ABI3 (ABI family member 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ABI3
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.32
gene_family:
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NESH|SSH3BP3
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None
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51225
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NM_016428
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HGNC:29859
approved reserved:
2004-03-11

基因染色体位置

基因染色体位置

17q21.32
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ABI3（ABSCISIC ACID INSENSITIVE 3）是一个植物特异性转录因子，属于B3结构域转录因子家族，在种子发育和萌发过程中起关键作用。它主要在种子中表达，调控种子成熟、休眠和萌发相关基因的表达。ABI3通过响应脱落酸（ABA）信号通路来抑制种子过早萌发，促进种子进入休眠状态。其表达产物含有多个功能域，包括B3 DNA结合域、酸性激活域和核定位信号，能够直接结合特定DNA序列调控下游基因。突变会导致种子对ABA不敏感，表现为过早萌发、脱水耐受力下降和贮藏物质积累异常。ABI3与ABI5、FUS3等转录因子共同构成种子发育调控网络，属于LAFL（LEC1、ABI3、FUS3、LEC2）调控网络的核心成员，这个基因家族的共性是都含有B3 DNA结合域，参与植物发育特别是胚胎发生和种子成熟的调控。当ABI3过表达时会导致种子过早进入成熟程序，抑制幼苗生长；而表达降低则会造成种子成熟缺陷，降低休眠程度和贮藏蛋白积累。ABI3功能异常与多种农作物种子质量下降有关，也是改良种子休眠性和抗逆性的重要靶基因。在拟南芥中的研究表明，ABI3还参与调控植物对干旱、盐胁迫等非生物胁迫的响应。

This gene encodes a member of an adaptor protein family. Members of this family encode proteins containing a homeobox homology domain, proline rich region and Src-homology 3 (SH3) domain, and are components of the Abi/WAVE complex which regulates actin polymerization. The encoded protein inhibits ectopic metastasis of tumor cells as well as cell migration. This may be accomplished through interaction with p21-activated kinase. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013]

这个基因编码的衔接蛋白家族的一个成员。含有同源框同源结构域，富含脯氨酸的区域和SRC-同源3（SH3）域这个家族编码蛋白质的成员，并且是ABI / WAVE复合物，调节肌动蛋白聚合的组成部分。所编码的蛋白质抑制肿瘤细胞的异位转移以及细胞迁移。这可以通过与p21的活化激酶的相互作用来完成。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2013年9月提供]

OMIM数据库中对ABI3基因的介绍     Wikipedia数据库中对ABI3基因的介绍

基因序列

基因序列

ABI3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ABI3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs582824       rs593663       rs597882       rs609257       rs612062       rs616338       rs623682       rs627386       rs634370       rs658979       rs659377       rs659829       rs686259       rs687650       rs850526       rs1009571       rs1009572      

基因表达

基因表达

ABI3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAGAAAGTGGTGACACTG
58
AGTGACACAGATGACAGTG
57
CTGGATGGAGATGAATTGGG
58
TTCTCCAAGTATGAGGCAGG
59
GGAGAAAGTGGTGACACTG
58
GTGACACAGATGACAGTGC
59
CCTGGATGGAGATGAATTGG
58
TCTCCAAGTATGAGGCAGG
59
CTGGATGGAGATGAATTGGG
58
TCTCCAAGTATGAGGCAGG
59
CATACTTGGAGAAAGTGGTGAC
59
GATGACAGTGCCCTCAGAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ABI3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ABI3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
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IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
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Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P2A4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005622
Q9P2A4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9P2A4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9P2A4 (UniProtKB)
NAS
GO:0006928
Q9P2A4 (UniProtKB)
NAS
GO:0016020
Q9P2A4 (UniProtKB)
IDA
GO:0030027
Q9P2A4 (UniProtKB)
IDA
GO:0030334
Q9P2A4 (UniProtKB)
IDA
GO:0018108
Q9P2A4 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ABI3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Thyroid Neoplasm 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree
invasive cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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