ACTR1A (actin related protein 1A)

symbol:
ACTR1A
locus group:
protein-coding gene
location:
10q24.32
gene_family:
alias symbol:
ARP1|Arp1A
alias name:
centractin alpha
entrez id:
10121
ensembl gene id:
ENSG00000138107
ucsc gene id:
uc001kvv.4
refseq accession:
NM_005736
hgnc_id:
HGNC:167
approved reserved:
1999-05-17
10q24.32
基因染色体位置图

ACTR1A(ARP1 Actin-Related Protein 1A)是肌动蛋白相关蛋白(ARP,Actin-Related Proteins)家族的成员之一,属于ARP1/ARP10亚家族。该基因家族在进化上高度保守,主要参与细胞骨架的动态重组、囊泡运输和有丝分裂等关键生物学过程。ACTR1A编码的蛋白质与肌动蛋白(Actin)结构相似,但功能更专一,通常作为大型蛋白复合物(如动力蛋白复合体Dynactin)的核心组分发挥作用。其表达产物通过与微管马达蛋白(如动力蛋白Dynein)结合,帮助调控细胞内物质沿微管的定向运输,尤其在神经元轴突运输和高尔基体结构维持中起关键作用。主要作用位点包括细胞质内的微管网络、高尔基体膜及有丝分裂纺锤体。若ACTR1A发生功能丧失性突变,会导致动力蛋白复合体组装异常,进而引发神经退行性疾病(如遗传性痉挛性截瘫)或纤毛功能障碍(如原发性纤毛运动障碍)。该基因与某些癌症(如乳腺癌和胶质瘤)的关联也被报道,可能通过影响细胞分裂和迁移促进肿瘤进展。当ACTR1A过表达时,可能破坏微管-动力蛋白的运输平衡,导致细胞器定位紊乱;而表达降低则会引起囊泡堆积和突触传递缺陷。在基因家族层面,ARP成员均含有肌动蛋白折叠结构域,但各亚家族功能分化明显:ARP1亚家族侧重物质运输,ARP2/3亚家族参与肌动蛋白成核,ARP4-9则多涉及染色质重塑。目前"ARP1"的中文译名存在争议,部分文献直译为"肌动蛋白相关蛋白1",也有学者建议保留英文缩写以区分亚型。

This gene encodes a 42.6 kD subunit of dynactin, a macromolecular complex consisting of 10-11 subunits ranging in size from 22 to 150 kD. Dynactin binds to both microtubules and cytoplasmic dynein. It is involved in a diverse array of cellular functions, including ER-to-Golgi transport, the centripetal movement of lysosomes and endosomes, spindle formation, chromosome movement, nuclear positioning, and axonogenesis. This subunit is present in 8-13 copies per dynactin molecule, and is the most abundant molecule in the dynactin complex. It is an actin-related protein, and is approximately 60% identical at the amino acid level to conventional actin. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码dynactin的42.6 kD的亚单位,包括10-11亚基22?150 kD的大小不等的大分子复合物。 Dynactin同时结合微管和胞质动力蛋白。它参与的细胞功能,包括ER到高尔基体转运,溶酶体和内涵体的心运动,纺锤体形成,染色体的运动,核的定位,并axonogenesis一个多样化。这个子单元是存在于每dynactin分子8-13份,并且是在dynactin复杂最丰富的分子。它是一种肌动蛋白相关蛋白,并且是在氨基酸??水平与常规的肌动蛋白大约60%相同。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ACTR1A基因的碱基序列:[NCBI]
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ACTR1A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs5870       rs12162       rs13287       rs14583       rs715438       rs715439       rs715440       rs1056857       rs1057041       rs1057054       rs1977382       rs2274351       rs2296578       rs2296579       rs2296580       rs2296581       rs2296582      

ACTR1A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGAGCCTGTTACCTATCCA
58
GGTGCAGATATCTCAATGGT
58
AAGTCAGACATGGACCTGC
60
GTGCAGATATCTTTGAACAGGG
60
AGATCAGGATATCTGCACCTC
59
TTAAAGGTGTCCAGGGAGG
59
AAGGATTGGAACGACATGGA
60
CACAGGATGCTCCTCTGAG
60
AAGATCAGGATATCTGCACCTC
60
TTAAAGGTGTCCAGGGAGG
59
GTCGTGATCGACAACTGTG
59
GGATAGCGGATTGAAAGCAG
59
CCATTGAGATATCTGCACCTC
58
TTAAAGGTGTCCAGGGAGG
59
AAGGATTGGAACGACATGGA
60
CACAGGATGCTCCTCTGAG
60
CCATTGAGATTGGTCCTTCC
58
ATGCCTTCACTCTCCTCTC
59
AAAGAGCCTGTTACCTATCCA
59
TGCAGATATCTCAATGGTGC
58
      尚未收录相关数据

ACTR1A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ACTR1A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000086
P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005524
P61163 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P61163 (UniProtKB)
IDA
GO:0005813
P61163 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0005869
P61163 (UniProtKB)
IEA
GO:0005875
P61163 (UniProtKB)
TAS
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P61163 (UniProtKB)
IDA
GO:0016192
P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0019886
P61163 (UniProtKB)
TAS
GO:0043209
P61163 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P61163 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P61163 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P61163 (UniProtKB)
IDA
GO:1990752
P61163 (UniProtKB)
IDA
GO:0005869
R4GMT0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ACTR1A基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mesothelioma 0.00272435 1 0 LHGDN
Multiple Myeloma 0.001357209 5 0 BeFree
Rotavirus Infections 0.000542884 2 0 BeFree
Spinocerebellar Ataxia Type 5 0.000271442 1 1 BeFree
Acute leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Immunologic Deficiency Syndromes 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Liver neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree

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