AHDC1 (AT-hook DNA binding motif containing 1)

symbol:
AHDC1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p36.11-p35.3
gene_family:
alias symbol:
DJ159A19.3|RP1-159A19.1
alias name:
None
entrez id:
27245
ensembl gene id:
ENSG00000126705
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uc057dvu.1
refseq accession:
NM_001029882
hgnc_id:
HGNC:25230
approved reserved:
2005-07-21
1p36.11-p35.3
基因染色体位置图

AHDC1(也称为含AT钩结构域蛋白1)是一个编码含AT钩结构域蛋白的基因,其表达产物主要参与染色质重塑和基因转录调控。AT钩结构域是一种DNA结合基序,能够识别富含AT碱基对的DNA序列,因此AHDC1可能在染色质组织、基因表达调控和细胞分化中发挥作用。该基因在多种组织中表达,尤其在神经系统和胚胎发育过程中可能具有重要功能。AHDC1属于AT钩基因家族,该家族的成员通常含有保守的AT钩结构域,能够与DNA结合并影响染色质结构和基因表达调控。AT钩蛋白家族在细胞增殖、分化和发育中起关键作用,部分成员还与癌症发生相关。目前关于AHDC1的详细功能研究较少,但已知其突变或表达异常可能与某些发育障碍或神经系统疾病相关。如果AHDC1过表达,可能会干扰正常的染色质结构和基因调控网络,导致细胞分化异常或增殖失控,进而可能促进肿瘤发生。相反,如果AHDC1表达降低,可能会影响染色质重塑和特定基因的表达,从而干扰正常发育过程或细胞功能。有研究表明,AHDC1可能与某些智力障碍综合征相关,但其具体机制尚不清楚。此外,AHDC1可能与其他染色质调控蛋白相互作用,共同参与表观遗传调控。由于AT钩蛋白家族成员功能多样且相互关联,AHDC1的功能可能受到家族其他成员的影响或补偿。未来研究需要进一步阐明AHDC1的具体生物学功能、调控机制及其在疾病中的作用。

This gene encodes a protein containing two AT-hooks, which likely function in DNA binding. Mutations in this gene were found in individuals with Xia-Gibbs syndrome. [provided by RefSeq, Jun 2014]

该基因编码含有两个AT-钩,这可能功能中的DNA结合的蛋白质。在这个基因的突变与夏吉布斯综合征患者被发现了。 [由RefSeq的,2014年6月提供]

AHDC1基因的碱基序列:[NCBI]
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AHDC1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs742464       rs742465       rs761070       rs999353       rs1292090       rs1767524       rs1997756       rs1997757       rs2076457       rs2143294       rs2179496       rs2788681       rs3753392       rs3766391       rs3766392       rs4626912       rs4908342      

AHDC1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTTCCAGAGATCTCCAGTG
59
GAGGTAGTCAGGAGAGCTG
58
CTCTTCCAGAGATCTCCAGTG
59
GAAGTTCTAACAAGGGCACG
59
CCTGATTGTCAACCCATCG
58
TTCATCAGCATCTCCAGGG
59
TCTTCCAGAGATCTCCAGTG
58
GAGGTAGTCAGGAGAGCTG
58
CTGATTGTCAACCCATCGG
58
CTTCATCAGCATCTCCAGG
57
TCTTCCAGAGATCTCCAGTG
58
GAAGTTCTAACAAGGGCACG
59
CTCTTCCAGAGATCTCCAGTG
59
GTAGTCAGGAGAGCTGCAC
59
TCTTCCAGAGATCTCCAGTG
58
AAGTTCTAACAAGGGCACG
58
CTGATTGTCAACCCATCGG
58
TTCATCAGCATCTCCAGGG
59
      尚未收录相关数据

AHDC1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AHDC1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
Q5TGY3 (UniProtKB)
IEA

可能调控 AHDC1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
XIA-GIBBS SYNDROME 0.12 0 0 ORPHANET
Poor school performance 0.12 0 3 CLINVAR
Sleep Apnea Syndromes 0.000542884 2 0 BeFree
Expressive language delay 0.000542884 2 0 BeFree

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