MRPL53 (mitochondrial ribosomal protein L53)

symbol:
MRPL53
locus group:
protein-coding gene
location:
2p13.1
gene_family:
Mitochondrial ribosomal proteins
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None
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116540
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HGNC:16684
approved reserved:
2001-10-12
2p13.1
基因染色体位置图

MRPL53(Mitochondrial Ribosomal Protein L53)是线粒体核糖体大亚基的一个组成部分,属于线粒体核糖体蛋白(MRP)基因家族。该家族成员共同参与线粒体核糖体的组装和功能,协助线粒体DNA(mtDNA)编码的蛋白质合成。线粒体核糖体负责翻译线粒体基因组中的13个关键氧化磷酸化(OXPHOS)相关蛋白,这些蛋白对细胞能量(ATP)的产生至关重要。MRPL53作为结构蛋白,与其他MRP成员共同维持核糖体的稳定性,确保线粒体内蛋白质合成的准确性。若MRPL53发生突变,可能导致线粒体核糖体组装缺陷,进而影响OXPHOS复合体的形成,引发细胞能量代谢障碍。这与多种线粒体疾病相关,如 Leigh综合征(一种神经退行性疾病)和心肌病等。MRPL53过表达可能干扰核糖体平衡,导致线粒体翻译过度激活,引发氧化应激或异常细胞凋亡;而表达降低则可能减少线粒体蛋白合成,导致能量不足,影响高耗能组织(如肌肉、神经)。该基因家族(MRP)的共性包括:定位于线粒体基质、高度保守的碱性蛋白特性,以及依赖核基因组编码后转运至线粒体的特点。目前研究还发现MRPL53可能与癌症进展相关,因其表达异常可影响肿瘤细胞的能量代谢适应性。专业术语解释:氧化磷酸化(OXPHOS)是线粒体内通过电子传递链生成ATP的过程;线粒体疾病指因线粒体功能缺陷导致的遗传性疾病,常累及多器官系统。

Mammalian mitochondrial ribosomal proteins are encoded by nuclear genes and help in protein synthesis within the mitochondrion. Mitochondrial ribosomes (mitoribosomes) consist of a small 28S subunit and a large 39S subunit. They have an estimated 75% protein to rRNA composition compared to prokaryotic ribosomes, where this ratio is reversed. Another difference between mammalian mitoribosomes and prokaryotic ribosomes is that the latter contain a 5S rRNA. Among different species, the proteins comprising the mitoribosome differ greatly in sequence, and sometimes in biochemical properties, which prevents easy recognition by sequence homology. This gene encodes a 39S subunit protein. A pseudogene corresponding to this gene is found on chromosome 1p. [provided by RefSeq, Jul 2008]

哺乳动物线粒体核糖体蛋白由核基因编码,并在线粒体内蛋白合成帮助。线粒体核糖体(mitoribosomes)由28S小亚基和大亚基39S的。它们具有约75%的蛋白质,以rRNA的组合物相比,原核核糖体,其中,该比值是相反的。哺乳动物mitoribosomes和原核核糖体之间的另一个区别是,后者包含一个5S rRNA基因。在不同的物种,包括mitoribosome的蛋白质序列中的生化特性,从而防止容易被识别的序列同源性差异很大,有时。这个基因编码39S亚基蛋白。对应于这个基因的假基因是在染色体1P发现。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

MRPL53基因的碱基序列:[NCBI]
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MRPL53基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1047911       rs10211358       rs13403485       rs17009955       rs72907224       rs75865964       rs77266305       rs78834087       rs80130461       rs111410167       rs114954370       rs116238920       rs139444785       rs139465854       rs139817903       rs141112247       rs141225794      

MRPL53基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCAGTTCTGTCCCTTCGA
58
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
TTCAGTTCTGTCCCTTCGA
58
GAGATTAGTGGAGCGGACC
60
CTCAACTGCTCAGTGATTGC
60
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
TCAGTTCTGTCCCTTCGAG
59
TGAGATTAGTGGAGCGGAC
59
TCAACTGCTCAGTGATTGC
59
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
TTCAGTTCTGTCCCTTCGAG
60
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
CAACTGCTCAGTGATTGCG
60
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
TCAGTTCTGTCCCTTCGAG
59
GAGATTAGTGGAGCGGACC
60
TCAGTTCTGTCCCTTCGAG
59
TGTCAGCGACCAGTATCAG
59
      尚未收录相关数据

MRPL53基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MRPL53基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q96EL3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96EL3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96EL3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96EL3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005743
Q96EL3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q96EL3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005840
Q96EL3 (UniProtKB)
IEA
GO:0070125
Q96EL3 (UniProtKB)
TAS
GO:0070126
Q96EL3 (UniProtKB)
TAS

可能调控 MRPL53基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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