AGBL1 (AGBL carboxypeptidase 1)

symbol:
AGBL1
locus group:
protein-coding gene
location:
15q25.3
gene_family:
alias symbol:
FLJ32310|CCP4
alias name:
cytosolic carboxypeptidase 4
entrez id:
123624
ensembl gene id:
ENSG00000273540
ucsc gene id:
uc002blz.2
refseq accession:
NM_152336
hgnc_id:
HGNC:26504
approved reserved:
2004-11-19
15q25.3
基因染色体位置图

AGBL1(ATP/GTP结合蛋白样1)是一种编码羧肽酶的基因,属于金属羧肽酶家族(M14家族),主要参与蛋白质翻译后修饰,特别是去除蛋白质C末端的谷氨酸或天冬氨酸残基。该基因在神经系统中高度表达,尤其在视网膜和大脑中,其编码的蛋白AGBL1(也称为CCP4或羧肽酶样蛋白4)通过调控微管蛋白的聚谷氨酰化修饰(一种翻译后修饰过程)影响微管动力学和神经元功能。AGBL1的功能障碍与多种神经系统疾病相关,例如视网膜变性(如常染色体隐性视网膜色素变性)和神经退行性疾病。突变可能导致酶活性丧失,破坏微管稳定性,进而影响轴突运输和突触功能,严重时可引发神经元凋亡。AGBL1过表达可能干扰正常的聚谷氨酰化平衡,导致微管功能紊乱,而表达降低则可能使聚谷氨酰化过度积累,两者均可能诱发神经发育异常或退行性病变。该基因属于M14金属羧肽酶家族,该家族成员通常依赖锌离子催化,参与肽链C末端的水解,但AGBL1的底物特异性与其他家族成员(如消化酶CPA1)不同,更偏向于修饰细胞骨架蛋白。研究还发现AGBL1与原发性开角型青光眼风险相关,可能通过影响小梁网细胞外基质的重塑发挥作用。此外,AGBL1与家族成员AGBL2/CCP5和AGBL4/CCP6协同调控微管蛋白修饰网络,其功能冗余性使得单一基因突变的影响可能被部分补偿,但长期失衡仍会导致病理表型。

Polyglutamylation is a reversible posttranslational modification catalyzed by polyglutamylases that results in the addition of glutamate side chains on the modified protein. This gene encodes a glutamate decarboxylase that catalyzes the deglutamylation of polyglutamylated proteins. Mutations in this gene result in dominant late-onset Fuchs corneal dystrophy. [provided by RefSeq, Nov 2013]

Polyglutamylation是可逆的翻译后修饰通过polyglutamylases催化导致在另外修饰的蛋白对谷氨酸侧链。该基因编码一个谷氨酸脱羧酶催化多谷氨酰化蛋白质的deglutamylation。这个基因导致显性迟发性突变富克斯角膜营养不良。 [由RefSeq的,2013年11月提供]

AGBL1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
AGBL1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs924170       rs924171       rs977316       rs1390859       rs1390860       rs1390861       rs1390863       rs1390864       rs1496876       rs1496878       rs1496879       rs1603500       rs1603501       rs1845932       rs1967151       rs1995074       rs2132652      

AGBL1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAATTGTTTACGGTTCTTCTCC
58
AAGTCATACTCGAACTCACG
57
AAGTGGAAGATGATGACTTGGA
60
TCAGTTCCTCTTCAGGTCG
59
CCTGCCAAAGCATATTTGGT
59
ATCAAGTGTCACAAACTGGG
58
CAATTGTTTACGGTTCTTCTCC
58
AAGTCATACTCGAACTCACG
58
AATTTGGAGGATGATGACTTGG
59
TCAGTTCCTCTTCAGGTCG
59
CCTGCCAAAGCATATTTGG
57
TCAAGTGTCACAAACTGGG
58
ATTTGGAGGATGATGACTTGGA
60
TCAGTTCCTCTTCAGGTCG
59
TCTTGACCGACCTGAAGAG
59
GACTGCAGTTCCTCAAAGC
59
AAGTGGAAGATGATGACTTGG
58
TCAGTTCCTCTTCAGGTCG
59
TCTTGACCGACCTGAAGAG
58
GACTGCAGTTCCTCAAAGC
59
      尚未收录相关数据

AGBL1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGBL1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004181
J3KQF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
J3KQF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
J3KQF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0004181
Q96MI9 (UniProtKB)
ISS
GO:0005829
Q96MI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
Q96MI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q96MI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0015631
Q96MI9 (UniProtKB)
ISS
GO:0035609
Q96MI9 (UniProtKB)
ISS
GO:0035610
Q96MI9 (UniProtKB)
ISS

可能调控 AGBL1基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
CORNEAL DYSTROPHY, FUCHS ENDOTHELIAL, 8 0.24 1 2 CLINVAR_UNIPROT
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Brain Diseases 0.002367032 1 1 GAD
Schizophrenia 0.002367032 1 1 GAD
Menopause present (finding) 0.002367032 1 1 GAD
Common Migraine 0.002367032 1 1 GAD
Fuchs Endothelial Dystrophy 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。