AGMO (alkylglycerol monooxygenase)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
AGMO
locus group:
protein-coding gene
location:
7p21.2
gene_family:
Fatty acid hydroxylase domain containing
alias symbol:
FLJ16237
alias name:
None
entrez id:
392636
ensembl gene id:
ENSG00000187546
ucsc gene id:
uc003stb.1
refseq accession:
NM_001004320
hgnc_id:
HGNC:33784
approved reserved:
2007-11-20

基因染色体位置

基因染色体位置

7p21.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

AGMO（Alkylglycerol Monooxygenase）是一种编码烷基甘油单加氧酶的基因，主要参与醚脂代谢过程。其表达产物AGMO酶负责催化烷基甘油（如1-O-烷基甘油）的羟基化反应，生成相应的1-O-烷基甘油-3-磷酸，这是醚脂生物合成中的关键步骤。醚脂是一类特殊的脂质，在细胞膜结构、信号传导和抗氧化等方面具有重要作用，尤其在脑组织、免疫细胞和血小板中含量较高。AGMO的活性位点依赖于铁离子和四氢生物蝶呤（BH4）作为辅因子，其功能缺陷可能导致醚脂代谢紊乱。突变或功能丧失可能影响神经发育和免疫功能，并与某些遗传性疾病如Rhizomelic Chondrodysplasia Punctata（RCDP）相关，这类疾病表现为骨骼异常、智力障碍和生长迟缓。AGMO过表达可能通过增加醚脂合成影响细胞膜特性或信号通路，而表达降低则可能导致醚脂缺乏，进而干扰髓鞘形成或免疫细胞功能。AGMO属于黄素单加氧酶（FMO）基因家族，该家族成员通常依赖FAD和NADPH催化氧化反应，参与药物代谢和内源性物质转化。AGMO与其他FMO成员不同之处在于其特异性作用于醚脂底物，而非典型的含氮或硫化合物。研究还发现AGMO可能与某些癌症和神经退行性疾病有关，但其具体机制仍需进一步探索。

The protein encoded by this gene is a tetrahydrobiopterin- and iron-dependent enzyme that cleaves the ether bond of alkylglycerols. Sequence comparisons distinguish this protein as forming a third, distinct class of tetrahydrobiopterin-dependent enzymes. Variations in this gene have been associated with decreased glucose-stimulated insulin response, type 2 diabetes, and susceptibility to intracranial aneurysms. [provided by RefSeq, Aug 2012]

由该基因编码的蛋白质是一个tetrahydrobiopterin-和铁依赖性酶劈开烷基甘油的醚键。序列比较区分该蛋白质作为形成第三，不同类四氢依赖性酶。在这种基因的变化已经与降低葡萄糖刺激的胰岛素反应，2型糖尿病，和易感性颅内动脉瘤有关。 [由RefSeq的，2012年8月提供]

OMIM数据库中对AGMO基因的介绍     Wikipedia数据库中对AGMO基因的介绍

基因序列

基因序列

AGMO基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

AGMO基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs763       rs916943       rs978897       rs978898       rs978899       rs1072291       rs1072292       rs1073017       rs1073018       rs1107506       rs1111521       rs1114314       rs1344832       rs1529893       rs1529894       rs1541982       rs1865663      

基因表达

基因表达

AGMO基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAATGGAAAGTGGAAATCCCT
59
GACCAAGGTTATTGATGACCTG
59
TCTTAATGCTGTACCGATTTGG
59
GACAAGTAGGGTGTTTCCTC
58
TCTTCTGGATCAAAGACCCA
58
TGACCAAATCGGTACAGCA
59
TCTTCTGGATCAAAGACCCA
58
TGACCAAATCGGTACAGCA
59
TTTGCAGATACAGCTGCAC
59
AATCCAATGGAAGTCAAGGTC
58
TCTGGATCAAAGACCCAAGG
60
AGGTGACCAAATCGGTACAG
60
CAGATACAGCTGCACTGTC
58
AGAAATCCAATGGAAGTCAAGG
59
CTTAATGCTGTACCGATTTGG
58
GACAAGTAGGGTGTTTCCTC
58
TCTGGATCAAAGACCCAAGG
60
AGGTGACCAAATCGGTACAG
60
GAAATGGAAAGTGGAAATCCCT
59
ACCAAGGTTATTGATGACCTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

AGMO基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGMO基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H7C0E0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005506
Q6ZNB7 (UniProtKB)
IMP
GO:0005783
Q6ZNB7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005789
Q6ZNB7 (UniProtKB)
TAS
GO:0006633
Q6ZNB7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006643
Q6ZNB7 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q6ZNB7 (UniProtKB)
IEA
GO:0019432
Q6ZNB7 (UniProtKB)
TAS
GO:0046485
Q6ZNB7 (UniProtKB)
IDA
GO:0050479
Q6ZNB7 (UniProtKB)
IDA
GO:0050479
Q6ZNB7 (UniProtKB)
TAS
GO:0055114
Q6ZNB7 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 AGMO基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Obesity 0.12 1 1 GWASCAT
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.000271442 1 0 BeFree
Intracranial Aneurysm 0.000271442 1 5 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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