BEST3 (bestrophin 3)

symbol:
BEST3
locus group:
protein-coding gene
location:
12q15
gene_family:
Bestrophins
alias symbol:
MGC40411|MGC13168
alias name:
None
entrez id:
144453
ensembl gene id:
ENSG00000127325
ucsc gene id:
uc001svg.3
refseq accession:
NM_152439
hgnc_id:
HGNC:17105
approved reserved:
2003-12-03
12q15
基因染色体位置图

BEST3(Bestrophin-3)属于Bestrophin基因家族,该家族编码的蛋白是一类钙离子激活的氯离子通道(CaCCs),主要参与调控细胞膜上的氯离子转运。Bestrophin家族共有四个成员(BEST1-4),其共性在于均含有保守的跨膜结构域,形成同源或异源多聚体通道,影响离子稳态和细胞体积调节。BEST3主要在肾脏、肠道和睾丸等组织中表达,其功能与氯离子分泌、液体平衡及细胞信号传导相关。BEST3蛋白定位于细胞膜和内质网,通过调节氯离子流影响膜电位和细胞内环境稳定。若BEST3发生突变(如错义突变或截短突变),可能导致通道功能丧失或异常,进而干扰组织特异性离子转运,但目前与人类疾病的直接关联尚不明确,仅在小鼠模型中观察到肾脏功能异常。当BEST3过表达时,可能增强氯离子外流,导致细胞膜超极化(静息电位负值增大),影响电兴奋性细胞的活性;若表达降低,则可能损害分泌功能,如肠道液体分泌减少或肾脏电解质紊乱。Bestrophin家族中BEST1的研究最为深入,其突变可引发多种视网膜病变(如Best卵黄样黄斑营养不良),而BEST3与其他成员的相互作用可能通过补偿机制调节整体通道活性。目前针对BEST3的研究较少,其病理意义和调控网络仍需进一步探索。

BEST3 belongs to the bestrophin family of anion channels, which includes BEST1 (MIM 607854), the gene mutant in vitelliform macular dystrophy (VMD; MIM 153700), and 2 other BEST1-like genes, BEST2 (MIM 607335) and BEST4 (MIM 607336). Bestrophins are transmembrane (TM) proteins that share a homology region containing a high content of aromatic residues, including an invariant arg-phe-pro (RFP) motif. The bestrophin genes share a conserved gene structure, with almost identical sizes of the 8 RFP-TM domain-encoding exons and highly conserved exon-intron boundaries. Each of the 4 bestrophin genes has a unique 3-prime end of variable length (Stohr et al., 2002 [PubMed 12032738]; Tsunenari et al., 2003 [PubMed 12907679]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

BEST3属于阴离子通道的bestrophin家族,包括将Best1(M??IM 607854),在卵黄状黄斑营养不良基因突变体(VMD; MIM 153700),以及其他2将Best1样基因,BEST2(MIM 607335)和BEST4(MIM 607336)。 Bestrophins是跨膜(TM),该共享包含芳香族残基,包括一个不变ARG-PHE-PRO(RFP)基序的含量高的同源性区域的蛋白质。所述bestrophin基因共享一个保守的基因结构,与8 RFP-TM结构域编码外显子的几乎相同的尺寸和高度保守的外显子 - 内含子边界。每个4 bestrophin基因的有可变长度的独特的3‘端(斯托尔等,2002 [搜索PubMed 12032738];恒成等,2003 [搜索PubMed 12907679])。[由OMIM,2008年3月提供的]

BEST3基因的碱基序列:[NCBI]
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BEST3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs10906       rs698129       rs698130       rs710710       rs710711       rs710712       rs710713       rs710714       rs710715       rs710716       rs710717       rs710718       rs710719       rs710720       rs710721       rs710722       rs710723      

BEST3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCTACAAACTACTGTACAGGG
58
GGACTCCTGTAAGTAACAATCTG
59
TCATCTTTCGCTCGGTGAG
60
ATAGGCAACATAGTGAGACTCTG
60
GTTTACACCCAGGTAGCAG
58
AATTTCTGTCAATGCACCAG
57
AATCGATACCGCTCTTGGT
59
AAGAGTGACAACCTGGGTG
60
CAATCTCACCTCCCTGCTC
60
CAGTTCTTTCTGCTTCAACCA
59
GTTCCATTCATCTGGTTTGG
57
CGGTATCGATTCATTTCAGTC
57
AATGTTTGGCAGATTCCCTG
59
CATGCCAGTTCTTTCAGTCC
59
GTTTACACCCAGGTAGCAG
58
AATTTCTGTCAATGCACCAG
57
CAATCTCACCTCCCTGCTC
60
CAGTTCTTTCTGCTTCAACCA
59
AATCGATACCGCTCTTGGT
59
AAGAGTGACAACCTGGGTG
60
      尚未收录相关数据

BEST3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BEST3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
F8VR37 (UniProtKB)
IEA
GO:0003674
Q8N1M1 (UniProtKB)
ND
GO:0005887
Q8N1M1 (UniProtKB)
IBA
GO:0008150
Q8N1M1 (UniProtKB)
ND
GO:0034707
Q8N1M1 (UniProtKB)
IBA
GO:0043271
Q8N1M1 (UniProtKB)
IEA
GO:1902476
Q8N1M1 (UniProtKB)
IBA
GO:0005254
Q8N1M1 (UniProtKB)
IBA

可能调控 BEST3基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Inflammatory disorder 0.000271442 1 0 BeFree

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