ADAMTS9-AS1 (ADAMTS9 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ADAMTS9-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
3p14.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
101929335
ensembl gene id:
ENSG00000241158
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uc021xaa.3
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NR_110150
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HGNC:40625
approved reserved:
2011-07-27

基因染色体位置

基因染色体位置

3p14.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ADAMTS9-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类染色体3p14.3区域，是ADAMTS9基因的反义转录本。它通过调控ADAMTS9的表达参与细胞外基质重塑、血管生成和肿瘤发生等生物学过程。ADAMTS9属于ADAMTS（含血小板反应蛋白基序的解聚素样金属蛋白酶）基因家族，该家族成员均含有保守的血小板反应蛋白1型重复序列（TSR）和金属蛋白酶结构域，主要功能是降解细胞外基质蛋白如聚集蛋白聚糖和versican，参与组织发育和疾病进程。ADAMTS9-AS1通过表观遗传调控或竞争性内源RNA（ceRNA）机制影响ADAMTS9的表达水平。研究表明ADAMTS9-AS1在多种癌症中异常表达，其低表达与胃癌、结直肠癌等恶性肿瘤的进展和不良预后相关，可能通过促进肿瘤细胞侵袭转移发挥作用。当ADAMTS9-AS1表达降低时，可能解除对ADAMTS9的抑制作用，导致细胞外基质过度降解，为肿瘤转移创造条件；而过表达ADAMTS9-AS1则可能抑制肿瘤生长。该基因还与2型糖尿病和动脉粥样硬化等代谢性疾病相关，其单核苷酸多态性（SNP）rs4607103被全基因组关联研究（GWAS）确定为2型糖尿病的风险位点。ADAMTS9-AS1的突变可能影响其与RNA结合蛋白的相互作用或稳定性，进而改变对靶基因的调控能力。作为ADAMTS基因家族的反义RNA，ADAMTS9-AS1代表了lncRNA在精细调控蛋白酶活性方面的重要机制，为理解复杂疾病的发病机制提供了新视角。

None

无

OMIM数据库中对ADAMTS9-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对ADAMTS9-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

ADAMTS9-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ADAMTS9-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2304990       rs3935273       rs4393895       rs4405909       rs4407403       rs4431099       rs4431100       rs4453831       rs4487237       rs4530517       rs4547692       rs4642117       rs4688211       rs4688481       rs4688483       rs4688484       rs4688485      

基因表达

基因表达

ADAMTS9-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGACTTTCAGCTTTCGCT
59
GTCCCAAATCTGGAAATAGTGC
60
ACAGAGAACATTCACAGTCTG
58
GTCAGTCAAATCGAAGAAAGG
57
GTAAGCTAGCAGGAATATGGA
57
AGGCAATATCACCCTTCCT
58
GAAGACAGAGAACAGCCCT
59
AAGTTTCAGGAAGGCAGCT
60
ACAGAGAACCACTAAGAAAGAC
58
TCAACACCTTTGTGGTCAG
58
TCCAGATTTGGGAACTTCCT
59
AATCAGACGTAACATATCCGAG
58
GAAACTGAAAGAGCCCTGC
59
AAAGTTTCAGGAAGGCAGC
59
TATTTCCAGATTTGGGAGCC
58
AAAGTTTCAGGAAGGCAGC
59
CAACCTTCACCTACTGGGT
59
ACACAGTTCTCTTGTAGAAGCT
60
CTGTGACTTTCAGCTTTCG
57
AAATAGTGCCACCATTGAGAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ADAMTS9-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADAMTS9-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ADAMTS9-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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