AGGF1P5 (angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1 pseudogene 5)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
AGGF1P5
locus group:
pseudogene
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16p11.1
gene_family:
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NG_022516
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HGNC:51741
approved reserved:
2015-05-18

基因染色体位置

基因染色体位置

16p11.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

AGGF1P5（Angiogenic Factor With G-Patch And FHA Domains 1 Pseudogene 5）是一个假基因，属于AGGF1基因家族。假基因通常是由功能基因复制或逆转录而来，但由于突变积累而失去编码功能蛋白的能力。AGGF1基因家族的主要成员AGGF1（也称为VG5Q）是一个重要的血管生成因子，参与血管发育和内皮细胞功能调控，其突变与Klippel-Trenaunay综合征（一种先天性血管畸形疾病）相关。AGGF1P5作为假基因，目前尚未发现其具有编码功能蛋白的能力，但它可能通过调控其他基因的表达或作为竞争性内源RNA（ceRNA）影响相关信号通路。AGGF1基因家族的共性在于它们通常含有G-patch结构域和FHA结构域，这些结构域参与蛋白质相互作用和信号转导。AGGF1P5的突变或表达变化对机体的直接影响尚不明确，但假基因的异常表达有时会干扰其同源功能基因的表达或功能，从而间接影响相关生物学过程。例如，AGGF1P5的过表达可能通过竞争性结合microRNA或其他调控分子，影响AGGF1或其他血管生成相关基因的表达，进而干扰血管发育或功能。降低AGGF1P5表达的影响也缺乏明确研究，但假基因的缺失或低表达通常被认为对机体影响较小，除非它参与重要的调控网络。目前关于AGGF1P5与疾病关系的研究较少，但假基因的异常表达或突变在某些情况下可能与癌症或血管疾病相关，这需要进一步研究验证。总的来说，AGGF1P5作为AGGF1基因家族的假基因成员，其具体功能尚待深入探索，但它可能通过非编码RNA的形式参与基因表达的调控网络。

None

None

OMIM数据库中对AGGF1P5基因的介绍     Wikipedia数据库中对AGGF1P5基因的介绍

基因序列

基因序列

AGGF1P5基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

AGGF1P5基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

AGGF1P5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCCTGCATCTGTTCATTCTG
59
TTCTCCAACATCATCCGAC
57
GATGTTGGAGAAGATGAGGT
57
CATTCCTACACCATCCTTCC
58
CTGAAATTACTGACAGCAACGA
59
CTTTCTTACCACCTCATCTTCTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

AGGF1P5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGGF1P5基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 AGGF1P5基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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