ADAMTS9-AS2 (ADAMTS9 antisense RNA 2)

symbol:
ADAMTS9-AS2
locus group:
non-coding RNA
location:
3p14.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100507098
ensembl gene id:
ENSG00000241684
ucsc gene id:
uc003dml.5
refseq accession:
NR_038264
hgnc_id:
HGNC:42435
approved reserved:
2011-07-27
3p14.1
基因染色体位置图

ADAMTS9-AS2是一个长链非编码RNA(lncRNA)基因,位于人类染色体3p14.3区域,是ADAMTS9基因的反义转录本。它通过调控ADAMTS9的表达或独立发挥功能参与多种生物学过程。ADAMTS9属于ADAMTS(含血小板反应蛋白基序的解聚素样金属蛋白酶)家族,该家族成员主要参与细胞外基质重塑、血管生成和炎症调节等。ADAMTS9-AS2可能通过表观遗传调控或竞争性内源RNA(ceRNA)机制影响肿瘤发生发展。研究表明,ADAMTS9-AS2在多种癌症中表达异常,例如在胃癌和结直肠癌中低表达可能促进肿瘤侵袭转移,而在某些情况下过表达可能抑制肿瘤生长。该基因的突变或表达异常可能影响ADAMTS9的功能,进而改变细胞外基质降解平衡,与肿瘤微环境调控密切相关。ADAMTS9-AS2还可能与血管生成相关疾病有关,因为ADAMTS家族成员通常参与血管发育。此外,这个基因可能通过调控邻近基因ADAMTS9的表达影响组织纤维化进程。目前关于ADAMTS9-AS2的具体分子机制仍需进一步研究,但已知它可能通过与miRNAs或蛋白质相互作用来调控下游信号通路。这个基因代表了lncRNAs在疾病中重要作用的一个例子,展示了反义转录本如何通过多种方式调控基因表达网络。

None

ADAMTS9-AS2基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
ADAMTS9-AS2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs167622       rs178540       rs191169       rs191170       rs191171       rs318721       rs318722       rs318723       rs318724       rs318725       rs318726       rs318727       rs318728       rs318729       rs318730       rs318731       rs318732      

ADAMTS9-AS2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTAAGACCCACGAACGAC
58
AATGAATGAACCTCGAGGAC
58
TGTGCTTGGGAACTTTAAGAC
59
CAACAGAGTAAGAACCTATCCC
58
CTCCTTTCCCTTCAAACGC
59
TCAATAAATACCTGCGTCTCTG
58
CTCCTTTCCCTTCAAACGC
59
TCAATAAATACCTGCGTCTCTG
58
GTGCTTGGGAACTTTAAGAC
57
CAACAGAGTAAGAACCTATCCC
58
TTTCCCTTCAAACGCTGAG
58
GGTTTCAATAAATACCTGCGTC
58
TAAGACCCACGAACGACAG
60
GAATGAATGAACCTCGAGGAC
59
TTTCCCTTCAAACGCTGAG
58
GGTTTCAATAAATACCTGCGTC
58
TAAGACCCACGAACGACAG
60
AATGAATGAACCTCGAGGAC
58
TTTCCCTTCAAACGCTGAG
58
TCAATAAATACCTGCGTCTCTG
58
      尚未收录相关数据

ADAMTS9-AS2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADAMTS9-AS2基因的本体(GO)信息:

可能调控 ADAMTS9-AS2基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.12 1 1 GWASCAT
Age related macular degeneration 0.12 1 1 GWASCAT
Glioma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。