AGAP5 (ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 5)

symbol:
AGAP5
locus group:
protein-coding gene
location:
10q22.2
gene_family:
ArfGAPs|Ankyrin repeat domain containing|Pleckstrin homology domain containing
alias symbol:
Em:AC073389.1
alias name:
None
entrez id:
729092
ensembl gene id:
ENSG00000172650
ucsc gene id:
uc009xri.4
refseq accession:
NM_001144000
hgnc_id:
HGNC:23467
approved reserved:
2004-05-27
10q22.2
基因染色体位置图

AGAP5(ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 5)属于AGAP基因家族,该家族成员均含有ArfGAP结构域、GTP酶结构域、锚蛋白重复序列和PH结构域,主要参与调控小G蛋白ARF(ADP-核糖基化因子)的活性,影响囊泡运输、细胞骨架重组和信号转导等过程。AGAP5在细胞内主要作用于高尔基体和内体膜系统,通过其ArfGAP结构域负调控ARF蛋白的GTP水解活性,从而影响膜运输和受体分选。其PH结构域可结合磷脂酰肌醇,帮助定位至特定膜区域。AGAP5在神经系统中表达较高,可能参与突触囊泡的循环和神经递质释放调控。突变可能导致ARF信号通路紊乱,影响神经发育或突触功能,与某些神经退行性疾病或精神障碍的关联正在研究中。AGAP家族成员的共性是均具有ARFGAP活性,通过调控ARF蛋白参与膜运输动态,但各成员的组织分布和具体功能存在差异。AGAP5过表达可能干扰ARF依赖的囊泡形成,导致分泌途径异常,如神经营养因子释放失调;而表达降低可能使ARF持续活化,引起内体分选障碍或自噬异常。有研究表明AGAP5在胶质母细胞瘤中高表达,可能通过影响EGFR等受体 trafficking 促进肿瘤进展。该基因还与炎症反应中细胞因子的分泌调控有关,其表达变化可能影响免疫细胞功能。目前对AGAP5的研究仍在深入,其在癌症和神经系统疾病中的具体机制需要更多证据。

None

AGAP5基因的碱基序列:[NCBI]
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AGAP5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1047591       rs2394385       rs3861036       rs3878010       rs3878011       rs3878052       rs3878053       rs3878054       rs3956953       rs3957126       rs3998231       rs3998244       rs3998262       rs3998279       rs3998287       rs9733806       rs11000744      

AGAP5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTCAAACAGAAGCTTTGGA
59
TCTGTTTGAGAGTTCCTCTGG
60
CTCTCAAACAGATGCTTTGGA
59
TCTGTTTGAGAGTTCCTCTGG
60
AATAATATCGCACTGAGAAGCC
59
TCAGAATCTTCTGGGATGCT
59
ACAATATTCCAGAGGAACTCTC
57
AACGCTCAGTAGATACATGG
57
GAGATGCCTGAAGCTTTGG
59
CATCTGTTTGAGAGTTCCTCTG
59
CTCTCAAACAGATGCTTTGGA
59
TCTGTTTGAGAGTTCCTCTGG
60
ATAATATCGCACTGAGAAGCC
58
ATCAGAATCTTCTGGGATGC
58
TCTCAAACAGAAGCTTTGGA
57
ATCTGTTTGAGAGTTCCTCTG
58
TCTCAAACAGATGCTTTGGA
58
ATCTGTTTGAGAGTTCCTCTG
58
GAGATGCCTGAAGCTTTGG
59
ATCTGTTTGAGAGTTCCTCTGG
60
      尚未收录相关数据

AGAP5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGAP5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005096
A0A087X0S6 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
A0A087X0S6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005096
A0A0D9SFU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
A0A0D9SFU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005096
A6NIR3 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
A6NIR3 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
A6NIR3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005096
J3KQL4 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
J3KQL4 (UniProtKB)
IEA

可能调控 AGAP5基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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