ABCD2 (ATP binding cassette subfamily D member 2)

symbol:
ABCD2
locus group:
protein-coding gene
location:
12q12
gene_family:
ATP-binding cassette, sub-family D (ALD)
alias symbol:
ALDR|ALDRP
alias name:
None
entrez id:
225
ensembl gene id:
ENSG00000173208
ucsc gene id:
uc001rmb.3
refseq accession:
NM_005164
hgnc_id:
HGNC:66
approved reserved:
1997-10-10
12q12
基因染色体位置图

ABCD2(ATP-binding cassette sub-family D member 2)是一种属于ATP结合盒(ABC)转运蛋白超家族的基因,属于ABCD亚家族。ABCD家族成员通常参与细胞内脂质代谢和转运,特别是过氧化物酶体中的极长链脂肪酸(VLCFA)的β-氧化过程。ABCD2编码的蛋白质称为ALDR(肾上腺脑白质营养不良相关蛋白),主要表达于大脑、肾上腺和肝脏等组织,在过氧化物酶体膜上发挥作用,负责将VLCFA或其他脂质底物转运至过氧化物酶体内进行代谢。 ABCD2的功能与ABCD1高度相似,后者突变会导致X连锁肾上腺脑白质营养不良(X-ALD),这是一种严重的神经退行性疾病,表现为VLCFA积累、髓鞘破坏和肾上腺功能不全。虽然ABCD2突变本身不直接导致X-ALD,但研究表明它可以部分补偿ABCD1的功能缺失,因此被认为在疾病治疗中具有潜在作用。某些研究尝试通过上调ABCD2表达来缓解X-ALD的症状。 如果ABCD2过表达,可能会增强VLCFA的代谢能力,减少其在细胞内的积累,从而对某些脂质代谢疾病(如X-ALD)产生保护作用。相反,若ABCD2表达降低,可能导致VLCFA代谢效率下降,加剧脂质毒性,尤其是在ABCD1功能受损的情况下。此外,ABCD2的表达受PPAR(过氧化物酶体增殖物激活受体)等转录因子的调控,并与胆固醇代谢、神经保护等过程相关。 ABCD基因家族的共性包括:均编码过氧化物酶体膜蛋白,参与脂肪酸(尤其是VLCFA)的转运和代谢;依赖ATP水解提供能量进行底物跨膜运输;在脂质稳态和能量代谢中起关键作用。除ABCD1和ABCD2外,该家族还包括ABCD3(参与支链脂肪酸代谢)和ABCD4(与维生素B12代谢相关)。这些基因的突变或表达异常可能导致多种代谢性疾病,凸显其在细胞代谢中的重要性。

The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the ALD subfamily, which is involved in peroxisomal import of fatty acids and/or fatty acyl-CoAs in the organelle. All known peroxisomal ABC transporters are half transporters which require a partner half transporter molecule to form a functional homodimeric or heterodimeric transporter. The function of this peroxisomal membrane protein is unknown; however this protein is speculated to function as a dimerization partner of ABCD1 and/or other peroxisomal ABC transporters. Mutations in this gene have been observed in patients with adrenoleukodystrophy, a severe demyelinating disease. This gene has been identified as a candidate for a modifier gene, accounting for the extreme variation among adrenoleukodystrophy phenotypes. This gene is also a candidate for a complement group of Zellweger syndrome, a genetically heterogeneous disorder of peroxisomal biogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是ATP结合盒(ABC)转运蛋白的超家族中的一员。 ABC蛋白质跨越预算外内和细胞膜输送各种分子。 ABC基因被分为七个不同亚科(ABC1,MDR / TAP,MRP,ALD,OABP,GCN20,白色)。这种蛋白质是ALD亚科,其涉及的脂肪酸和/或脂肪酰基辅酶A中的细胞器的过氧化物酶体进口的一个成员。所有已知的过氧化物酶ABC转运是需要一个伙伴半转运分子形成功能同二聚体或异二聚体转运一半转运。此过氧化物酶体膜蛋白的功能是未知的;然而这种蛋白推测充当ABCD1的二聚化伴侣和/或其他的过氧化物酶ABC转运。在这种基因突变的患者肾上腺脑白质营养不良,严重脱髓鞘疾病中观察到。该基因已被鉴定为用于修饰基因的候选,占肾上腺表型之间的极端变化。该基因也是互补组齐薇格综合征,过氧化物酶体生物合成的遗传异质性疾病的候选者。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ABCD2基因的碱基序列:[NCBI]
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ABCD2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2293810       rs4072006       rs4072007       rs4077987       rs4129477       rs4284427       rs4294600       rs4298947       rs4451772       rs4466883       rs4475956       rs4583016       rs4595585       rs4768164       rs4768165       rs4768166       rs5797628      

ABCD2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GACCTTCTCTTTGGAAATACCAC
60
CAGTATCCAATTGTTCAAAGCG
59
CAGACCAAGATCTGGAACG
58
TAACAGCATCCCATCCTCC
59
TTGCAGATGGTGAGGATGG
60
CCAGTAAATTTCGAGCAGTGG
60
      尚未收录相关数据

ABCD2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ABCD2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000038
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005324
Q9UBJ2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005777
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005777
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005777
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005778
Q9UBJ2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005778
Q9UBJ2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9UBJ2 (UniProtKB)
TAS
GO:0006635
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IGI
GO:0015909
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0032000
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IDA
GO:0042626
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0042760
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IGI
GO:0042803
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IDA
GO:0043231
Q9UBJ2 (UniProtKB)
IDA
GO:0055085
Q9UBJ2 (UniProtKB)
TAS

可能调控 ABCD2基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colorectal Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Adrenoleukodystrophy 0.01114898 22 0 BeFree_LHGDN
Liver carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Comatose 0.000271442 1 0 BeFree
Adrenomyeloneuropathy 0.000271442 1 0 BeFree
Inflammatory disorder 0.000271442 1 0 BeFree
Zellweger Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Neurodegenerative Disorders 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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