ADAMTSL1 (ADAMTS like 1)

symbol:
ADAMTSL1
locus group:
protein-coding gene
location:
9p22.2-p22.1
gene_family:
I-set domain containing
alias symbol:
ADAMTSR1|FLJ35283
alias name:
punctin|punctin-1
entrez id:
92949
ensembl gene id:
ENSG00000178031
ucsc gene id:
uc003zne.5
refseq accession:
NM_001040272
hgnc_id:
HGNC:14632
approved reserved:
2002-01-11
9p22.2-p22.1
基因染色体位置图

ADAMTSL1(ADAMTS-like protein 1)属于ADAMTS(A Disintegrin And Metalloproteinase with Thrombospondin Motifs)基因家族,该家族成员编码的蛋白质通常具有金属蛋白酶活性或类似结构域,参与细胞外基质(ECM)的调控、细胞信号传导和组织发育。ADAMTSL1是该家族的"类蛋白"成员(缺乏蛋白酶活性),主要通过其血栓反应蛋白(TSP)结构域与其他ECM成分(如纤维蛋白原、胶原)相互作用,维持组织结构完整性。其生物学功能包括调节生长因子(如TGF-β)的活性、影响骨骼发育(特别是软骨形成)和心血管系统稳态。主要作用位点包括软骨、心脏、血管壁和眼睛的晶状体。突变可能导致Geleophysic发育不良(一种表现为短 stature、厚皮肤和心脏瓣膜异常的罕见遗传病),或Weill-Marchesani样综合征(涉及眼睛晶状体异位和骨骼异常)。与疾病的关联还包括马凡综合征(结缔组织疾病)和某些心血管异常,因其参与原纤维蛋白-1(FBN1)的调控。过表达可能破坏ECM平衡,导致组织纤维化或异常增厚(如心肌肥厚),而表达降低可能引起ECM结构缺陷(如关节松弛或血管脆弱)。该基因与ADAMTSL2、ADAMTSL3等同家族成员共享TSP结构域和C端PLAC(protease and lacunin)模块,共同特征是通过非酶机制调控ECM组装和生长因子信号。家族成员多参与发育性疾病和结缔组织病变,但ADAMTSL1独特之处在于其对TGF-β通路具有双向调节能力(既可抑制又可激活)。专业术语解释:细胞外基质(ECM)是细胞分泌的蛋白质网络,提供结构支持和生化信号;血栓反应蛋白(TSP)是一种参与细胞粘附和ECM组装的糖蛋白结构域;原纤维蛋白-1(FBN1)是微纤维的主要成分,突变导致马凡综合征。

This gene encodes a secreted protein and member of the ADAMTS (a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motif) family. This protein lacks the metalloproteinase and disintegrin-like domains, which are typical of the ADAMTS family, but contains other ADAMTS domains, including the thrombospondin type 1 motif. This protein may have important functions in the extracellular matrix. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的ADAMTS的分泌蛋白和成员(去整合素和金属蛋白酶与血小板图案)的家庭。该蛋白质缺少金属蛋白酶和整合素样结构域,这是典型的ADAMTS家族的,而是包含其它的ADAMTS域,包括血小板反应蛋白1型基序。这种蛋白质可以具有在细胞外基质的重要功能。在多个转录剪接变异体导致编码不同的蛋白质。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ADAMTSL1基因的碱基序列:[NCBI]
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ADAMTSL1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs486145       rs488627       rs519115       rs519878       rs542956       rs544787       rs548315       rs552677       rs568935       rs573120       rs702202       rs776759       rs776760       rs776761       rs776762       rs776763       rs776764      

ADAMTSL1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGATACTGTGGTTGCAATTCC
59
GTTTCCAGATATAAGTGATCAGGAC
59
AAGTTGCAAACCTTAGCGG
59
CCACCAGTAATCTTGGATCAC
59
CTATCAACCCATCATCCACC
57
GTCAGCTGATAACCTCCTC
57
CTATTACCCAGAGAACATCAAACC
59
CTTGTATCCGTCACTGGCT
60
GACAGGAGGATTCTTCTACAG
57
TTGCAAGTGTAGAAACCCA
57
GAACAAACAGACTCGGGAG
58
CGATACTGCTTCTTGCTGG
59
AGCACCTAAGGTCTTAGATGG
59
GCCAACAATTTGGCATAAACC
59
TTACCATCAGAGCAGTGCA
59
TCTCCAGTGTACACTGCAG
59
ATTCTGCTCTCCTTGGCTG
59
CAGTGACAATTGGCTGACC
59
ACATGCAGTAATGTGGACTG
58
GTGCTTGACATCATTATGAGCT
59
      尚未收录相关数据

ADAMTSL1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADAMTSL1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005578
A6NIB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
A6NIB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0008237
A6NIB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
A6NIB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
F8WEP3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
F8WEP3 (UniProtKB)
IEA
GO:0008237
F8WEP3 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
F8WEP3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
Q8N6G6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005788
Q8N6G6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005788
Q8N6G6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005788
Q8N6G6 (UniProtKB)
TAS
GO:0006508
Q8N6G6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
Q8N6G6 (UniProtKB)
IEA
GO:0008237
Q8N6G6 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q8N6G6 (UniProtKB)
IEA
GO:0036066
Q8N6G6 (UniProtKB)
TAS

可能调控 ADAMTSL1基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Immediate hypersensitivity 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Asthma 0.002367032 1 0 GAD
Parkinson Disease 0.002367032 1 1 GAD

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