AGPAT3 (1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
AGPAT3
locus group:
protein-coding gene
location:
21q22.3
gene_family:
1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferases
alias symbol:
LPAAT-gamma|LPAAT3|LPLAT3
alias name:
1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acy…
entrez id:
56894
ensembl gene id:
ENSG00000160216
ucsc gene id:
uc002zdv.4
refseq accession:
NM_020132
hgnc_id:
HGNC:326
approved reserved:
2000-05-16

基因染色体位置

基因染色体位置

21q22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

AGPAT3（1-酰基甘油-3-磷酸-O-酰基转移酶3）是一种参与甘油磷脂代谢的关键酶，属于AGPAT基因家族（也称为LPAAT家族）。该家族共有11个成员（AGPAT1-11），它们的共性是通过催化溶血磷脂酸（LPA）转化为磷脂酸（PA），这是甘油磷脂和甘油三酯生物合成中的关键步骤。AGPAT3主要在肝脏、脂肪组织和大脑中表达，其功能是将酰基链转移到LPA的sn-2位置，生成PA，进而参与细胞膜形成、信号传导和能量储存。AGPAT3对特定脂肪酸（如不饱和脂肪酸）具有底物偏好性，这可能影响膜脂的物理特性和功能。突变或表达异常可能导致代谢紊乱，如脂肪肝、胰岛素抵抗和肥胖。AGPAT3过表达可能增加甘油三酯合成，促进脂滴积累，而表达降低则可能减少PA和下游脂质（如磷脂酰肌醇）的产生，影响细胞信号传导和膜完整性。此外，AGPAT3与神经发育相关，其异常表达可能影响神经元功能。该基因还与某些癌症（如肝癌）的进展相关，可能通过调节脂代谢促进肿瘤生长。AGPAT家族成员在催化机制上保守，但组织分布和底物特异性不同，共同维持脂质代谢平衡。

The protein encoded by this gene is an acyltransferase that converts lysophosphatidic acid into phosphatidic acid, which is the second step in the de novo phospholipid biosynthetic pathway. The encoded protein may be an integral membrane protein. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是溶血磷脂酸转化成磷脂酸，这是在从头磷脂生物合成途径的第二个步骤的酰基转移酶。所编码的蛋白质可以是完整的膜蛋白。已发现了该基因编码的蛋白质相同的两个转录变异体。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对AGPAT3基因的介绍     Wikipedia数据库中对AGPAT3基因的介绍

基因序列

基因序列

AGPAT3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

AGPAT3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs7435       rs12425       rs13847       rs14151       rs14749       rs395075       rs420826       rs733085       rs743468       rs762404       rs879204       rs879205       rs914196       rs915876       rs999519       rs1005192       rs1006757      

基因表达

基因表达

AGPAT3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAAGGTCCACTGACCTCC
60
AATTCTAGGAGCAAGTCCACC
60
TGTCCTCAAGTACCACCTG
59
TCATAGACAGCTGCGACTG
60
TCTTGTATCCATTTCTGACACG
59
CAGATCACTTGTTTACGAGGTC
59
GTGATGACCAGAGGACCTC
59
ATTCTAGGAGCAAGTCCACC
59
GACTAATTATGCGGCACCC
59
CCACAGGAGACACTATGGA
58
GTGTCGGGTTATTTGGACG
59
AACTGGGTCTTCAGGAAGG
59
GAAGAACGACAAAGGACGG
59
CTCACCACGAAGACAAAGC
59
GTCAAATCAGAGGCTTGTCC
59
AACTGGGTCTTCAGGAAGG
59
AGAGGAAACAAGAACCCGT
59
GAGGAAATCTCCTCACGCA
60
TGCGTGAGGAGATTTCCTC
60
CTCCTGGTACAGTTTATGAAGC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

AGPAT3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGPAT3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
C9J184 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JK35 (UniProtKB)
IEA
GO:0008152
C9JL26 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JL26 (UniProtKB)
IEA
GO:0016746
C9JL26 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JQX8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
Q9NRZ7 (UniProtKB)
TAS
GO:0003841
Q9NRZ7 (UniProtKB)
NAS
GO:0003841
Q9NRZ7 (UniProtKB)
TAS
GO:0003841
Q9NRZ7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005635
Q9NRZ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005783
Q9NRZ7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005789
Q9NRZ7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9NRZ7 (UniProtKB)
IDA
GO:0006654
Q9NRZ7 (UniProtKB)
TAS
GO:0008654
Q9NRZ7 (UniProtKB)
NAS
GO:0016020
Q9NRZ7 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q9NRZ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016024
Q9NRZ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0019432
Q9NRZ7 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 AGPAT3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neurodegenerative Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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