NXF2 (nuclear RNA export factor 2)

symbol:
NXF2
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq22.1
gene_family:
alias symbol:
CT39|TAPL-2
alias name:
cancer/testis antigen 39|TAP like …
entrez id:
56001
ensembl gene id:
ENSG00000269405
ucsc gene id:
uc004eix.5
refseq accession:
NM_017809
hgnc_id:
HGNC:8072
approved reserved:
2000-06-09
Xq22.1
基因染色体位置图

NXF2(Nuclear RNA Export Factor 2)属于NXF基因家族,该家族成员主要参与mRNA的核质转运过程,确保RNA从细胞核高效运输到细胞质。NXF家族蛋白的共同特点是含有保守的RNA结合域(RBD)和核转运相关结构域,能够与RNA分子及核孔复合物相互作用。NXF2在睾丸组织中高表达,可能参与精子发生过程中的RNA转运调控,但其具体生物学功能尚未完全阐明。与家族中更典型的成员NXF1(TAP)相比,NXF2的RNA输出活性较弱,暗示其可能具有特殊底物偏好或调控功能。NXF2的表达产物通过与核转运受体NXT1形成异源二聚体发挥作用,这种复合物能识别特定mRNA的转运信号。突变研究表明,NXF2的功能异常可能影响生殖细胞发育,但尚未发现与明确疾病的直接关联。当NXF2过表达时,可能干扰正常mRNA转运的平衡,导致生殖细胞中RNA代谢紊乱;而表达降低则可能影响精子发生相关mRNA的定位。值得注意的是,NXF2在多种癌症中呈现异常表达模式,可能与肿瘤发生相关,但具体机制仍需进一步研究。该基因家族在进化上高度保守,从酵母到人类都存在功能类似物,反映出RNA转运机制的基础性作用。目前对NXF2的认识仍有限,其精确的生理功能、调控网络以及与疾病的关系仍是活跃的研究领域。

This gene encodes a member of a family of nuclear RNA export proteins. The encoded protein is associated with the nuclear envelope and aids in the export of mRNAs. There is a closely related paralog of this gene located adjacent on chromosome X and on the opposite strand. [provided by RefSeq, Aug 2013]

该基因编码一个家族核RNA输出蛋白质的成员。所编码的蛋白质是与mRNA的出口核膜和辅助相关联。有该基因位于X染色体上,而在相对链相邻的一个密切相关的旁系。 [由RefSeq的,2013年8月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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NXF2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782805559       rs782786169       rs782802034       rs782776078       rs782778596       rs782761880       rs782775076       rs782760617       rs782758086       rs782752244       rs782753867       rs782746819       rs782741314       rs782746058       rs782728584       rs782733661       rs782726245      

NXF2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGCTCGAAGAGCTATGG
58
CGGATGGCACTTACATAGG
58
GAAGCTCGAAGAGCTATGG
58
CGGATGGCACTTACATAGG
58
ATGGAGATGCTAAAGCTGAC
58
GTCAAAGCGGAGATTCTGG
59
ATGGAGATGCTAAAGCTGAC
58
GTCAAAGCGGAGATTCTGG
59
AAATGGAGATGCTAAAGCTGAC
59
CAAAGCGGAGATTCTGGAG
58
AAATGGAGATGCTAAAGCTGAC
59
CAAAGCGGAGATTCTGGAG
58
      尚未收录相关数据

NXF2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NXF2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000166
Q9GZY0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
Q9GZY0 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
Q9GZY0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9GZY0 (UniProtKB)
ISS
GO:0005634
Q9GZY0 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
Q9GZY0 (UniProtKB)
ISS
GO:0006406
Q9GZY0 (UniProtKB)
NAS
GO:0007275
Q9GZY0 (UniProtKB)
ISS
GO:0016973
Q9GZY0 (UniProtKB)
IBA
GO:0042272
Q9GZY0 (UniProtKB)
NAS
GO:0044822
Q9GZY0 (UniProtKB)
IBA
GO:0050658
Q9GZY0 (UniProtKB)
ISS

可能调控 NXF2基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Seminoma 0.000271442 1 0 BeFree
Azoospermia, Nonobstructive 0.000271442 1 0 BeFree

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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