ACKR4 (atypical chemokine receptor 4)

symbol:
ACKR4
locus group:
protein-coding gene
location:
3q22.1
gene_family:
Chemokine receptors
alias symbol:
CCR11|CCBP2|VSHK1|CCX-CKR|PPR1
alias name:
None
entrez id:
51554
ensembl gene id:
ENSG00000129048
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NM_016557
hgnc_id:
HGNC:1611
approved reserved:
1999-02-18
3q22.1
基因染色体位置图

ACKR4(Atypical Chemokine Receptor 4,非典型趋化因子受体4)属于非典型趋化因子受体家族(ACKR家族),这类受体与经典趋化因子受体不同,它们不能激活G蛋白信号通路,而是通过内化和降解趋化因子来调节其浓度,从而影响免疫细胞的迁移和炎症反应。ACKR4主要结合趋化因子CCL19、CCL21和CCL25,这些趋化因子通常参与淋巴细胞归巢(lymphocyte homing)和次级淋巴器官的免疫细胞定位。ACKR4在淋巴结、胸腺和肠道等淋巴组织中高表达,通过清除趋化因子来限制过度免疫反应,维持免疫稳态。 如果ACKR4发生突变,可能导致其内化趋化因子的能力下降,使局部趋化因子水平异常升高,进而影响免疫细胞的迁移和定位,可能引发自身免疫疾病或炎症性疾病。研究表明,ACKR4在肿瘤微环境中可能通过调节趋化因子水平影响免疫细胞的浸润,从而影响肿瘤的免疫逃逸。 当ACKR4过表达时,会过度清除趋化因子,可能导致免疫细胞无法有效迁移至炎症或感染部位,削弱免疫应答;而降低表达时,趋化因子积累可能引起过度炎症反应或自身免疫异常。ACKR家族(包括ACKR1-4)的共同特点是它们不激活典型的G蛋白信号,而是通过内化或转运趋化因子来调控其生物利用度,从而间接影响免疫和炎症过程。目前的研究表明,ACKR4在癌症、炎症性肠病(IBD)和自身免疫疾病中可能发挥重要作用,但其具体机制仍需进一步探索。

The protein encoded by this gene is a member of the G protein-coupled receptor family, and is a receptor for C-C type chemokines. This receptor has been shown to bind dendritic cell- and T cell-activated chemokines including CCL19/ELC, CCL21/SLC, and CCL25/TECK. A pseudogene of this gene is found on chromosome 6. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described. [provided by RefSeq, Jul 2013]

由该基因编码的蛋白质是G蛋白偶联受体家族的成员,并且是C-C型趋化因子的受体。该受体已经显示结合树突细胞和T细胞活化趋化因子,包括CCL19 / ELC,CCL21 / SLC,和CCL25 / TECK。该基因的假基因是在编码相同的蛋白选择性剪接转录变异体进行了说明6号染色体中。 [由RefSeq的,2013年7月提供]

ACKR4基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
ACKR4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3804636       rs4854649       rs6775856       rs6777377       rs6779298       rs6800070       rs6800077       rs7626429       rs7626622       rs10935020       rs41272313       rs56778092       rs57009048       rs59300212       rs61070597       rs61748105       rs62291492      

ACKR4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCCTACAGAGCCAACCAG
60
GGACTATGCCTTGATTGCTC
59
CTACAACAGATTGGAGCCA
57
TGACTGTAGTCATAAGTGCC
57
ACTACAACAGATTGGAGCC
57
GACTGTAGTCATAAGTGCCA
57
GTCCTACAGAGCCAACCAG
60
TATGCCTTGATTGCTCTTGC
59
CTACAACAGATTGGAGCCA
57
GACTGTAGTCATAAGTGCCA
57
GTCCTACAGAGCCAACCAG
60
ATGCCTTGATTGCTCTTGC
59
      尚未收录相关数据

ACKR4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ACKR4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004950
Q9NPB9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005044
Q9NPB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9NPB9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NPB9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005769
Q9NPB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9NPB9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q9NPB9 (UniProtKB)
TAS
GO:0006898
Q9NPB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006935
Q9NPB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
Q9NPB9 (UniProtKB)
TAS
GO:0007186
Q9NPB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0019956
Q9NPB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0055037
Q9NPB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0070098
Q9NPB9 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ACKR4基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Spontaneous abortion 0.12 1 0 CTD_human
Inflammatory disorder 0.000814326 3 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000814326 3 0 BeFree
Sezary Syndrome 0.000814326 3 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Lymphoma, T-Cell, Cutaneous 0.000542884 2 0 BeFree
Dermatitis 0.000542884 2 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。