CCDC170 (coiled-coil domain containing 170)

symbol:
CCDC170
locus group:
protein-coding gene
location:
6q25.1
gene_family:
alias symbol:
FLJ23305|bA282P11.1
alias name:
None
entrez id:
80129
ensembl gene id:
ENSG00000120262
ucsc gene id:
uc003qol.4
refseq accession:
NM_025059
hgnc_id:
HGNC:21177
approved reserved:
2003-05-22
6q25.1
基因染色体位置图

CCDC170(Coiled-Coil Domain Containing 170)是一种编码含有卷曲螺旋结构域的蛋白质的基因,属于CCDC基因家族。该家族成员通常含有多个卷曲螺旋结构域,这些结构域介导蛋白质之间的相互作用,参与细胞骨架组织、细胞运动、信号传导等生物学过程。CCDC170在乳腺组织中表达较高,研究表明它可能在乳腺发育和乳腺癌发生中发挥作用。该基因的突变或表达异常与乳腺癌风险增加相关,特别是雌激素受体阳性乳腺癌。CCDC170蛋白通过与细胞骨架蛋白相互作用参与细胞形态维持和迁移调控。当CCDC170过表达时,可能促进乳腺癌细胞的侵袭和转移能力,而降低其表达则可能抑制这些恶性表型。此外,CCDC170与ESR1(雌激素受体α)基因相邻,其表达可能受雌激素信号通路调控。在某些乳腺癌病例中,CCDC170与ESR1形成融合基因,导致异常信号激活。CCDC基因家族的共性在于它们编码的蛋白质大多含有卷曲螺旋结构域,这些结构域能够介导蛋白质二聚化或多聚化,从而参与多种细胞过程如细胞分裂、细胞内运输和细胞形态维持。CCDC170作为该家族成员,其功能异常不仅影响乳腺组织,还可能干扰其他依赖细胞骨架动态变化的生理过程。

The function of this gene and its encoded protein is not known. Several genome-wide association studies have implicated the region around this gene to be involved in breast cancer and bone mineral density, but no link to this specific gene has been found. [provided by RefSeq, May 2010]

该基??因的功能和其编码的蛋白质是未知的。几个全基因组关联研究已经牵连解决此基因参与乳腺癌和骨矿物质密度的区域,但这个特定的基因没有任何联系已被发现。 [由RefSeq的,2010年5月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CCDC170基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs871415       rs900194       rs900195       rs900196       rs903801       rs947042       rs953767       rs954238       rs958283       rs958284       rs958285       rs958286       rs962241       rs975459       rs1023938       rs1023939       rs1023940      

CCDC170基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAACTTGGCTTTGACATGC
57
TGTCTTTAGCTTTCTCTGCA
57
AGTCTGAGCTTCAAGACCT
58
TGTAGCTCTCCATTTCAGC
57
TTTAGCTCGAACAGAGCAG
57
TCTGTGTCTTTAGCTTTCTCTG
58
TCAGTCTGAGCTTCAAGACC
59
GCTCTCCATTTCAGCTTTCAG
59
CAGTCTGAGCTTCAAGACCT
59
GCTCTCCATTTCAGCTTTCAG
59
TTTAGCTCGAACAGAGCAG
57
TGTCTTTAGCTTTCTCTGCA
57
      尚未收录相关数据

CCDC170基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCDC170基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q8IYT3 (UniProtKB)
IPI

可能调控 CCDC170基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.123181358 6 4 BeFree_GAD_GWASCAT
Leukemia, Myeloid, Chronic-Phase 0.002367032 1 1 GAD
Breast Carcinoma 0.000814326 3 2 BeFree
Nasopharyngeal carcinoma 0.000271442 1 3 BeFree

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