ACTR3B (actin related protein 3B)

symbol:
ACTR3B
locus group:
protein-coding gene
location:
7q36.1-q36.2
gene_family:
alias symbol:
ARP11|ARP3beta
alias name:
None
entrez id:
57180
ensembl gene id:
ENSG00000133627
ucsc gene id:
uc003wle.3
refseq accession:
NM_020445
hgnc_id:
HGNC:17256
approved reserved:
2005-05-19
7q36.1-q36.2
基因染色体位置图

ACTR3B(Actin-Related Protein 3B)属于肌动蛋白相关蛋白(ARP,Actin-Related Proteins)家族,该家族成员在细胞骨架动态重组、细胞运动及膜运输等过程中发挥关键作用。ACTR3B与ARP2/3复合体(由ARP2、ARP3及5个辅助蛋白组成)结合,参与调控肌动蛋白(细胞骨架的主要成分)的聚合,从而影响细胞形态维持、迁移及胞内物质运输。其表达产物为一种结构蛋白,通过促进肌动蛋白分支网络的形成,支撑细胞前沿的板状伪足(lamellipodia,细胞移动时的扁平突起结构)。主要作用位点为细胞质,尤其在细胞运动活跃区域富集。若ACTR3B发生功能丧失性突变(如错义突变或缺失),可能导致ARP2/3复合体活性下降,肌动蛋白网络紊乱,进而削弱细胞迁移能力,与肿瘤转移抑制相关。研究发现,ACTR3B低表达与乳腺癌、肺癌等恶性肿瘤的侵袭性降低有关,因其抑制了癌细胞的转移潜能。相反,若该基因过表达,可能过度激活ARP2/3复合体,导致肌动蛋白异常聚集,或促进肿瘤细胞迁移。ACTR3B与家族成员(如ACTR3)共享约50%氨基酸序列同源性,均具有ATP结合能力,但ACTR3B特异性高表达于上皮组织,而ACTR3广泛分布。基因家族共性包括:依赖保守的“actin-fold”结构域(类似肌动蛋白的折叠方式)与其他蛋白相互作用,并参与细胞骨架重构。目前ACTR3B的临床关联研究仍在深入,其调控机制可能涉及microRNA或转录因子(如TWIST1)的干预。专业术语解释:ATP(三磷酸腺苷,能量分子)、错义突变(导致氨基酸改变的DNA变异)、板状伪足(细胞移动时的临时结构)。英文注释:ARP2/3 complex(ARP2/3复合体)、lamellipodia(板状伪足)。

This gene encodes a member of the actin-related proteins (ARP), which form multiprotein complexes and share 35-55% amino acid identity with conventional actin. The protein encoded by this gene may have a regulatory role in the actin cytoskeleton and induce cell-shape change and motility. Pseudogenes of this gene are located on chromosomes 2, 4, 10, 16, 22 and Y. Alternative splicing results in multiple transcript variants and protein isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2012]

该基因编码肌动蛋白相关蛋白(ARP),其形成多蛋白复合物,并与传统的肌动蛋白共享35-55%氨基酸同一性的成员。由该基因编码的蛋白质可具有在肌动蛋白细胞骨架的调节作用,并诱导细胞形状变化和运动。该基因的假基因位于在多个转录变体和同种型蛋白质染色体2,4,10,16,22和Y选择性剪接的结果。 [由RefSeq的,2012年7月提供]

ACTR3B基因的碱基序列:[NCBI]
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ACTR3B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs11103       rs940261       rs940262       rs940267       rs1568734       rs1574987       rs1610279       rs1880124       rs1880125       rs1880126       rs1880127       rs1966134       rs1966135       rs1972152       rs1976867       rs1976871       rs1976872      

ACTR3B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TACATTGCAGTTCAGTGCT
57
CGCTGTCAATGACTATCCC
58
CTGTATAAGAATGTCGTACTCTCAG
59
TCTCTTCAAATCCCTCTGCA
59
CTACAAAGTGGCCGATACG
58
AAATAATGGTCCTCAGGTTCAG
58
TCCTTCATGTATTGCCATCAG
58
AAGTCAAGGTCATCAACTCC
58
CAGACTTTATGGAGTCCATCTC
58
GAACTCGGGCTTATACAGC
58
GGTGAACGTACGTTAACGG
59
TTACATAACCTTCTGCCACTG
58
TCTTCGAGCTGAACCTGAG
59
GGAGGTTCTGTCTGGTCAC
60
ATCTTCGAGCTGAACCTGAG
60
AGGTTCTGTCTGGTCACTG
59
CATTGCAGTTCAGTGCTGG
60
TCCGCTGTCAATGACTATCC
60
GACTTTATGGAGTCCATCTCAG
58
AAGAACTCGGGCTTATACAG
57
      尚未收录相关数据

ACTR3B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ACTR3B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
Q9P1U1 (UniProtKB)
ND
GO:0003779
Q9P1U1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
Q9P1U1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q9P1U1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005885
Q9P1U1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008150
Q9P1U1 (UniProtKB)
ND
GO:0034314
Q9P1U1 (UniProtKB)
IEA
GO:0042995
Q9P1U1 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q9P1U1 (UniProtKB)
IDA

可能调控 ACTR3B基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree

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