AGPAT5 (1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 5)

symbol:
AGPAT5
locus group:
protein-coding gene
location:
8p23.1
gene_family:
1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferases
alias symbol:
FLJ11210|LPAAT-e|LPAAT-epsilon|LPLAT5
alias name:
lysophosphatidic acid acyltransfer…
entrez id:
55326
ensembl gene id:
ENSG00000155189
ucsc gene id:
uc003wqo.4
refseq accession:
NM_018361
hgnc_id:
HGNC:20886
approved reserved:
2004-12-03
8p23.1
基因染色体位置图

AGPAT5(1-酰基甘油-3-磷酸-O-酰基转移酶5)是一种参与甘油磷脂代谢的关键酶,属于AGPAT基因家族(也称为LPAAT家族)。该家族共有11个成员(AGPAT1-11),它们共同的特点是催化溶血磷脂酸(LPA)转化为磷脂酸(PA),这是甘油磷脂和甘油三酯生物合成中的关键步骤。AGPAT5主要在细胞内质网中发挥作用,其表达产物通过调节PA的生成影响细胞膜结构、信号传导和脂质储存。该基因在多种组织中表达,尤其在脂肪组织、肝脏和大脑中活性较高。AGPAT5的功能异常或突变可能导致代谢紊乱,例如影响脂肪细胞分化或脂质代谢平衡,与肥胖、胰岛素抵抗等代谢性疾病相关。研究表明,AGPAT5过表达可能促进甘油三酯合成,导致脂质积累,而降低表达则可能减少PA生成,影响下游信号通路如mTOR的激活。此外,AGPAT家族成员在功能上存在冗余性,但各亚型具有组织特异性分布和不同的酶动力学特性。AGPAT5还可能与某些癌症进展相关,因为PA是促增殖信号分子的前体。需要注意的是,AGPAT5的功能研究相对较少,其具体机制和病理关联仍需进一步探索。

This gene encodes a member of the 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase family. This integral membrane protein converts lysophosphatidic acid to phosphatidic acid, the second step in de novo phospholipid biosynthesis. A pseudogene of this gene is present on the Y chromosome. [provided by RefSeq, Aug 2014]

该基因编码的1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶家族的一个成员。这个完整的膜蛋白溶血磷脂酸转化为磷脂酸,在从头磷脂生物合成中的第二个步骤。该基因的假基因存在于Y染色体上。 [由RefSeq的,2014年8月提供]

AGPAT5基因的碱基序列:[NCBI]
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AGPAT5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs367952       rs377849       rs645643       rs714508       rs929975       rs968118       rs992812       rs992813       rs1046449       rs1121184       rs1300151       rs1365042       rs1365043       rs1425783       rs1425784       rs1425785       rs1425786      

AGPAT5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTTACGGTGGTTTATGAAGG
58
TCTTTGCAGAGAAATTCCGTC
59
GGGTCCAGAATTTCTCTGC
58
TATGTTCTTGTTCTTCTGGGAC
58
TACAGACATACACGTGCCA
59
TTTAATACTGCAAGGCCTGC
59
GCAATTTATGATGTTACGGTGG
59
CTATAAGCATCCCGTCATGG
58
GGCCCTCTTTAACAATATTGC
58
ATGTCAGCAACAATCCAGTC
59
GGCCCTCTTTAACAATATTGC
58
TGTCAGCAACAATCCAGTC
58
GCAATTTATGATGTTACGGTGG
59
TATAAGCATCCCGTCATGGT
59
TACGGTGGTTTATGAAGGGA
59
CATTCTTTGCAGAGAAATTCCG
59
GGGTCCAGAATTTCTCTGC
58
ATGTTCTTGTTCTTCTGGGAC
58
CTACAGACATACACGTGCC
58
TTAATACTGCAAGGCCTGC
58
      尚未收录相关数据

AGPAT5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGPAT5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
E5RH21 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0YC22 (UniProtKB)
IEA
GO:0002244
Q9NUQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0003841
Q9NUQ2 (UniProtKB)
NAS
GO:0003841
Q9NUQ2 (UniProtKB)
TAS
GO:0003841
Q9NUQ2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q9NUQ2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005635
Q9NUQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005739
Q9NUQ2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005741
Q9NUQ2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005789
Q9NUQ2 (UniProtKB)
TAS
GO:0006654
Q9NUQ2 (UniProtKB)
TAS
GO:0008654
Q9NUQ2 (UniProtKB)
NAS
GO:0016021
Q9NUQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016024
Q9NUQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0019432
Q9NUQ2 (UniProtKB)
TAS

可能调控 AGPAT5基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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