AGBL4-IT1 (AGBL4 intronic transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
AGBL4-IT1
locus group:
non-coding RNA
location:
1p33
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100874313
ensembl gene id:
ENSG00000225623
ucsc gene id:
uc031tzy.1
refseq accession:
NR_046839
hgnc_id:
HGNC:41482
approved reserved:
2011-06-08

基因染色体位置

基因染色体位置

1p33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

AGBL4-IT1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类染色体1p36.33区域。作为非编码RNA，它不编码蛋白质，但可能通过调控其他基因的表达或参与染色质重塑等过程发挥生物学功能。目前关于AGBL4-IT1的具体功能研究较少，但已知它与邻近的蛋白编码基因AGBL4（ATP/GTP结合蛋白样4）存在位置关联，可能参与神经系统的发育或功能维持。AGBL4属于羧肽酶样金属蛋白酶家族，主要参与蛋白质翻译后修饰，如切割谷氨酸化修饰的微管蛋白。AGBL4-IT1可能通过顺式或反式作用影响AGBL4的表达或功能。该基因的异常表达（如过表达或低表达）可能与神经系统疾病或肿瘤发生相关，但具体机制尚不明确。若AGBL4-IT1表达异常，可能通过干扰AGBL4的正常功能影响微管动力学，进而影响神经元迁移或突触可塑性。作为lncRNA家族成员，AGBL4-IT1具有该家族的典型特征：长度超过200nt、缺乏开放阅读框、可能形成复杂二级结构以行使功能。lncRNA家族成员普遍通过调控基因表达、染色质修饰或作为分子支架参与细胞过程。需要注意的是，目前对AGBL4-IT1的研究仍处于早期阶段，其精确的分子机制和病理学意义需要更多实验验证。

None

无

OMIM数据库中对AGBL4-IT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对AGBL4-IT1基因的介绍

基因序列

基因序列

AGBL4-IT1基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

AGBL4-IT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3957       rs883913       rs946106       rs950562       rs1167258       rs1167259       rs1167260       rs1167261       rs1167262       rs1167263       rs1167264       rs1167265       rs1167266       rs1167267       rs1167268       rs1167269       rs1167270      

基因表达

基因表达

AGBL4-IT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGTTCGTAGGGTAACTCAG
59
TCCTACTCTTCAGAATCCTCC
58
TTCGTAGGGTAACTCAGCTC
59
CATTCCTACTCTTCAGAATCCTC
58
TATTGGAGGATTCTGAAGAGTAGG
59
TATCCGAAGCCAGTTGTCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

AGBL4-IT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGBL4-IT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 AGBL4-IT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2