AGBL5-IT1 (AGBL5 intronic transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
AGBL5-IT1
locus group:
non-coding RNA
location:
2p23.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
106481744
ensembl gene id:
ENSG00000229122
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uc061hjv.1
refseq accession:
None
hgnc_id:
HGNC:41484
approved reserved:
2011-06-08

基因染色体位置

基因染色体位置

2p23.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

AGBL5-IT1是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于AGBL5基因家族的一部分。该家族主要与细胞代谢调控和信号转导相关，其成员通常参与蛋白质修饰或降解过程。AGBL5-IT1本身不编码蛋白质，但通过调控邻近基因AGBL5的表达或其他靶基因的转录后修饰来发挥生物学功能。研究表明，AGBL5-IT1在多种组织中表达，尤其在神经系统和内分泌系统中具有较高活性，可能参与神经元发育和激素分泌调节。该基因的突变可能导致其调控功能异常，进而影响细胞周期或代谢平衡，与某些神经系统疾病或代谢紊乱（如糖尿病）的发病风险相关。当AGBL5-IT1过表达时，可能抑制AGBL5或其他下游基因的正常功能，导致细胞增殖异常或代谢失调；而低表达则可能减弱其对靶基因的调控作用，影响相关信号通路的完整性。目前关于该基因的详细机制仍在研究中，但已发现其表达水平变化与某些癌症（如胶质瘤）的进展存在相关性。AGBL5基因家族的共性在于多数成员编码羧肽酶样蛋白，参与蛋白质翻译后加工，但AGBL5-IT1作为非编码成员通过RNA分子直接参与基因表达调控，展现了该家族功能的多样性。

None

无

OMIM数据库中对AGBL5-IT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对AGBL5-IT1基因的介绍

基因序列

基因序列

AGBL5-IT1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

AGBL5-IT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

AGBL5-IT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGAGTAGCTGGGATTACAGG
59
GAGCTAGAAGAGGCTGACC
59
AGTAGCTGGGATTACAGGC
58
AGAGCTAGAAGAGGCTGAC
58
AGTAGCTGGGATTACAGGC
58
GAGCTAGAAGAGGCTGACC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

AGBL5-IT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGBL5-IT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 AGBL5-IT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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