ADAT1 (adenosine deaminase tRNA specific 1)

symbol:
ADAT1
locus group:
protein-coding gene
location:
16q23.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
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23536
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ENSG00000065457
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uc002feo.3
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NM_012091
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HGNC:228
approved reserved:
1999-10-14
16q23.1
基因染色体位置图

ADAT1(Adenosine Deaminase Acting on tRNA 1)是一种重要的酶基因,属于ADAT基因家族,该家族主要负责催化tRNA分子中特定腺苷(A)的脱氨反应,将其转化为肌苷(I),这一过程称为A-to-I编辑。ADAT1基因编码的蛋白主要在细胞质中发挥作用,作用于tRNA的反密码子环,通过改变tRNA的碱基配对特性,影响翻译的准确性和效率。ADAT1的生物学功能主要体现在调控蛋白质合成过程中,通过修饰tRNA分子来优化密码子识别,从而影响基因表达和细胞功能。ADAT1的突变可能导致tRNA编辑功能异常,进而影响蛋白质合成的准确性,甚至可能引发神经发育障碍或代谢性疾病。研究表明,ADAT1的表达异常可能与某些神经系统疾病相关,如智力障碍或癫痫,因为神经元对蛋白质合成的精确性要求极高。如果ADAT1过表达,可能导致tRNA过度编辑,影响翻译的保真性,进而干扰正常细胞功能;而降低表达则可能导致tRNA编辑不足,影响蛋白质合成的效率和质量。ADAT基因家族的共性在于它们都参与RNA编辑,特别是tRNA的修饰,对维持细胞稳态和基因表达的精确性至关重要。ADAT1与其他家族成员(如ADAT2和ADAT3)协同作用,共同完成tRNA的A-to-I编辑过程。这一基因家族在进化上高度保守,表明其在生命活动中的重要性。

This gene is a member of the ADAR (adenosine deaminase acting on RNA) family. Using site-specific adenosine modification, proteins encoded by these genes participate in the pre-mRNA editing of nuclear transcripts. The protein encoded by this gene, tRNA-specific adenosine deaminase 1, is responsible for the deamination of adenosine 37 to inosine in eukaryotic tRNA. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Jul 2010]

这个基因ADAR(作用于RNA腺苷脱氨酶)家族中的一员。使用位点特异性腺苷修饰,由这些基因编码的蛋白质参与核转录物的前体mRNA编辑。由该基因,tRNA的特异性腺苷脱氨酶1,编码的蛋白质是负责腺苷37在真核tRNA的脱氨为肌苷。可变剪接转录物变体已有描述。 [由RefSeq的,2010年7月提供]

ADAT1基因的碱基序列:[NCBI]
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ADAT1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs719574       rs1137871       rs1137872       rs1137873       rs1137874       rs1137875       rs1166209       rs1874022       rs2082751       rs2117565       rs2164245       rs2278469       rs2865829       rs2903106       rs3743598       rs3743599       rs3743600      

ADAT1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGGAAGTTGTGTCAATGGG
58
TATCATTGAGGATGTCTCCGT
59
AGGAAGTTGTGTCAATGGG
58
TATCATTGAGGATGTCTCCGT
59
AGTGATGGATCTGTGGGTG
59
TCCAGGATCCAAACACCTG
59
TTGGATGTTACTGCCAATGG
59
GCTGATTTGGGATCTTGCC
59
GACATTATTGGCAGCGGTG
59
AACTTCCTTTGTCACTTGCAC
59
ATCTACCTGTCAGCTGTGG
59
ATTCTGACACCTTCCAATCAG
58
CAATCTCCAGCTGACAAGG
58
GAGAAGGTACCGTTCTTCC
57
CTCCCTCAGCTTCTGATGG
60
GAAAGACACAGACACAGGGA
60
TTTCTTTGGAAAGGACGTCG
59
TAGCTGAGCAATCTCATCCG
60
AGGAAGAACGGAACCAGAC
59
TCATTGAGGATGTCTCCTGC
60
      尚未收录相关数据

ADAT1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADAT1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003723
H3BP18 (UniProtKB)
IEA
GO:0004000
H3BP18 (UniProtKB)
IEA
GO:0006396
H3BP18 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
H3BP27 (UniProtKB)
IEA
GO:0004000
H3BP27 (UniProtKB)
IEA
GO:0006396
H3BP27 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
H3BU72 (UniProtKB)
IEA
GO:0004000
H3BU72 (UniProtKB)
IEA
GO:0006396
H3BU72 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
Q9BUB4 (UniProtKB)
IMP
GO:0008033
Q9BUB4 (UniProtKB)
IMP
GO:0008251
Q9BUB4 (UniProtKB)
IMP
GO:0046872
Q9BUB4 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ADAT1基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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