ABCC6P1 (ATP binding cassette subfamily C member 6 pseudogene 1)

symbol:
ABCC6P1
locus group:
pseudogene
location:
16p12.3
gene_family:
Functional pseudogenes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
653190
ensembl gene id:
ENSG00000256340
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refseq accession:
NR_003569
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HGNC:33352
approved reserved:
2007-02-23
16p12.3
基因染色体位置图

ABCC6P1是一个假基因,属于ATP结合盒(ABC)转运蛋白基因家族。ABC转运蛋白家族是一类广泛存在于生物体中的跨膜蛋白,主要功能是利用ATP水解产生的能量将各种底物(如离子、代谢物、药物等)跨膜转运。ABCC6P1位于人类16号染色体上,与功能基因ABCC6高度同源,但由于序列中存在终止密码子或移码突变等缺陷,它失去了编码功能性蛋白的能力。假基因通常被认为是进化过程中的"分子化石",可能通过基因复制产生但随后积累突变而失去功能。ABCC6P1的突变不会对机体产生直接影响,因为它本身不编码功能蛋白。然而,作为ABCC6的假基因,它可能在基因调控中发挥作用,例如通过竞争性结合microRNA或转录因子来调节ABCC6的表达水平。ABCC6的功能异常与多种疾病相关,如假性黄色瘤(PXE)和 generalized arterial calcification of infancy(GACI),这些疾病主要表现为异常的钙化和结缔组织病变。由于ABCC6P1不产生功能性蛋白,其过表达或降低表达对机体的直接影响尚不明确,但理论上可能通过调控ABCC6的表达间接影响相关疾病进程。ABC基因家族成员通常具有共同的结构特征,包括核苷酸结合域(NBD)和跨膜域(TMD),这些结构域协同工作完成底物转运。ABCC6P1作为这个大家族的一员,保留了部分这些特征但已失去功能。研究假基因如ABCC6P1有助于理解基因组的进化和复杂疾病的遗传基础。

None

ABCC6P1基因的碱基序列:[NCBI]
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ABCC6P1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2078081       rs2238468       rs2606922       rs3021042       rs3853814       rs3905700       rs3905701       rs3953982       rs4013179       rs4780612       rs4781649       rs4781650       rs4781739       rs6498781       rs6498782       rs6498783       rs6498784      

ABCC6P1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TACCTCCTCTTCATCCACCA
60
GAATCCAAGCACCATCTTGG
59
CTACCTCCTCTTCATCCACC
59
AATCCAAGCACCATCTTGG
58
ACTTAGCGACAGACAGACG
60
CTCTGTCTGGTTCCAGACC
59
ATCTACCTCCTCTTCATCCA
57
TTTGGTTTCTCATCTTGGCT
58
ACTTAGCGACAGACAGACG
60
CTGTTCTCAGGAAGCACAG
58
TACCTCCTCTTCATCCACCA
60
GAATCCAAGCACCATCTTGG
59
CTACCTCCTCTTCATCCACC
59
AATCCAAGCACCATCTTGG
58
TCTACCTCCTCTTCATCCAC
58
TTTGGTTTCTCATCTTGGCT
58
TACCTCCTCTTCATCCACC
58
AATCCAAGCACCATCTTGG
58
CTACCTCCTCTTCATCCACC
59
AATCCAAGCACCATCTTGG
58
      尚未收录相关数据

ABCC6P1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ABCC6P1基因的本体(GO)信息:

可能调控 ABCC6P1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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