SF1 (splicing factor 1)

symbol:
SF1
locus group:
protein-coding gene
location:
11q13.1
gene_family:
Zinc fingers, CCHC-type
alias symbol:
ZFM1|ZCCHC25
alias name:
None
entrez id:
7536
ensembl gene id:
ENSG00000168066
ucsc gene id:
uc001obc.3
refseq accession:
NM_004630
hgnc_id:
HGNC:12950
approved reserved:
1994-09-27
11q13.1
基因染色体位置图

SF1(Steroidogenic Factor 1,类固醇生成因子1)是一种核受体转录因子,属于核受体超家族NR5A亚家族(包括SF1和LRH1等成员),主要调控类固醇激素合成、性腺发育及下丘脑-垂体-肾上腺/性腺轴功能。其生物学功能包括激活类固醇合成酶基因(如CYP11A1、CYP17A1、CYP19A1)的表达,参与胆固醇代谢,并在肾上腺、睾丸、卵巢等内分泌组织中高表达。SF1通过结合靶基因启动子区的特定DNA序列(如类固醇生成因子响应元件)调控下游基因转录。突变可能导致肾上腺发育不全(如先天性肾上腺发育不良)、性反转(46,XY性别发育障碍)或激素合成缺陷(如醛固酮缺乏)。与疾病的关系涉及多囊卵巢综合征(PCOS)、肾上腺皮质癌及某些性发育异常疾病。过表达可能引发激素过度分泌(如肾上腺增生)或肿瘤发生,而表达降低则导致性腺发育异常、激素缺乏或不育。NR5A家族共性为通过保守的锌指结构域结合DNA,调控代谢和发育相关基因。专业术语解释:核受体(直接结合DNA调控基因的蛋白质)、转录因子(调控基因转录的蛋白质)、性反转(染色体性别与表型性别不一致)。若存在翻译争议,"Steroidogenic Factor 1"可保留英文原名。

This gene encodes a nuclear pre-mRNA splicing factor. The encoded protein specifically recognizes the intron branch point sequence and is required for the early stages of spliceosome assembly. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2010]

该基因编码一个核前体mRNA剪接因子。所编码的蛋白质特异性地识别所述内含子分支点序列和所需的剪接组装的早期阶段。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2010年5月提供]

SF1基因的碱基序列:[NCBI]
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SF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs474707       rs484886       rs487105       rs523200       rs523964       rs561158       rs574768       rs575375       rs593394       rs606458       rs621723       rs633380       rs633923       rs637732       rs665362       rs673224       rs680273      

SF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTCCAATGGATCAGTACCT
58
ATCATGCCCATAGGTGGTG
59
GACTTCCCAAGTAAGAAGCG
58
TGTCTTCTGTTCCATTGTGTC
58
CTCTCCTCCCTCTTTGTGC
59
TACTTGGGAAGTCCAACGG
59
CTCCTCCAATGGTACCTGG
59
CATCATGCCCATAGGTGGT
59
AATGGTCCCTGCTCTTTCC
59
CATCATGCCCATAGGTGGT
59
AGGAATGCCTACAGTTATTCC
57
TCTTCTATCTGCAGTTGCAC
58
CAACTAAACCAAGGGTCCC
58
CTCTGTGATGAGGTTGTGC
58
CAATGGGTAAATCAGTACCTGG
58
ATCATGCCCATAGGTGGTG
59
GAAGATGAGCCACTTCATGC
59
CAGGATGTTTCTTATCTGTTCCAC
59
TTAACACCCGAGAGTTCCG
59
TTGCTGGAGGTTTGTAATCTG
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
SF1
AMH
Activation
SF1
AMH
Unknown
SF1
CYP11A1
Activation
SF1
HSD3B2
Unknown
SF1
LHB
Unknown
SF1
MC2R
Activation
SF1
NR0B1
Unknown
SF1
SF3B1
Unknown
SF1
SOX9
Unknown
SF1
STAR
Unknown

SF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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C9J792 (UniProtKB)
IEA
GO:0045131
C9J792 (UniProtKB)
IEA
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H7BZT1 (UniProtKB)
IEA
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H7BZT1 (UniProtKB)
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H7C561 (UniProtKB)
IEA
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H7C561 (UniProtKB)
IEA
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Q15637 (UniProtKB)
NAS
GO:0000389
Q15637 (UniProtKB)
TAS
GO:0000398
Q15637 (UniProtKB)
IC
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Q15637 (UniProtKB)
TAS
GO:0003723
Q15637 (UniProtKB)
TAS
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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Q15637 (UniProtKB)
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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Q15637 (UniProtKB)
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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Q15637 (UniProtKB)
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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Q15637 (UniProtKB)
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IPI
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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IPI
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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Q15637 (UniProtKB)
IPI
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IPI
GO:0005515
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IPI
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Q15637 (UniProtKB)
NAS
GO:0005654
Q15637 (UniProtKB)
IDA
GO:0005681
Q15637 (UniProtKB)
IDA
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Q15637 (UniProtKB)
NAS
GO:0006351
Q15637 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q15637 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q15637 (UniProtKB)
IEA
GO:0030238
Q15637 (UniProtKB)
IEA
GO:0033327
Q15637 (UniProtKB)
IEA
GO:0042802
Q15637 (UniProtKB)
IPI
GO:0042802
Q15637 (UniProtKB)
IPI
GO:0044822
Q15637 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q15637 (UniProtKB)
IDA
GO:0048662
Q15637 (UniProtKB)
IEA
GO:0050810
Q15637 (UniProtKB)
IEA
GO:1903507
Q15637 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SF1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.12 1 0 CTD_human
Ischemia 0.08 1 0 RGD
Gout 0.002367032 1 1 GAD
Multiple Endocrine Neoplasia Type 1 0.001085767 4 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Adrenocortical carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
ovarian neoplasm 0.000271442 1 0 BeFree
Agenesis of corpus callosum 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

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