporter ZIP8|BCG-in…
entrez id:
64116
ensembl gene id:
ENSG00000138821
ucsc gene id:
uc011ceo.2
refseq accession:
NM_022154
hgnc_id:
HGNC:20862
approved reserved:
2003-10-08
4q24
基因染色体位置图

SLC39A8(溶质载体家族39成员8)属于SLC39基因家族,也称为ZIP(Zrt/Irt-like protein)家族,该家族成员主要负责锌、铁等二价金属离子的跨膜转运。SLC39A8编码的蛋白质是一种锌/铁转运蛋白,主要表达在肠道、肝脏、肾脏和胎盘等组织,其功能是将锌和铁从细胞外或细胞器内转运到细胞质中,对维持体内金属离子稳态至关重要。SLC39A8的生物学功能涉及多种生理过程,包括免疫调节、胚胎发育、神经功能和代谢调控。该基因的突变可能导致其转运功能受损,与多种疾病相关,如先天性糖基化障碍(CDG-IIb)、克罗恩病、帕金森病和精神分裂症等。SLC39A8功能缺失突变会导致锌和锰的吸收障碍,引发严重的发育迟缓、小头畸形和癫痫发作。过表达SLC39A8可能增加细胞内锌和铁的水平,导致氧化应激和细胞损伤,与某些癌症和神经退行性疾病的发展有关。降低SLC39A8表达则可能引起锌和铁缺乏,影响免疫功能、伤口愈合和认知功能。SLC39A8还与其他基因相互作用,如与金属硫蛋白(MT)和锌转运蛋白(ZnT)家族成员共同调节细胞内锌平衡。SLC39基因家族的共性是其成员均含有8个跨膜结构域,并在细胞膜或细胞器膜上介导二价金属离子的摄取。SLC39A8的研究为理解金属代谢相关疾病的机制提供了重要线索,并可能成为治疗这些疾病的潜在靶点。

This gene encodes a member of the SLC39 family of solute-carrier genes, which show structural characteristics of zinc transporters. The encoded protein is glycosylated and found in the plasma membrane and mitochondria, and functions in the cellular import of zinc at the onset of inflammation. It is also thought to be the primary transporter of the toxic cation cadmium, which is found in cigarette smoke. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. Additional alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but their full-length nature is not known. [provided by RefSeq, Oct 2008]

该基因编码的SLC39家族的溶质载体的基因,其显示锌转运的结构特征的成员。所编码的蛋白质是糖基化,并且在锌在炎症发作蜂窝进口质膜和线粒体,和功能找到。它也被认为是有毒的阳离子镉,这是在香烟烟雾中发现的主要转运蛋白。已发现该基因编码不同亚型的多个抄本变形。这种基因的附加可变剪接转录物变体已有描述,但是它们的全长性质是未知的。 [由RefSeq的,2008年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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SLC39A8基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9331       rs9705       rs63519       rs149268       rs151368       rs151369       rs151370       rs151371       rs151372       rs151388       rs151390       rs151392       rs151393       rs151394       rs151395       rs151396       rs151397      

SLC39A8基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTTGAGAAGGCAGTTGCT
60
GTATGACCATTCTGACCATATGTC
59
CACGAGTTAGGAGACTTTGTG
59
TGCAGAAAGGAAGTTGAATAGC
59
CACGAGTTAGGAGACTTTGTG
59
TGCAGAAAGGAAGTTGAATAGC
59
CAAGTCATTCAGAAGTTTGGG
58
TGCCTCTGGAATAAGTTGG
57
TTCTGGGCTTCTGTTTAACTG
59
ATTTGGAGCTGGTTATTTGGG
59
CTATGCAAATCCTGCTGTCAC
60
TTCTGAACGCTGTAGAGATACC
60
GTCTTACGTTGACACGCAG
59
GATCTCTTCAGCAGTTAAACACTC
60
GTCCAGCAGTCTTACAGCA
60
TCCAAATGCCTTCTGAATGAC
59
GGGATTTCTGTGTTTAACTGCT
59
AATTTGGAGCTGGTTATTTGGG
60
CACGAGTTAGGAGACTTTGTG
59
TGCAGAAAGGAAGTTGAATAGC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
SP1
SLC39A8
Activation

SLC39A8基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC39A8基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005385
Q9C0K1 (UniProtKB)
IBA
GO:0005385
Q9C0K1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9C0K1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q9C0K1 (UniProtKB)
IBA
GO:0006829
Q9C0K1 (UniProtKB)
IMP
GO:0006882
Q9C0K1 (UniProtKB)
IBA
GO:0031090
Q9C0K1 (UniProtKB)
IDA
GO:0070574
Q9C0K1 (UniProtKB)
IEA
GO:0071578
Q9C0K1 (UniProtKB)
IBA

可能调控 SLC39A8基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Blood pressure finding 0.124734064 2 1 GAD_GWASCAT
Systemic arterial pressure 0.124734064 2 1 GAD_GWASCAT
Hypertensive disease 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Coronary Artery Disease 0.004734064 1 1 GAD
Malignant neoplasm of prostate 0.002367032 1 0 GAD
Degenerative polyarthritis 0.000542884 2 0 BeFree
HIV Infections 0.000271442 1 0 BeFree
Arteriosclerosis 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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