RTN1 (reticulon 1)

symbol:
RTN1
locus group:
protein-coding gene
location:
14q23.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
6252
ensembl gene id:
ENSG00000139970
ucsc gene id:
uc001xek.3
refseq accession:
NM_001363702
hgnc_id:
HGNC:10467
approved reserved:
1993-08-24
14q23.1
基因染色体位置图

RTN1(网状蛋白1,英文全称Reticulon 1)属于网状蛋白(Reticulon,RTN)基因家族,该家族在哺乳动物中包含四个成员(RTN1-4),其共同特点是编码的蛋白质均含有保守的网状蛋白结构域(Reticulon homology domain, RHD),该结构域能形成管状内质网结构,参与内质网形态维持、膜弯曲和囊泡运输等过程。RTN1基因通过选择性剪接产生多个亚型(如RTN1-A/B/C),其表达产物主要定位于内质网和高尔基体,在神经元中尤为丰富,参与神经突生长、轴突再生和突触可塑性调控。RTN1的生物学功能包括:(1)通过RHD结构域调控内质网形态;(2)与BACE1(β-分泌酶)相互作用,抑制β-淀粉样蛋白(Aβ)生成,可能影响阿尔茨海默病发展;(3)通过调节内质网钙离子稳态参与细胞凋亡信号通路。突变或表达异常可能导致神经退行性疾病,例如RTN1-C亚型缺失会加剧Aβ沉积,而RTN1过表达可降低BACE1活性从而减少Aβ产生。RTN1还与癌症相关,其表达下调常见于胶质瘤和乳腺癌,可能通过影响内质网应激反应促进肿瘤进展。基因家族共性方面,所有RTN成员均含RHD结构域,参与内质网重构和神经发育,但各亚型具有组织特异性分布,例如RTN4(又称Nogo)以抑制中枢神经再生著称。RTN1表达水平变化会产生多效性影响:过表达可能增强神经保护作用但抑制轴突生长,而低表达可能加剧神经退行性病变或肿瘤转移风险。专业术语解释:内质网(细胞内负责蛋白质合成和钙储存的细胞器)、BACE1(切割淀粉样前体蛋白产生阿尔茨海默病关键致病物质Aβ的酶)、RHD(介导膜弯曲的保守蛋白结构域)。目前中文术语"网状蛋白"为直译,部分文献也使用"网腔蛋白"(英文Reticulon)。

This gene belongs to the family of reticulon encoding genes. Reticulons are associated with the endoplasmic reticulum, and are involved in neuroendocrine secretion or in membrane trafficking in neuroendocrine cells. This gene is considered to be a specific marker for neurological diseases and cancer, and is a potential molecular target for therapy. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2011]

该基??因属于家庭的浆膜蛋白编码基因。 Reticulons与内质网相关联,并且涉及神经内分泌分泌或在神经内分泌细胞膜运输。该基因被认为是神经系统疾病和癌症的特异性标记物,并且是用于治疗的潜在分子靶点。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2011年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
RTN1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2224313       rs4899000       rs8005598       rs57261584       rs67577565       rs75087531       rs111425527       rs111437342       rs112327279       rs113951299       rs115893219       rs116210805       rs138201251       rs139409739       rs140502510       rs143298967       rs144945227      

RTN1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTTTCAAGGCCTACTTGG
58
CTGTTCACGTAGAACTGCA
58
CCTTTCAAGGCCTACTTGG
58
CTGTTCACGTAGAACTGCA
58
CCTTTCAATTTGCAGTCCTG
58
GTGCTTAACATACACTACAGGT
58
TGGAACAGAACCATCTGCT
59
CTTTGCTTCTTTGATGGCG
58
ATTTGCAGTCCTGATGTGG
58
CTCTTACCCATGAGCAGCA
59
AAAGTCAGGCTATTGACCTG
58
ACTTGTAGATGCGGAAACTG
58
CTGTAGTGTATGTTAAGCACCA
58
TAGCCTGAATCTTTGCCAC
57
TGGAACAGAACCATCTGCT
59
CTTTGCTTCTTTGATGGCG
58
CTTCCTTGTCCAGGACCTG
60
CTCTTACCCATGAGCAGCA
60
AGTTTGCAGTCCTGATGTG
58
TTGAAACCACAGCCATGAG
58
      尚未收录相关数据

RTN1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RTN1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005789
A8MT72 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A8MT72 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q16799 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16799 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16799 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16799 (UniProtKB)
IPI
GO:0005789
Q16799 (UniProtKB)
IDA
GO:0030176
Q16799 (UniProtKB)
TAS
GO:0030182
Q16799 (UniProtKB)
IEP
GO:0005789
Q2NKQ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q2NKQ5 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RTN1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Myocardial Ischemia 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Low Back Pain 0.000271442 1 0 BeFree
Lung diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Influenza 0.000271442 1 0 BeFree
Gastrointestinal Stromal Tumors 0.000271442 1 0 BeFree
ESTROGEN RESISTANCE 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Spastic Paraplegia, Hereditary 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。