FIRRE (firre intergenic repeating RNA element)
- symbol:
- FIRRE
- locus group:
- non-coding RNA
- location:
- Xq26.2
- gene_family:
- Long non-coding RNAs (published)
- alias symbol:
- LINC01200
- alias name:
- functional intergenic repeating RN…
- entrez id:
- 286467
- ensembl gene id:
- ENSG00000213468
- ucsc gene id:
- None
- refseq accession:
- NR_026975
- hgnc_id:
- HGNC:49627
- approved reserved:
- 2014-01-24
FIRRE（功能互作RNA重复元件）是一种长链非编码RNA（lncRNA），位于人类X染色体上，属于一类调控染色质结构和基因表达的RNA分子。它的主要功能是通过形成核内结构域（如核斑点）参与三维基因组组织，调控邻近基因的表达，并在X染色体失活过程中发挥作用。FIRRE通过与多种蛋白质（如hnRNPU和CTCF）相互作用，帮助维持染色质的高级结构，影响基因的时空表达模式。该基因的突变或异常表达可能导致染色质结构紊乱，进而影响X染色体失活和基因调控网络，与某些发育异常和癌症（如白血病）相关。FIRRE过表达可能破坏正常的染色质相互作用，导致基因表达失调，而降低表达则可能影响X染色体稳定性或相关基因的转录效率。FIRRE属于lncRNA家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但通过调控染色质修饰、转录因子活性或作为分子支架参与细胞过程。其家族成员的共性是具有组织特异性表达模式，并在发育、分化和疾病中发挥复杂调控作用。研究FIRRE有助于理解lncRNA在表观遗传调控和疾病机制中的角色。
None
无
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATTCTACATTATGCTTGGTCC
57
ATCTGAGACGAGTCAAGGT
58
ATTCTACATTATGCTTGGTCCG
59
AATCTGAGACGAGTCAAGGT
59
AGTAGAAATGGGAAGACTTGG
57
CTTAGTGATCCATGCCCTC
57
基因本体信息
FIRRE基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：
- 质膜
- 细胞质
- 细胞外
- 高尔基体
- 囊泡
- 细胞骨架
- 内质网
- 细胞核
- 内体
- 溶酶体
- 线粒体
FIRRE基因的本体（GO）信息：
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