ADAMTS16 (ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16)

symbol:
ADAMTS16
locus group:
protein-coding gene
location:
5p15.32
gene_family:
ADAM metallopeptidases with thrombospondin type 1 motif
alias symbol:
ADAMTS16s
alias name:
None
entrez id:
170690
ensembl gene id:
ENSG00000145536
ucsc gene id:
uc003jdl.4
refseq accession:
NM_139056
hgnc_id:
HGNC:17108
approved reserved:
2002-02-13
5p15.32
基因染色体位置图

ADAMTS16(英文全称:A Disintegrin And Metalloproteinase with Thrombospondin Motifs 16)属于ADAMTS基因家族,该家族成员均为分泌型金属蛋白酶,具有解整合素(Disintegrin)和血小板反应蛋白(Thrombospondin)结构域,主要参与细胞外基质(ECM)的降解、组织重塑及信号传导等生物学过程。ADAMTS16的生物学功能尚未完全阐明,但研究表明它可能在生殖系统发育(如睾丸和卵巢功能)、心血管系统稳态及骨骼形成中发挥作用。其表达产物是一种蛋白酶,通过切割特定底物(如细胞外基质蛋白)调控组织微环境。主要作用位点包括生殖腺、心脏和软骨组织。突变可能导致功能异常,例如小鼠模型中ADAMTS16缺失会引发睾丸发育缺陷和精子发生障碍,而人类研究中其突变与多囊卵巢综合征(PCOS)和高血压的易感性相关。过表达ADAMTS16可能促进细胞外基质过度降解,影响组织完整性(如血管壁或软骨结构),而低表达可能导致发育异常或纤维化(如肾脏或心脏组织)。ADAMTS基因家族的共性是依赖锌离子催化活性,通过水解蛋白参与ECM动态平衡、炎症反应和生长因子调控。ADAMTS16与家族其他成员(如ADAMTS13)共享保守结构域,但底物特异性不同。目前该基因的病理机制研究仍在深入,潜在关联疾病包括生殖障碍、心血管疾病和结缔组织异常。专业术语解释:细胞外基质(ECM)是细胞周围的网状结构,提供机械支持并参与细胞通讯;解整合素结构域可抑制血小板聚集;金属蛋白酶指依赖金属离子(如锌)催化蛋白质水解的酶类。若需进一步研究,建议关注其与转化生长因子-β(TGF-β)通路的交互作用。

This gene encodes a member of the ADAMTS (a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs) protein family. ADAMTS family members share several distinct protein modules, including a propeptide region, a metalloproteinase domain, a disintegrin-like domain, and a thrombospondin type 1 (TS) motif. Individual members of this family differ in the number of C-terminal TS motifs, and some have unique C-terminal domains. The protein encoded by this gene has high sequence similarity to the protein encoded by ADAMTS18, another family member. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的ADAMTS的成员(去整合素和金属蛋白酶与血小板反应基序)的蛋白质家族。 ADAMTS家族成员共享几个不同的蛋白质模块,包括一个前肽区,金属蛋白酶结构域,一个去整合素样结构域,和一个血小板1型(TS)的基序。这个家庭的各个成员在C端TS图案的数量不同,有的有独特的C端结构域。由该基因编码的蛋白质具有高序列相似性由ADAMTS18,另一家族成员编码的蛋白质。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ADAMTS16基因的碱基序列:[NCBI]
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ADAMTS16基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs187939       rs270177       rs270178       rs270179       rs270180       rs270181       rs270190       rs270191       rs270192       rs270193       rs270194       rs270195       rs270196       rs270197       rs270198       rs270199       rs270200      

ADAMTS16基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTCTATCAAGGCTCTTTGCG
59
CGTATCATGCCTGACAAGC
59
AACGGGAATAACTCAGCCT
59
GACCATGTGATAATACTGGTTGG
59
GAGAAGAAAGATGCCTTCTGC
59
GTAGAACTTGTGGCTGCAC
59
TACAAGTGGAAGCCTTACAC
58
AGATCCAAGGACATTGTCAC
58
TTTCTATCAAGGCTCTTTGCG
59
CGTATCATGCCTGACAAGC
59
ACAACAGCAGACGATTCAG
58
CTCTTCTACTTGAGTGTAAGGC
58
TAACGGGAATAACTCAGCCT
59
ACCATGTGATAATACTGGTTGG
58
AAGTGGAAGCCTTACACTC
57
ATCAGATCCAAGGACATTGTC
58
CAACAGCAGACGATTCAGAG
59
CTCTTCTACTTGAGTGTAAGGCT
59
CTACACAAATTTCTAAGCACCG
58
CTCAGGATACTTGTATTCCTTCAC
59
      尚未收录相关数据

ADAMTS16基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADAMTS16基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004222
Q2XQZ0 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
Q2XQZ0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q2XQZ0 (UniProtKB)
IEA
GO:0001658
Q8TE57 (UniProtKB)
IEA
GO:0003073
Q8TE57 (UniProtKB)
IEA
GO:0004222
Q8TE57 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
Q8TE57 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
Q8TE57 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q8TE57 (UniProtKB)
IEA
GO:1902017
Q8TE57 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ADAMTS16基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Parkinson Disease 0.002367032 1 1 GAD
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Hypertensive disease 0.000271442 1 0 BeFree
Esophageal carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Failure, Premature 0.000271442 1 0 BeFree
Premature Menopause 0.000271442 1 0 BeFree
Chondrosarcoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of esophagus 0.000271442 1 0 BeFree
Esophageal Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree

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