ADAMTS13 (ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 13)

symbol:
ADAMTS13
locus group:
protein-coding gene
location:
9q34.2
gene_family:
ADAM metallopeptidases with thrombospondin type 1 motif
alias symbol:
VWFCP|TTP|vWF-CP|FLJ42993|MGC118899|MGC118900|DKFZp434C2322
alias name:
None
entrez id:
11093
ensembl gene id:
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ucsc gene id:
uc004cdv.6
refseq accession:
NM_139025
hgnc_id:
HGNC:1366
approved reserved:
1999-08-23
9q34.2
基因染色体位置图

ADAMTS13是一种重要的金属蛋白酶(一种依赖锌离子发挥切割功能的蛋白质),属于ADAMTS(a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs)基因家族。这个家族的特点是成员都含有解整合素样结构域(参与细胞间相互作用)、金属蛋白酶结构域(负责切割其他蛋白质)和血小板反应蛋白基序(与细胞外基质相互作用)。ADAMTS13主要在肝脏中产生,其核心功能是切割血管性血友病因子(VWF,一种促进血小板聚集和血栓形成的血液蛋白)。ADAMTS13通过特异性切割超大型VWF多聚体(这些多聚体在血流剪切力作用下容易引起血小板异常聚集),将其转化为较小、活性较低的形式,从而维持正常的止血平衡。当ADAMTS13基因发生突变导致功能缺陷时,超大型VWF多聚体会在血液中积累,引发血栓性微血管病(TMA),表现为血栓性血小板减少性紫癜(TTP),这是一种危及生命的疾病,特征为血小板减少、溶血性贫血和器官损伤。相反,ADAMTS13活性过高理论上可能增加出血风险,但这种情况在临床上较为罕见。ADAMTS13的表达水平受炎症因子(如IL-6)调控,在炎症状态下其表达可能下降。该基因的突变类型包括错义突变(导致氨基酸改变)、无义突变(产生提前终止密码子)和剪切位点突变(影响mRNA加工),这些突变通常导致酶活性丧失。除了遗传性TTP,获得性TTP可由自身抗体抑制ADAMTS13活性引起。在诊断方面,ADAMTS13活性检测是确诊TTP的关键指标。治疗上,血浆置换(清除抗体并补充ADAMTS13)和针对CD20的单克隆抗体(如利妥昔单抗)可用于获得性TTP,而重组ADAMTS13制剂正在临床试验中。

This gene encodes a member of a family of proteins containing several distinct regions, including a metalloproteinase domain, a disintegrin-like domain, and a thrombospondin type 1 (TS) motif. The enzyme encoded by this gene specifically cleaves von Willebrand Factor (vWF). Defects in this gene are associated with thrombotic thrombocytopenic purpura. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]

该基因编码一个家族包含几个不同的区域,包括金属蛋白酶结构域,一个去整合素样结构域,和一个血小板1型(TS)基序的蛋白质的成员。由该基因特异性切割血管性血友病因子(vWF)编码的酶。在这个基因的缺陷与血栓性血小板减少性紫癜相关联。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2013年7月提供]

ADAMTS13基因的碱基序列:[NCBI]
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ADAMTS13基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs592514       rs592514       rs602184       rs602184       rs603551       rs603551       rs606492       rs606492       rs622620       rs622620       rs627892       rs627892       rs637518       rs637518       rs647172       rs647172       rs649078      

ADAMTS13基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGACATCCAGGTTTACAGG
58
GCTTAGGCTGGAAGTAGGT
59
GATTGGGCACAGGATATGTG
59
ATTCTGTCCCATCCAGGAG
59
CATCATGAAGCGTGGAGAC
59
CATCACAGCCAAATGTCCT
58
AAACCTTCTACAGAGATCCGG
59
CTGACTCCCAGTAGAGCAC
59
ATCACTAGGTTTGACCTGGAG
59
AGTGTCCTCGGTAATGAGG
59
CTGACATCCAGGTTTACAGG
58
GCTTAGGCTGGAAGTAGGT
59
ATCACTAGGTTTGACCTGGAG
59
AGTGTCCTCGGTAATGAGG
59
CTTCTACAGAGAATGTGACATGC
60
ATTACTCGTGGCTGGACTC
59
CTGACATCCAGGTTTACAGG
58
GCTTAGGCTGGAAGTAGGT
59
ATCACTAGGTTTGACCTGGAG
59
AGTGTCCTCGGTAATGAGG
59
      尚未收录相关数据

ADAMTS13基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADAMTS13基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004222
A0A0B4J229 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
A0A0B4J229 (UniProtKB)
IEA
GO:0004222
E7EV88 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
E7EV88 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
E7EV88 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
E7EV88 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
F6V803 (UniProtKB)
IEA
GO:0008237
F6V803 (UniProtKB)
IEA
GO:0004222
Q76LX8 (UniProtKB)
IEA
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Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
GO:0005509
Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
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Q76LX8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q76LX8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005578
Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
Q76LX8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
Q76LX8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005788
Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
GO:0005788
Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
GO:0005788
Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
GO:0006508
Q76LX8 (UniProtKB)
IDA
GO:0007160
Q76LX8 (UniProtKB)
NAS
GO:0007229
Q76LX8 (UniProtKB)
NAS
GO:0008237
Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
GO:0008270
Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
GO:0009100
Q76LX8 (UniProtKB)
NAS
GO:0009636
Q76LX8 (UniProtKB)
IEA
GO:0009986
Q76LX8 (UniProtKB)
NAS
GO:0016485
Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
GO:0030168
Q76LX8 (UniProtKB)
NAS
GO:0034341
Q76LX8 (UniProtKB)
IEA
GO:0034612
Q76LX8 (UniProtKB)
IEA
GO:0036066
Q76LX8 (UniProtKB)
TAS
GO:0043171
Q76LX8 (UniProtKB)
IDA
GO:0070670
Q76LX8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ADAMTS13基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Congenital Thrombotic Thrombocytopenic Purpura 0.453224707 51 55 BeFree_CLINVAR_GAD_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Purpura, Thrombotic Thrombocytopenic 0.226848999 151 8 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Thrombotic Microangiopathies 0.128143256 32 0 BeFree_CTD_human
Immune thrombocytopenic purpura 0.12 1 0 CTD_human
Non-alcoholic Fatty Liver Disease 0.08 1 0 RGD
Compression of spinal cord 0.08 1 0 RGD
Venous Thrombosis 0.08 1 0 RGD
Cholestasis 0.08 1 0 RGD
Thrombocytopenia 0.010897401 4 0 LHGDN
Thrombosis 0.007815732 3 0 GAD_LHGDN

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