PRAMEF1 (PRAME family member 1)

symbol:
PRAMEF1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p36.21
gene_family:
PRAME family
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
65121
ensembl gene id:
ENSG00000116721
ucsc gene id:
uc031tpg.1
refseq accession:
NM_023013
hgnc_id:
HGNC:28840
approved reserved:
2005-06-13
1p36.21
基因染色体位置图

PRAMEF1(Prame Family Member 1)属于PRAME基因家族,该家族是一组在多种癌症中高表达的肿瘤相关基因,其成员通常编码含有富含亮氨酸重复序列的蛋白质,参与细胞增殖、分化和免疫逃逸等过程。PRAMEF1位于人类染色体1p36.21区域,其表达产物可能作为一种癌睾丸抗原(CTA),在正常组织中表达受限,但在多种肿瘤中异常高表达,如黑色素瘤、白血病和肺癌等。PRAMEF1的生物学功能尚未完全阐明,但研究表明它可能通过调控细胞周期或表观遗传修饰(如组蛋白甲基化)影响肿瘤发生。该基因的突变或异常表达可能破坏正常细胞增殖调控,导致肿瘤进展。PRAMEF1过表达可能促进肿瘤细胞增殖、迁移和免疫逃逸,而降低表达可能抑制这些恶性表型。PRAME基因家族的共性包括在生殖细胞和肿瘤细胞中的选择性表达、参与免疫调节以及潜在的表观遗传调控功能。PRAMEF1与PRAME家族其他成员(如PRAME本身)具有序列相似性,但可能存在功能分化。目前研究提示PRAMEF1可能作为肿瘤诊断标志物或免疫治疗靶点,但其具体机制仍需进一步探索。

This gene is a member of the PRAME (preferentially expressed antigen of melanoma) gene family which is expressed in many cancers but may function in reproductive tissues during development. Alternative promoter usage generates two transcript variants, which encode different isoforms. [provided by RefSeq, Jun 2014]

该基因是PRAME的成员(优先表达黑色素瘤抗原)基因家族是在许多癌症中表达,但在开发过程中的生殖组织可以发挥作用。另类用法子生成两个转录变异体,其编码不同的亚型。 [由RefSeq的,2014年6月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PRAMEF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1052908       rs1063755       rs1063763       rs1063766       rs1063767       rs1063768       rs1063769       rs1063770       rs1063771       rs1063774       rs1063775       rs1063776       rs1063777       rs1063778       rs1063779       rs1063780       rs1063781      

PRAMEF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTGAACTCCAGGAAAGGTG
57
GTCTTCTTCCAATAGGTAGCC
58
ACGCTTCATTTGGAGACCT
59
CTTGAAGTTTCCACCTCCTG
59
TCCTGTCTCTGATTCCCTG
58
AATTCCAAGTTCTCCAAGGG
58
GACGCTTCATTTGGAGACC
59
TGAAGTTTCCACCTCCTGG
59
ATCCTGTCTCTGATTCCCTG
59
ATTCCAAGTTCTCCAAGGG
57
TTTGAACTCCAGGAAAGGTG
58
TCTTCTTCCAATAGGTAGCCA
58
TTGAACTCCAGGAAAGGTG
57
TCTTCTTCCAATAGGTAGCCA
58
TCCTGTCTCTGATTCCCTG
58
ATTCCAAGTTCTCCAAGGG
57
ACGCTTCATTTGGAGACCT
59
TGAAGTTTCCACCTCCTGG
59
      尚未收录相关数据

PRAMEF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PRAMEF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008284
O95521 (UniProtKB)
IEA
GO:0042974
O95521 (UniProtKB)
IEA
GO:0043066
O95521 (UniProtKB)
IEA
GO:0045596
O95521 (UniProtKB)
IEA
GO:0045892
O95521 (UniProtKB)
IEA
GO:0048387
O95521 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PRAMEF1基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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